MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 chromosome

Total Repeats: 1942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017646	CAGA	2	8	155	162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017646	GGCG	2	8	7972	7979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017646	CTGT	2	8	9125	9132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017646	GAAT	2	8	10401	10408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017646	TCAT	2	8	11794	11801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017646	AGTG	2	8	11938	11945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017646	GACA	2	8	15568	15575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017646	AATC	2	8	15665	15672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017646	AATG	2	8	16029	16036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017646	TAAT	2	8	19727	19734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017646	TGTT	2	8	23492	23499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017646	GTTA	2	8	23577	23584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017646	TGGC	2	8	23953	23960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017646	GAAC	2	8	24586	24593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017646	TGAG	2	8	24842	24849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017646	TAAA	2	8	24993	25000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017646	TTAA	2	8	26837	26844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017646	ATAA	2	8	28645	28652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017646	CATA	2	8	29642	29649	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017646	TCAT	2	8	36414	36421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017646	TCCC	2	8	36444	36451	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_017646	TGGC	2	8	36485	36492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017646	AGTG	2	8	37804	37811	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017646	CCAG	2	8	42952	42959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017646	GGGC	2	8	46070	46077	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017646	CTGA	2	8	46092	46099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017646	ATTT	2	8	50170	50177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017646	GTTT	2	8	50187	50194	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017646	TGTT	2	8	54567	54574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017646	TGTT	2	8	54757	54764	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017646	CTGG	2	8	55022	55029	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017646	CTAA	2	8	57875	57882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017646	TCCA	2	8	77271	77278	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017646	TTAT	2	8	78490	78497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017646	GGCA	2	8	78712	78719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017646	ATTC	2	8	78860	78867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017646	ATTC	2	8	85606	85613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017646	ATTA	2	8	92873	92880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017646	ATTA	2	8	94207	94214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017646	TCTG	2	8	94347	94354	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017646	AGGC	2	8	94416	94423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017646	AACA	2	8	98053	98060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017646	TTGG	2	8	126244	126251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017646	CCGC	2	8	126395	126402	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_017646	GAAT	2	8	130469	130476	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017646	TCAA	2	8	130660	130667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017646	GATA	2	8	131675	131682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017646	GTAA	2	8	136262	136269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017646	CGGC	2	8	136284	136291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017646	GCGA	2	8	145520	145527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017646	AATT	2	8	149669	149676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017646	GAAT	2	8	149734	149741	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017646	ATAA	2	8	158334	158341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017646	GGTA	2	8	158439	158446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017646	TCAA	2	8	158669	158676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017646	AGTG	2	8	158707	158714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017646	GGTT	2	8	160235	160242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017646	AATA	2	8	160596	160603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017646	GCTG	2	8	160749	160756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017646	GTTT	2	8	161038	161045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017646	TTAA	2	8	166271	166278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017646	ATTC	2	8	166327	166334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017646	TTAG	2	8	167166	167173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017646	ATAA	2	8	167303	167310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017646	TTAC	2	8	170829	170836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017646	CTTT	2	8	177292	177299	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017646	GGAT	2	8	194058	194065	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017646	GAAA	2	8	200815	200822	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017646	ATAA	2	8	201562	201569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017646	AGTT	2	8	206727	206734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017646	AAGG	2	8	218480	218487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017646	ATCA	2	8	232662	232669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017646	CCGG	2	8	234822	234829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017646	GTAG	2	8	235121	235128	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017646	TAAA	2	8	235505	235512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017646	CTGA	2	8	236101	236108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017646	GTAC	2	8	236185	236192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017646	CGTC	2	8	236625	236632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017646	AAAG	2	8	236748	236755	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017646	GCTG	2	8	237426	237433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017646	CCTG	2	8	238860	238867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017646	CCGT	2	8	238895	238902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017646	ATTT	2	8	240823	240830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017646	CCTG	2	8	247084	247091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017646	CCGT	2	8	247119	247126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017646	AATC	2	8	251989	251996	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017646	TATT	2	8	254236	254243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017646	CGCC	2	8	260030	260037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_017646	AGTA	2	8	264248	264255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017646	CGTT	2	8	267313	267320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017646	CTGA	2	8	270003	270010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017646	CGCA	2	8	270152	270159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017646	AGGA	2	8	271429	271436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017646	AAAC	2	8	271765	271772	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017646	AATT	2	8	272628	272635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017646	CGAT	2	8	272741	272748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017646	CATG	2	8	272951	272958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017646	AACT	2	8	279519	279526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017646	TGAT	2	8	281733	281740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017646	TGAT	2	8	281818	281825	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017646	TTAC	2	8	281865	281872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017646	AAAT	2	8	281947	281954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017646	AGTC	2	8	282193	282200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017646	TTTA	2	8	283735	283742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017646	TGAA	2	8	288017	288024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017646	ATAA	2	8	289254	289261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017646	TGGC	2	8	289963	289970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017646	CTGG	2	8	290115	290122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017646	CCTG	2	8	290198	290205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017646	GGCA	2	8	290473	290480	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017646	GGGC	2	8	290578	290585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017646	CAGG	2	8	290726	290733	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017646	CAGA	2	8	290801	290808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017646	TGCT	2	8	290883	290890	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017646	GTCT	2	8	291091	291098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017646	AGCC	2	8	291316	291323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017646	GTGC	2	8	291437	291444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017646	CAGC	2	8	292073	292080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017646	ATTA	2	8	298410	298417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017646	TAAA	2	8	299452	299459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017646	TAAA	2	8	299483	299490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017646	GAAA	2	8	299673	299680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017646	ATTG	2	8	307457	307464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017646	ATTG	2	8	309888	309895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017646	CTAT	2	8	309935	309942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017646	GAGC	2	8	310289	310296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017646	AGAT	2	8	312571	312578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017646	CTCC	2	8	326914	326921	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_017646	GTTA	2	8	326941	326948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017646	CTGA	2	8	329261	329268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017646	GTGG	2	8	329294	329301	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017646	GTTG	2	8	332432	332439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017646	AGCG	2	8	339957	339964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017646	AGAC	2	8	341056	341063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017646	ATTT	2	8	343492	343499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017646	ATTG	2	8	344178	344185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017646	TGAG	2	8	348656	348663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017646	GCGG	2	8	361811	361818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017646	TATT	2	8	365057	365064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017646	AATT	2	8	365287	365294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017646	TTGA	2	8	365360	365367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017646	AATG	2	8	365590	365597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017646	CAGC	2	8	367628	367635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017646	TTTA	2	8	370153	370160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017646	TGAA	2	8	375304	375311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017646	CAAA	2	8	380266	380273	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017646	CAGC	2	8	387114	387121	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017646	TATT	2	8	396006	396013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017646	AGCC	2	8	398100	398107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_017646	TGGT	2	8	398222	398229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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