MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017645	GGT	2	6	67	72	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017645	AAT	2	6	251	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017645	CCA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017645	AGA	2	6	2304	2309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017645	ACG	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017645	TGC	2	6	2504	2509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017645	TTG	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017645	GTG	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017645	GTT	2	6	4868	4873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017645	TAT	2	6	4888	4893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017645	GGT	2	6	4975	4980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017645	GCT	2	6	5014	5019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017645	ATC	2	6	5028	5033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017645	AAG	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017645	TGG	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017645	AGG	2	6	6855	6860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017645	GAA	2	6	12194	12199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017645	TGG	2	6	12208	12213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017645	CTA	2	6	12249	12254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017645	AGG	2	6	13265	13270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017645	CGG	2	6	15468	15473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017645	GGC	2	6	18950	18955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017645	ATG	2	6	19002	19007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017645	GAT	2	6	19070	19075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017645	GAT	2	6	19873	19878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017645	CAC	2	6	19887	19892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017645	GAT	2	6	19937	19942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017645	GCA	2	6	20074	20079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017645	ATA	2	6	20092	20097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017645	CCT	2	6	20098	20103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017645	AAT	2	6	20120	20125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017645	AAT	2	6	20252	20257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017645	GGT	2	6	20356	20361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017645	ATC	2	6	20371	20376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017645	GAC	2	6	22487	22492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017645	TCA	2	6	22503	22508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017645	GAG	2	6	22511	22516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017645	CGG	2	6	22537	22542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017645	GCC	2	6	22558	22563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017645	TTG	2	6	22742	22747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017645	CAG	2	6	25409	25414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017645	CAA	2	6	25427	25432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017645	TTG	3	9	25439	25447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017645	CGA	2	6	26745	26750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017645	GGC	2	6	27199	27204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017645	CAG	2	6	29333	29338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017645	ACA	2	6	29349	29354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017645	AGC	2	6	29389	29394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017645	GGC	2	6	29459	29464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017645	CTG	2	6	29477	29482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017645	GGC	2	6	29558	29563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017645	TGC	2	6	29707	29712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017645	TAA	4	12	32405	32416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017645	GGT	2	6	33143	33148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017645	AGG	2	6	35159	35164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017645	AGC	2	6	35487	35492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017645	CGG	2	6	35517	35522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017645	GAA	2	6	36209	36214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017645	CCG	2	6	36217	36222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017645	CGC	2	6	36352	36357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017645	GCA	2	6	36393	36398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017645	TGT	2	6	36426	36431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017645	ATT	2	6	36477	36482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017645	CAT	2	6	36487	36492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017645	ATA	2	6	36496	36501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017645	ATG	2	6	36703	36708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017645	AGC	2	6	45411	45416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017645	CCT	2	6	45557	45562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017645	TAA	2	6	45573	45578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017645	CGA	2	6	46373	46378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017645	ATC	2	6	53990	53995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017645	TGA	2	6	54081	54086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017645	GTT	2	6	54205	54210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017645	GGC	2	6	54652	54657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017645	GCC	2	6	54662	54667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017645	AGA	2	6	54760	54765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017645	GGT	2	6	55124	55129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017645	CTG	2	6	55148	55153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017645	ATA	2	6	59110	59115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017645	TAA	2	6	59149	59154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017645	CAA	2	6	59274	59279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017645	ATC	2	6	60407	60412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017645	TTA	2	6	60452	60457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017645	GCA	2	6	60467	60472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017645	GGT	2	6	60509	60514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017645	AAT	2	6	60519	60524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017645	TTC	2	6	60552	60557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017645	TAA	2	6	60580	60585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017645	CTG	2	6	60619	60624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017645	CCT	2	6	61895	61900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017645	TGT	2	6	61919	61924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017645	GCG	2	6	62965	62970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017645	ATG	2	6	63005	63010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017645	TCT	2	6	76158	76163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017645	ATA	2	6	79935	79940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017645	ATC	2	6	80795	80800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017645	CAT	2	6	81362	81367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017645	ATC	2	6	81378	81383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017645	CTG	2	6	81397	81402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017645	CTG	2	6	81452	81457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017645	TCT	2	6	81526	81531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017645	GAC	2	6	81548	81553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017645	ACG	2	6	81597	81602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017645	CAT	2	6	81613	81618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017645	ACG	2	6	81732	81737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017645	CTC	2	6	81787	81792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017645	TCT	2	6	81805	81810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017645	GTG	2	6	81949	81954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017645	CCT	2	6	85580	85585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017645	GTG	2	6	86784	86789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017645	GAG	2	6	90448	90453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017645	TCA	2	6	92764	92769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017645	ACA	2	6	92770	92775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017645	CAA	2	6	92812	92817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017645	AAG	2	6	92952	92957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017645	TGC	2	6	92972	92977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017645	GGA	2	6	93021	93026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017645	CTC	2	6	93046	93051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017645	GAG	2	6	93062	93067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017645	TCC	2	6	94219	94224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017645	TGG	2	6	95016	95021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017645	CTA	2	6	95399	95404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017645	GTG	2	6	95439	95444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017645	CCT	2	6	98784	98789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017645	AGG	2	6	99293	99298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017645	CCT	2	6	101762	101767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017645	GGA	2	6	101911	101916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017645	CCT	2	6	101921	101926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017645	TGG	2	6	101983	101988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017645	CAA	2	6	101991	101996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017645	TTG	2	6	102085	102090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017645	ATC	2	6	102106	102111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017645	AGC	2	6	102142	102147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017645	CAT	2	6	103359	103364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017645	GTG	2	6	103376	103381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017645	TCT	2	6	104925	104930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017645	TTA	2	6	105031	105036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017645	CTG	2	6	105058	105063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017645	GGT	2	6	105134	105139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017645	TCC	2	6	105205	105210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.