MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli NA114 chromosome

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017644	ATTGTT	2	12	141339	141350	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017644	TATGAA	2	12	146456	146467	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017644	ATTTAA	2	12	147216	147227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017644	GTAGTG	2	12	193490	193501	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017644	CTTTTC	2	12	237979	237990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017644	TTTTCT	2	12	324097	324108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017644	CTATTT	2	12	325134	325145	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017644	GTCACT	2	12	328606	328617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017644	AATTTC	2	12	331802	331813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017644	TGTCTG	2	12	340349	340360	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017644	TTTATT	2	12	352034	352045	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017644	CAATAT	2	12	387543	387554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017644	AACAAT	2	12	402711	402722	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017644	TATTGA	2	12	405557	405568	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017644	CAGGCG	2	12	486378	486389	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017644	TGCAAA	2	12	579381	579392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017644	ATTTTT	2	12	677362	677373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017644	AAGTGA	2	12	725976	725987	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017644	TTTTCT	2	12	754908	754919	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017644	CAGAAA	2	12	792402	792413	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017644	AAAAAC	2	12	813588	813599	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017644	TAACCG	2	12	885076	885087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017644	AAATAA	2	12	984530	984541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017644	GTTTTT	2	12	1017668	1017679	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017644	CTGGAA	2	12	1030691	1030702	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017644	TAAGGA	2	12	1088947	1088958	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017644	ATAATG	2	12	1090362	1090373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017644	TGGTAA	2	12	1114045	1114056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017644	TGTTAA	2	12	1122595	1122606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017644	TGCTCT	2	12	1142053	1142064	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017644	CAAAAA	2	12	1158664	1158675	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017644	TTTCTG	2	12	1246179	1246190	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017644	CTGACG	2	12	1264435	1264446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017644	TTATCC	2	12	1270279	1270290	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017644	CTTTTT	2	12	1277792	1277803	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017644	GGCCGG	2	12	1284523	1284534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017644	AAAATG	2	12	1315992	1316003	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017644	CCATTG	2	12	1362059	1362070	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017644	CTTATT	2	12	1413680	1413691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017644	GATCAA	2	12	1419757	1419768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017644	CAAAAG	2	12	1420731	1420742	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017644	CTGATC	2	12	1431185	1431196	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017644	ATGGAA	2	12	1444795	1444806	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017644	TATAAC	2	12	1496715	1496726	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017644	TAAATT	2	12	1541266	1541277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017644	CAAAAA	2	12	1631533	1631544	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017644	ATACTT	2	12	1717338	1717349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017644	AAAATA	2	12	1731000	1731011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017644	TGTTTT	2	12	1731633	1731644	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017644	AAGACT	2	12	1731893	1731904	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017644	TATTAC	2	12	1845124	1845135	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017644	TTTCTT	2	12	1857577	1857588	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017644	ACTGTC	2	12	1904160	1904171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017644	AATTCA	2	12	1965476	1965487	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017644	ACCGGA	2	12	1991012	1991023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017644	GCATTG	2	12	1992593	1992604	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017644	TCTTAT	2	12	2005279	2005290	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017644	GTGTAT	2	12	2008291	2008302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017644	CTGATA	2	12	2073324	2073335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017644	CGCGTG	2	12	2090774	2090785	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017644	GAAAAC	2	12	2105543	2105554	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017644	GCATGA	2	12	2112681	2112692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017644	TCCGCC	2	12	2127972	2127983	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017644	TTTTGT	2	12	2145813	2145824	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017644	GCTTCG	2	12	2189931	2189942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017644	CCTGTT	2	12	2236569	2236580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017644	TCTTCC	2	12	2283556	2283567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017644	TAAATG	2	12	2418132	2418143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017644	TGTCAC	2	12	2431766	2431777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017644	AGCGGA	2	12	2433927	2433938	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017644	AGAAAA	2	12	2441070	2441081	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017644	CTGATG	2	12	2501883	2501894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017644	GTTATG	2	12	2519725	2519736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017644	TCGATA	2	12	2530350	2530361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017644	CAAGTG	2	12	2536706	2536717	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017644	ATGGAA	2	12	2588098	2588109	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017644	GATGGA	2	12	2597642	2597653	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017644	TCCTTC	2	12	2646834	2646845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017644	TGAGCG	2	12	2681196	2681207	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017644	TGGACA	2	12	2691206	2691217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017644	CAGTTT	2	12	2705811	2705822	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017644	GGAGAA	2	12	2788407	2788418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017644	TTTGTT	2	12	2912774	2912785	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017644	GTAAGG	2	12	3041129	3041140	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017644	ATTCCG	2	12	3102012	3102023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017644	TTTTCG	2	12	3138506	3138517	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017644	AGTTGT	2	12	3243842	3243853	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017644	CTTTTT	2	12	3248518	3248529	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017644	AATGAT	2	12	3249353	3249364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017644	TCTCCC	2	12	3272162	3272173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017644	TGCATT	2	12	3297397	3297408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017644	TTTTAT	2	12	3299294	3299305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017644	AAGCGA	2	12	3304693	3304704	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017644	CTTTCT	2	12	3328528	3328539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017644	ACAGAA	2	12	3352052	3352063	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017644	AGCGTT	2	12	3433792	3433803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017644	TTTATA	2	12	3450454	3450465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017644	CCTTTC	2	12	3453805	3453816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017644	ATTACG	2	12	3546232	3546243	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017644	AATTTA	2	12	3604089	3604100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017644	AGATGC	2	12	3703093	3703104	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017644	ACCGTT	2	12	3751191	3751202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017644	TGAAAA	2	12	3754522	3754533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017644	TTTGCC	2	12	3791436	3791447	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017644	CTGAAG	2	12	3795969	3795980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017644	CTTTTT	2	12	4019851	4019862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017644	AAATGG	2	12	4091438	4091449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017644	TGCATC	2	12	4146162	4146173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017644	TAACCA	2	12	4318932	4318943	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017644	ATTTAT	2	12	4367672	4367683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017644	GTCTTT	2	12	4376482	4376493	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017644	AATATC	2	12	4408615	4408626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017644	CTGATA	2	12	4444307	4444318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017644	TTGTTC	2	12	4476927	4476938	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017644	ATATAG	2	12	4477033	4477044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017644	AATGAG	2	12	4477473	4477484	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017644	TTTTTA	2	12	4539399	4539410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017644	TTTAAT	2	12	4571274	4571285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017644	TTTCAC	2	12	4627001	4627012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017644	AATAAA	2	12	4632379	4632390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017644	ATCAGT	2	12	4655505	4655516	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017644	TAAATA	2	12	4665346	4665357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017644	TAATGA	2	12	4694276	4694287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017644	ACCATC	5	30	4696165	4696194	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017644	AACAGG	2	12	4708132	4708143	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017644	TTTTCA	2	12	4748639	4748650	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017644	GATCGC	2	12	4752286	4752297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017644	AATGAT	2	12	4758286	4758297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017644	GAAAAT	2	12	4804032	4804043	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017644	TCAGCA	2	12	4837266	4837277	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017644	ATTTGT	2	12	4865159	4865170	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017644	GTTTCA	2	12	4896451	4896462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017644	TATAAA	2	12	4897044	4897055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017644	TATGGG	2	12	4911990	4912001	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017644	AAAAAC	2	12	4914379	4914390	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017644	TGAATA	2	12	4919004	4919015	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017644	TAAAGG	2	12	4920453	4920464	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017644	AAAGCG	2	12	4945038	4945049	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017644	GCACCC	2	12	4947415	4947426	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017644	GCCACC	2	12	4959551	4959562	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.