MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017643	ATC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017643	CAG	2	6	92	97	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017643	AAC	2	6	212	217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017643	GCT	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017643	CAC	3	9	397	405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017643	TTC	2	6	545	550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017643	GCC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017643	GCT	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017643	TAA	2	6	1211	1216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017643	GCA	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017643	TAT	2	6	1333	1338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017643	GGC	2	6	1389	1394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017643	GCC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017643	GCC	2	6	1420	1425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017643	ATG	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017643	ACA	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017643	GAA	2	6	2290	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017643	GGC	2	6	2425	2430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017643	AAC	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017643	CGG	2	6	2728	2733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017643	CGG	2	6	3589	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017643	TGT	3	9	3696	3704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017643	TTC	2	6	3713	3718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017643	GCC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017643	ACA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017643	GGC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017643	AGG	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017643	ATT	2	6	5504	5509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017643	GCC	2	6	5533	5538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017643	GGT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017643	TTC	2	6	5695	5700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017643	CGC	2	6	5732	5737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017643	CAT	3	9	5761	5769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017643	TAC	2	6	6309	6314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017643	ATA	2	6	6803	6808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017643	TTG	2	6	6847	6852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017643	CAA	2	6	6876	6881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017643	AAG	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017643	GAA	2	6	7482	7487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017643	TGA	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017643	ACT	2	6	9427	9432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017643	CGA	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017643	TGG	2	6	9564	9569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017643	ACA	3	9	10030	10038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017643	CAG	2	6	10060	10065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017643	GCA	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017643	TAT	2	6	10156	10161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017643	TTA	2	6	10174	10179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017643	AAT	2	6	10218	10223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017643	GCA	2	6	10301	10306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017643	CGC	2	6	10404	10409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017643	CAG	2	6	10459	10464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017643	AAT	2	6	10467	10472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017643	ATA	2	6	10559	10564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017643	ATA	2	6	10698	10703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017643	TAT	2	6	10737	10742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017643	TGA	2	6	10766	10771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017643	ATG	2	6	10775	10780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017643	GCA	2	6	10888	10893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017643	GGT	2	6	10905	10910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017643	CAG	2	6	11038	11043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017643	GCT	2	6	11270	11275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017643	GTT	2	6	11442	11447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017643	TAA	2	6	11516	11521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017643	GAT	2	6	12146	12151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017643	AGA	2	6	15431	15436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017643	GGT	2	6	16013	16018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017643	AGC	2	6	20674	20679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017643	TAC	2	6	20837	20842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017643	CGC	2	6	20857	20862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017643	GCA	2	6	20910	20915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017643	GAT	2	6	20920	20925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017643	GTC	2	6	20933	20938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017643	TGA	2	6	20949	20954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017643	TCC	2	6	21169	21174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017643	CGA	2	6	21313	21318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017643	GGT	2	6	22711	22716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017643	GTG	2	6	22791	22796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017643	CGT	2	6	22809	22814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017643	AGT	2	6	22825	22830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017643	TGG	2	6	23450	23455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017643	GAA	2	6	23522	23527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017643	ACT	2	6	23550	23555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017643	GCA	2	6	32290	32295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017643	GGC	2	6	32316	32321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017643	TGC	2	6	32335	32340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017643	GGA	2	6	32477	32482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017643	GTG	2	6	42331	42336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017643	CAA	2	6	42339	42344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017643	CCG	2	6	42353	42358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017643	TAA	2	6	45001	45006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017643	GAT	2	6	45008	45013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017643	TAT	2	6	45071	45076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017643	CTG	2	6	45082	45087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017643	TTC	2	6	45089	45094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017643	GGA	2	6	45166	45171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017643	GTT	2	6	45179	45184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017643	CAG	2	6	45940	45945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017643	TAA	2	6	46587	46592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017643	ACC	2	6	46632	46637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017643	AAT	2	6	46763	46768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017643	TTA	2	6	46915	46920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017643	AGA	2	6	47081	47086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017643	TCT	2	6	47128	47133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017643	AGA	2	6	47155	47160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017643	GAA	2	6	47283	47288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017643	TCG	2	6	48328	48333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017643	ACC	2	6	48388	48393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017643	GTC	2	6	48440	48445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017643	CGT	2	6	48458	48463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017643	GTT	2	6	48567	48572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017643	GCG	2	6	48687	48692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017643	CCA	2	6	48731	48736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017643	GCC	3	9	48746	48754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017643	AAC	2	6	48772	48777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017643	ATG	2	6	48788	48793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017643	TGT	2	6	48796	48801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017643	ATC	2	6	48810	48815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017643	TCT	2	6	48827	48832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017643	TCG	2	6	48915	48920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017643	CGG	2	6	49035	49040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017643	CAA	2	6	49061	49066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017643	GCC	2	6	49073	49078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017643	GTA	2	6	49144	49149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017643	ATT	2	6	49488	49493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017643	TTA	2	6	49494	49499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017643	TAT	2	6	49585	49590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017643	AAT	2	6	49764	49769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017643	GTG	2	6	49986	49991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017643	CAT	2	6	49993	49998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017643	AGA	2	6	50102	50107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017643	TAA	3	9	50263	50271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017643	ATT	2	6	50309	50314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017643	TTA	2	6	50350	50355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017643	TAA	2	6	50374	50379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017643	GAA	2	6	50421	50426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017643	AGA	2	6	56293	56298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017643	CAG	2	6	58012	58017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017643	CAC	2	6	58132	58137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_017643	GCG	2	6	58176	58181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017643	TTG	2	6	58293	58298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017643	GCC	2	6	58363	58368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017643	ATG	2	6	58377	58382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017643	GAT	2	6	58619	58624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017643	TAC	2	6	58658	58663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_017643	TCA	2	6	60455	60460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.