MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_Hly

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017643	ATC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017643	CAG	2	6	92	97	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017643	AAC	2	6	212	217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017643	GCT	2	6	344	349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017643	CAC	3	9	397	405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017643	CCGG	2	8	427	434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017643	G	6	6	496	501	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017643	TTC	2	6	545	550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017643	GCC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017643	GCT	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017643	TAA	2	6	1211	1216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017643	CCGG	2	8	1251	1258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017643	GCA	2	6	1271	1276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017643	TAT	2	6	1333	1338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017643	GGC	2	6	1389	1394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017643	GCC	2	6	1400	1405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017643	GCC	2	6	1420	1425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017643	AGGGA	2	10	1869	1878	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017643	ATG	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017643	ACA	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017643	GAA	2	6	2290	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017643	GT	4	8	2329	2336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017643	GT	3	6	2342	2347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017643	AG	3	6	2417	2422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017643	GGC	2	6	2425	2430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017643	GGCG	2	8	2468	2475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017643	AAC	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017643	AGGA	2	8	2611	2618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017643	TTCC	2	8	2622	2629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017643	GGGAAC	2	12	2630	2641	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017643	TC	3	6	2665	2670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017643	TGAA	2	8	2692	2699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017643	CGG	2	6	2728	2733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017643	CGG	2	6	3589	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017643	GCCT	2	8	3597	3604	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017643	CG	3	6	3612	3617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017643	A	6	6	3618	3623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017643	T	6	6	3653	3658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017643	TGT	3	9	3696	3704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017643	TTC	2	6	3713	3718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017643	GCC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017643	ACA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017643	GGC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017643	AGG	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017643	ATT	2	6	5504	5509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017643	GC	3	6	5510	5515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017643	GCC	2	6	5533	5538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017643	GGT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017643	T	6	6	5653	5658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017643	TTC	2	6	5695	5700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017643	CGC	2	6	5732	5737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017643	CAT	3	9	5761	5769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017643	GT	3	6	6205	6210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017643	TAC	2	6	6309	6314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017643	ATA	2	6	6803	6808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017643	TTG	2	6	6847	6852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017643	CAA	2	6	6876	6881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017643	GACAC	2	10	6924	6933	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017643	GTGATT	2	12	7305	7316	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017643	A	6	6	7324	7329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017643	AAG	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017643	GTCC	2	8	7428	7435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017643	CG	3	6	7444	7449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017643	GAA	2	6	7482	7487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017643	TGA	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017643	ACT	2	6	9427	9432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017643	CGA	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017643	TGG	2	6	9564	9569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017643	ACA	3	9	10030	10038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017643	CAG	2	6	10060	10065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017643	GCA	2	6	10084	10089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017643	GGTT	2	8	10125	10132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017643	A	6	6	10137	10142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017643	TAT	2	6	10156	10161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017643	TTA	2	6	10174	10179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017643	AAT	2	6	10218	10223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017643	GCA	2	6	10301	10306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017643	T	6	6	10324	10329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017643	CGC	2	6	10404	10409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017643	CAG	2	6	10459	10464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017643	AAT	2	6	10467	10472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017643	ATA	2	6	10559	10564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017643	CAGC	2	8	10671	10678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017643	ATA	2	6	10698	10703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017643	T	6	6	10726	10731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017643	TAT	2	6	10737	10742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017643	TGA	2	6	10766	10771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017643	ATG	2	6	10775	10780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017643	GCA	2	6	10888	10893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017643	GGT	2	6	10905	10910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017643	ATCC	2	8	10944	10951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017643	TGGT	2	8	10987	10994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017643	GT	3	6	10993	10998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017643	CAG	2	6	11038	11043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017643	ACTG	2	8	11052	11059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017643	A	6	6	11213	11218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017643	GCT	2	6	11270	11275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017643	T	6	6	11288	11293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017643	GTT	2	6	11442	11447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017643	AT	5	10	11500	11509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017643	TAA	2	6	11516	11521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017643	GAT	2	6	12146	12151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017643	AGA	2	6	15431	15436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017643	GA	3	6	15456	15461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017643	GGT	2	6	16013	16018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017643	GT	3	6	16029	16034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017643	AACA	2	8	20576	20583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017643	GAAA	2	8	20615	20622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017643	AGC	2	6	20674	20679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017643	GAAT	2	8	20706	20713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017643	GCTTT	2	10	20738	20747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017643	AGGGT	2	10	20767	20776	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017643	TAC	2	6	20837	20842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017643	CGC	2	6	20857	20862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017643	CA	3	6	20895	20900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017643	GCA	2	6	20910	20915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017643	GAT	2	6	20920	20925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017643	GTC	2	6	20933	20938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017643	TGA	2	6	20949	20954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017643	T	7	7	21141	21147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017643	TCC	2	6	21169	21174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017643	CAAT	2	8	21230	21237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017643	AT	3	6	21257	21262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017643	CGA	2	6	21313	21318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017643	TA	3	6	22000	22005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017643	GA	4	8	22439	22446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017643	CTTT	2	8	22602	22609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017643	GGT	2	6	22711	22716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017643	AGAA	2	8	22724	22731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017643	GTG	2	6	22791	22796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017643	CGT	2	6	22809	22814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017643	AGT	2	6	22825	22830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017643	CACG	2	8	22841	22848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017643	T	6	6	22994	22999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017643	A	6	6	23431	23436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017643	TGG	2	6	23450	23455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017643	GAA	2	6	23522	23527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017643	TA	3	6	23531	23536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017643	A	6	6	23540	23545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017643	ACT	2	6	23550	23555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017643	GCA	2	6	32290	32295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017643	GGC	2	6	32316	32321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017643	TGC	2	6	32335	32340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017643	GGA	2	6	32477	32482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017643	GTG	2	6	42331	42336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017643	CAA	2	6	42339	42344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017643	CCG	2	6	42353	42358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_017643	AC	3	6	42378	42383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017643	CT	3	6	44939	44944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017643	TAA	2	6	45001	45006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017643	GAT	2	6	45008	45013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017643	AT	3	6	45057	45062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017643	TAT	2	6	45071	45076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017643	CTG	2	6	45082	45087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017643	TTC	2	6	45089	45094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017643	T	6	6	45121	45126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017643	GGA	2	6	45166	45171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017643	GTT	2	6	45179	45184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017643	AG	3	6	45218	45223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017643	CAG	2	6	45940	45945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017643	A	7	7	45968	45974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017643	CT	3	6	46556	46561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_017643	TAA	2	6	46587	46592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017643	ACC	2	6	46632	46637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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166	NC_017643	CGAT	2	8	46698	46705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_017643	ATTT	2	8	46722	46729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017643	AAT	2	6	46763	46768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017643	TTA	2	6	46915	46920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017643	AG	3	6	46948	46953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017643	A	6	6	46966	46971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017643	GAAA	2	8	46972	46979	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017643	GA	3	6	47053	47058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017643	AGA	2	6	47081	47086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_017643	TCG	2	6	48328	48333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_017643	TCCG	2	8	48363	48370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
182	NC_017643	ACC	2	6	48388	48393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_017643	TC	3	6	48430	48435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_017643	GTC	2	6	48440	48445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_017643	CGT	2	6	48458	48463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_017643	GTT	2	6	48567	48572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017643	TCG	2	6	48915	48920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_017643	CT	3	6	48946	48951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
198	NC_017643	GGTGA	2	10	48991	49000	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017643	ATCA	2	8	49006	49013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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241	NC_017643	TA	3	6	58511	58516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_017643	CAAT	2	8	58554	58561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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250	NC_017643	TGG	2	6	60530	60535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_017643	GTT	2	6	60641	60646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_017643	TTTA	2	8	60770	60777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017643	T	6	6	62231	62236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017643	CTC	2	6	62263	62268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_017643	ACGGG	2	10	62340	62349	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
262	NC_017643	CTGG	2	8	62364	62371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
263	NC_017643	TGA	2	6	62409	62414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_017643	CGC	2	6	63947	63952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_017643	GCGG	2	8	63955	63962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
268	NC_017643	TGC	2	6	64648	64653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_017643	CCGTC	2	10	64668	64677	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
270	NC_017643	GTT	2	6	64707	64712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017643	GCA	2	6	64735	64740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_017643	TCA	2	6	65505	65510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.