MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88_91

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017642	TTA	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017642	GAG	2	6	84	89	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017642	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017642	GCG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017642	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017642	ACG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017642	ATC	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017642	TCA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017642	CGT	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017642	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017642	CGC	2	6	1758	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017642	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017642	GCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017642	GCC	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017642	AAC	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017642	TGT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017642	CGT	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017642	TTA	2	6	2541	2546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017642	TAA	2	6	3752	3757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017642	TAA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017642	TGT	2	6	3926	3931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017642	AGA	3	9	3970	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017642	TGT	2	6	5467	5472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017642	TGC	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017642	CAG	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017642	ATC	2	6	5588	5593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017642	TAA	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017642	CAT	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017642	ACA	2	6	7986	7991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017642	ATA	3	9	8005	8013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017642	CAT	2	6	8043	8048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017642	AGA	2	6	9139	9144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017642	GTT	2	6	9241	9246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017642	ATA	2	6	9356	9361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017642	ATC	2	6	9376	9381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017642	ATG	2	6	9383	9388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017642	TAT	2	6	9424	9429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017642	CGG	2	6	9470	9475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017642	TCT	3	9	9483	9491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017642	GCT	2	6	9543	9548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017642	TGT	2	6	9561	9566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017642	ATG	2	6	9616	9621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017642	TTA	2	6	9725	9730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017642	TGA	2	6	9740	9745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017642	AAT	2	6	9760	9765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017642	TAA	2	6	9797	9802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017642	ACC	2	6	9850	9855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017642	CTT	2	6	9907	9912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017642	TTC	2	6	12963	12968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017642	ATG	2	6	13082	13087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017642	TAA	2	6	16713	16718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017642	ATT	2	6	16744	16749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017642	CTG	2	6	16793	16798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017642	CTG	2	6	16803	16808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017642	CCT	2	6	16926	16931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017642	TCG	2	6	16946	16951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017642	TCC	3	9	16953	16961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017642	CAC	2	6	18218	18223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017642	AGC	2	6	19042	19047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017642	CCT	2	6	19115	19120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017642	CGC	2	6	19627	19632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017642	GCG	2	6	19639	19644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017642	GGC	2	6	21297	21302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017642	GGC	2	6	21389	21394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017642	GCC	2	6	21398	21403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017642	CGT	2	6	21906	21911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017642	AGG	2	6	22715	22720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017642	CTC	2	6	22729	22734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017642	GCA	2	6	25674	25679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017642	GCC	2	6	26860	26865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017642	GGA	2	6	26891	26896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017642	ATT	2	6	26928	26933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017642	CGG	2	6	29113	29118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017642	GCC	2	6	29135	29140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017642	AGG	2	6	29177	29182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017642	GCG	2	6	29192	29197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017642	TGT	2	6	29249	29254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017642	GGC	2	6	29298	29303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017642	GTC	2	6	29309	29314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017642	GCT	2	6	29335	29340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017642	CCG	2	6	29358	29363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017642	CGC	2	6	29441	29446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017642	CCG	2	6	29530	29535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017642	CAG	2	6	29599	29604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017642	GTG	2	6	29693	29698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017642	GAA	2	6	29741	29746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017642	CAG	2	6	29809	29814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017642	CCG	2	6	30296	30301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017642	GGC	2	6	30649	30654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017642	AGG	2	6	30678	30683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017642	AAG	2	6	30694	30699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017642	CGC	2	6	30719	30724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017642	ATG	2	6	30725	30730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017642	CGG	2	6	30794	30799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017642	TTG	2	6	30851	30856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017642	ACC	2	6	30904	30909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017642	CAG	2	6	31669	31674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017642	CGA	2	6	31726	31731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017642	CGA	2	6	31738	31743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017642	AAG	2	6	31752	31757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017642	AGC	2	6	31792	31797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017642	AGG	2	6	31839	31844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017642	GAA	2	6	31862	31867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017642	TGA	2	6	31885	31890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017642	TGA	2	6	31972	31977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017642	GCA	2	6	32008	32013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017642	TCC	2	6	32041	32046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017642	GAA	2	6	32266	32271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017642	GTG	2	6	32331	32336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017642	ACC	2	6	32345	32350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017642	CTC	2	6	32702	32707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017642	GAG	2	6	32745	32750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017642	ATC	2	6	33655	33660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017642	ATC	2	6	34067	34072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017642	ATG	2	6	34126	34131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017642	GCA	2	6	34406	34411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017642	GAT	2	6	34439	34444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017642	TTG	2	6	34539	34544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017642	TTG	2	6	42025	42030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017642	CGG	2	6	42376	42381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017642	GCC	2	6	42392	42397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017642	TTG	2	6	42401	42406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017642	TCT	2	6	42432	42437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017642	TCT	2	6	42631	42636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017642	AGA	2	6	42746	42751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017642	TGA	2	6	42894	42899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017642	ACC	2	6	42996	43001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017642	TTG	2	6	43007	43012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017642	GTC	2	6	43025	43030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017642	ACA	2	6	43132	43137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017642	TAG	2	6	43141	43146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017642	TCC	2	6	43157	43162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017642	AAG	2	6	43202	43207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017642	TAA	2	6	43208	43213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017642	TGA	2	6	43230	43235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017642	TGG	2	6	43267	43272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017642	GGA	2	6	43281	43286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017642	AAC	2	6	46048	46053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017642	TGA	2	6	46101	46106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017642	TGG	2	6	46145	46150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017642	ACA	2	6	46166	46171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017642	ATT	2	6	46627	46632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.