MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli DH1

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017638	GAAAAT	2	12	10614	10625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017638	TAAAAA	2	12	58378	58389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017638	ACGCGT	2	12	75581	75592	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017638	AAGGGA	2	12	84332	84343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017638	TCTCCC	2	12	164545	164556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017638	TCACCC	2	12	164596	164607	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017638	GTAGTG	2	12	200381	200392	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017638	TCTCCC	2	12	288468	288479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017638	GCAGAA	2	12	289684	289695	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017638	GTGCAG	2	12	297789	297800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017638	TTTTCT	2	12	320531	320542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017638	CTATTT	2	12	321567	321578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017638	TAAATT	2	12	344465	344476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017638	TTTATT	2	12	344574	344585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017638	TATTGA	2	12	385418	385429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017638	AACAAT	2	12	407691	407702	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017638	TATTGA	2	12	410537	410548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017638	TTTTCA	2	12	472902	472913	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017638	CAGGCG	2	12	491745	491756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017638	CTGTCA	2	12	570404	570415	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017638	TGCAAA	2	12	602913	602924	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017638	ATTTTT	2	12	698532	698543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017638	TTTTCT	2	12	783943	783954	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017638	AATATT	2	12	809752	809763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017638	CAGAAA	2	12	821983	821994	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017638	AGATAA	2	12	861990	862001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017638	TAACCG	2	12	911877	911888	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017638	AAATAA	2	12	943604	943615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017638	CTGGAA	2	12	953168	953179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017638	AAAGAT	2	12	976135	976146	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017638	TGTCCA	2	12	996768	996779	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017638	TAAGGA	2	12	1020372	1020383	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017638	ATAATG	2	12	1021786	1021797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017638	CGTAAA	2	12	1164104	1164115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017638	TTTTGT	2	12	1198159	1198170	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017638	ACGCTT	2	12	1218779	1218790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017638	ACTCGA	2	12	1218799	1218810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017638	CAGGCT	2	12	1218931	1218942	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017638	GAGGAA	2	12	1269294	1269305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017638	CTTATT	2	12	1271078	1271089	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017638	CAAAAG	2	12	1277974	1277985	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017638	TGTGCG	2	12	1283100	1283111	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017638	GGGGGT	2	12	1289723	1289734	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017638	CTGATC	2	12	1291981	1291992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017638	CTATAA	2	12	1338248	1338259	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017638	ATTTAA	2	12	1400686	1400697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017638	AAAAAC	2	12	1537943	1537954	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017638	TTCATA	2	12	1549534	1549545	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017638	ACCGTT	2	12	1552807	1552818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017638	TGGTTA	2	12	1561637	1561648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017638	CAAAAA	2	12	1611307	1611318	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017638	TAAATA	2	12	1613106	1613117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017638	TTTTTC	2	12	1614828	1614839	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017638	AAAAAC	2	12	1627206	1627217	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017638	ATACTT	2	12	1723316	1723327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017638	AAAATA	2	12	1738171	1738182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017638	TGTTTT	2	12	1738804	1738815	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017638	AAGACT	2	12	1739064	1739075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017638	TATTAC	2	12	1855292	1855303	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017638	TTTCTT	2	12	1873307	1873318	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017638	TCAGGG	2	12	1893258	1893269	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017638	ACTGTC	2	12	1922107	1922118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017638	TTAATG	2	12	1963321	1963332	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017638	AATTCA	2	12	1970446	1970457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017638	TCTTAT	2	12	1984264	1984275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017638	ATATTT	2	12	2017658	2017669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017638	ATTTTT	2	12	2041776	2041787	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017638	CTGATA	2	12	2052065	2052076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017638	TCCCCC	2	12	2137131	2137142	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_017638	CGATAC	2	12	2158123	2158134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017638	TCTTCC	2	12	2248831	2248842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017638	CCAGAC	2	12	2302783	2302794	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017638	CCACTA	2	12	2334507	2334518	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017638	TAAATG	2	12	2391782	2391793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017638	TGTCAC	2	12	2405416	2405427	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017638	AGAAAA	2	12	2415696	2415707	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017638	CTGATG	2	12	2479886	2479897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017638	GTTATG	2	12	2497726	2497737	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017638	CAAGTG	2	12	2516188	2516199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017638	TCCTTC	2	12	2617379	2617390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017638	TGGACA	2	12	2667467	2667478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017638	CAGTTT	2	12	2682054	2682065	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017638	GGTTTT	2	12	2743280	2743291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017638	TCTGAT	2	12	2792285	2792296	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017638	ATCTTA	2	12	2834750	2834761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017638	GGTTTT	2	12	2895936	2895947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017638	ACAAGA	2	12	2900267	2900278	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017638	TTTGTT	2	12	2925203	2925214	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017638	ATCGCG	2	12	3019061	3019072	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017638	GTAAGG	2	12	3034756	3034767	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017638	ACTGAG	2	12	3059745	3059756	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017638	ACGCAG	2	12	3099359	3099370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017638	TTTTCG	2	12	3106005	3106016	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017638	AGTTGT	2	12	3188935	3188946	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017638	CTTTTT	2	12	3193612	3193623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017638	AATGAT	2	12	3194447	3194458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017638	TCTCCC	2	12	3217502	3217513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017638	GTAACC	2	12	3243968	3243979	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017638	AGACAA	2	12	3245588	3245599	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017638	TGCATT	2	12	3254839	3254850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017638	TTTTAT	2	12	3256736	3256747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017638	ATATAA	2	12	3265199	3265210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017638	CTTTCT	2	12	3289084	3289095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017638	TTTTTA	2	12	3339862	3339873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017638	GGATTT	2	12	3343328	3343339	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017638	AGCGTT	2	12	3396266	3396277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017638	AATTTA	2	12	3524248	3524259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017638	GAAATA	2	12	3631554	3631565	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017638	AGATGC	2	12	3632444	3632455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017638	ATACCG	2	12	3641674	3641685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017638	TGAAAA	2	12	3647316	3647327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017638	TTTGCC	2	12	3683970	3683981	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017638	TTTATC	2	12	3754547	3754558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017638	GTTATT	2	12	3868313	3868324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017638	CTTTTT	2	12	3920444	3920455	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017638	AGGGAG	2	12	3938587	3938598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017638	GCGTAA	2	12	4039504	4039515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017638	GCTTTG	2	12	4062073	4062084	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017638	CCATGC	2	12	4062612	4062623	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017638	TTTGTT	2	12	4063224	4063235	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017638	GGGAGT	2	12	4064987	4064998	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017638	ATAAAA	2	12	4080651	4080662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017638	TTTTCT	2	12	4111546	4111557	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017638	TCATTT	2	12	4202763	4202774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017638	TAACCA	2	12	4215316	4215327	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017638	GTCTTT	2	12	4257071	4257082	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017638	AATATC	2	12	4283438	4283449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017638	GGGAGA	2	12	4293230	4293241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017638	CTGATA	2	12	4319696	4319707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017638	TTCAAT	2	12	4353543	4353554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017638	TTTTTA	2	12	4371891	4371902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017638	TTTAAT	2	12	4403840	4403851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017638	TTTCAC	2	12	4452496	4452507	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017638	AATAAA	2	12	4459318	4459329	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.