MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C chromosome

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017634	GAAAAT	2	12	10686	10697	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017634	TTAACC	2	12	22896	22907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017634	AAGGGA	2	12	85881	85892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017634	GTAGTG	2	12	204494	204505	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017634	TGTTGA	2	12	262819	262830	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017634	CTTTTC	2	12	278811	278822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017634	TTTTCT	2	12	328904	328915	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017634	CTATTT	2	12	329941	329952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017634	AATTTC	2	12	337607	337618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017634	TGTCTG	2	12	347533	347544	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017634	TGAGGT	2	12	347726	347737	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017634	TTTATT	2	12	359884	359895	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017634	TATTGA	2	12	409457	409468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017634	TTTTCA	2	12	471591	471602	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017634	CAGGCG	2	12	490434	490445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017634	TGCAAA	2	12	581281	581292	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017634	ATTTTT	2	12	676603	676614	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017634	TTTACC	2	12	687515	687526	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017634	TTTTCT	2	12	743245	743256	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017634	CAGAAA	2	12	782024	782035	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017634	AGATAA	2	12	820603	820614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017634	TAACCG	2	12	870246	870257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017634	AAATAA	2	12	909369	909380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017634	CTGGAA	2	12	918933	918944	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017634	AAAGAT	2	12	941726	941737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017634	TAAGGA	2	12	977596	977607	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017634	ATAATG	2	12	979011	979022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017634	CAGAAG	2	12	1029674	1029685	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017634	TGGTAA	2	12	1043587	1043598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017634	TGTTAA	2	12	1052137	1052148	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017634	CAAAAA	2	12	1095742	1095753	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017634	GCTATT	2	12	1176099	1176110	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017634	ATTTAT	2	12	1201775	1201786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017634	AGGGGG	2	12	1241858	1241869	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017634	CTTATT	2	12	1317110	1317121	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017634	CAAAAG	2	12	1324161	1324172	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017634	CTGATC	2	12	1334640	1334651	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017634	TATAAC	2	12	1388112	1388123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017634	TAAATT	2	12	1432166	1432177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017634	GTTAAT	2	12	1496409	1496420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017634	AAAAAC	2	12	1529907	1529918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017634	CGTTGT	2	12	1531294	1531305	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017634	ACCGTT	2	12	1537478	1537489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017634	CAAAAA	2	12	1589572	1589583	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017634	TGACAG	2	12	1617863	1617874	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017634	AAAAAC	2	12	1626419	1626430	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017634	ATACTT	2	12	1721222	1721233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017634	AAAATA	2	12	1734880	1734891	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017634	TGTTTT	2	12	1735514	1735525	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017634	AAGACT	2	12	1735774	1735785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017634	TATTAC	2	12	1848500	1848511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017634	TTTCTT	2	12	1860954	1860965	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017634	AATTCA	2	12	1955361	1955372	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017634	TTCTGA	2	12	1956947	1956958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017634	ATATTT	2	12	1957348	1957359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017634	TCTTAT	2	12	1969179	1969190	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017634	GTGTAT	2	12	1983518	1983529	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017634	ACAGAC	2	12	2047798	2047809	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017634	ATTTTT	2	12	2054572	2054583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017634	GCCATT	2	12	2059966	2059977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017634	TGACGC	2	12	2141788	2141799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017634	TTTTGT	2	12	2146246	2146257	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017634	CCTGTT	2	12	2241846	2241857	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017634	TCTTCC	2	12	2289603	2289614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017634	TAAATG	2	12	2423347	2423358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017634	TGTCAC	2	12	2436982	2436993	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017634	AGCGGA	2	12	2440118	2440129	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017634	AGAAAA	2	12	2447261	2447272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017634	CTGATG	2	12	2500127	2500138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017634	GTTATG	2	12	2517972	2517983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017634	TCGATA	2	12	2528596	2528607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017634	CAAGTG	2	12	2534938	2534949	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017634	TCCTTC	2	12	2630579	2630590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017634	TGAGCG	2	12	2665060	2665071	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017634	TGGACA	2	12	2675069	2675080	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017634	CAGTTT	2	12	2689674	2689685	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017634	TGACGC	2	12	2826699	2826710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017634	AATGAT	2	12	2854612	2854623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017634	GGTTTT	2	12	2870567	2870578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017634	ACAAGA	2	12	2874897	2874908	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017634	TTTGTT	2	12	2899718	2899729	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017634	ATCGCG	2	12	3016379	3016390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017634	GTAAGG	2	12	3031053	3031064	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017634	ACTGAG	2	12	3055085	3055096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017634	CAAAAA	2	12	3096289	3096300	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017634	TTTTCG	2	12	3128902	3128913	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017634	ATTTAA	2	12	3142107	3142118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017634	ATAAAA	2	12	3193996	3194007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017634	ATTTAA	2	12	3204736	3204747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017634	AGTTGT	2	12	3236036	3236047	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017634	CTTTTT	2	12	3240712	3240723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017634	AATGAT	2	12	3241547	3241558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017634	TCTCCC	2	12	3264078	3264089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017634	GTAACC	2	12	3289847	3289858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017634	TGCATT	2	12	3298666	3298677	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017634	TTTTAT	2	12	3300563	3300574	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017634	AAGCGA	2	12	3305962	3305973	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017634	ACAGAA	2	12	3352759	3352770	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017634	AGCGTT	2	12	3435846	3435857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017634	TTTATA	2	12	3452524	3452535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017634	AATTTA	2	12	3558105	3558116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017634	TATTTA	2	12	3584015	3584026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017634	TGATAA	2	12	3584948	3584959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017634	AAGATA	2	12	3650673	3650684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017634	AGATGC	2	12	3665943	3665954	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017634	TGAAAA	2	12	3689831	3689842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017634	TTTGCC	2	12	3726326	3726337	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017634	CTTCAA	2	12	3736393	3736404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017634	ATATTT	2	12	3736450	3736461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017634	CTTTTT	2	12	3962423	3962434	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017634	GGGAGT	2	12	4129335	4129346	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017634	ATTTTT	2	12	4205301	4205312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017634	TCATTT	2	12	4272273	4272284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017634	TTTTAT	2	12	4291240	4291251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017634	TAACCA	2	12	4291745	4291756	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017634	ATTTAT	2	12	4332349	4332360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017634	GTCTTT	2	12	4341159	4341170	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017634	AATATC	2	12	4373923	4373934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017634	CTGATA	2	12	4409568	4409579	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017634	TTTTTA	2	12	4507453	4507464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017634	TTTAAT	2	12	4539307	4539318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017634	CAGCCT	2	12	4580600	4580611	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017634	AAAAGA	2	12	4622243	4622254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017634	AACAGG	2	12	4637488	4637499	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017634	GTGATT	2	12	4682338	4682349	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017634	TTATCA	2	12	4711864	4711875	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017634	GTAAAA	2	12	4736844	4736855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.