MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C chromosome

Total Repeats: 11282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017634	A	7	7	2013117	2013123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017634	AATA	2	8	2013141	2013148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017634	T	6	6	2013252	2013257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017634	A	6	6	2013285	2013290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017634	CAA	2	6	2013302	2013307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_017634	T	6	6	2013361	2013366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017634	ATT	2	6	2013373	2013378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017634	AAT	2	6	2013451	2013456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017634	GA	3	6	2013658	2013663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017634	TC	3	6	2013736	2013741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_017634	ATG	2	6	2013758	2013763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017634	ATTA	2	8	2014649	2014656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017634	GACA	2	8	2014689	2014696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_017634	CGG	2	6	2014758	2014763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017634	TGG	2	6	2014921	2014926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017634	ACC	3	9	2016265	2016273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_017634	AGG	2	6	2016279	2016284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017634	TA	3	6	2016291	2016296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017634	AGA	2	6	2016342	2016347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017634	CT	3	6	2017739	2017744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_017634	AG	3	6	2022575	2022580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017634	GAT	2	6	2022607	2022612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017634	TGA	2	6	2022642	2022647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017634	AAT	2	6	2022703	2022708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017634	C	6	6	2023761	2023766	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5026	NC_017634	CTC	2	6	2023771	2023776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_017634	ATAA	2	8	2023845	2023852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017634	TAA	2	6	2023879	2023884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017634	TTA	2	6	2023885	2023890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017634	AGG	2	6	2023930	2023935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017634	CAC	2	6	2043151	2043156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_017634	T	6	6	2043198	2043203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017634	CAA	2	6	2043231	2043236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017634	CAG	2	6	2045319	2045324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017634	A	6	6	2045331	2045336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017634	ATT	2	6	2045352	2045357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017634	TC	3	6	2045409	2045414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_017634	AAT	2	6	2045428	2045433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017634	A	6	6	2045469	2045474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017634	CAAC	2	8	2045477	2045484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_017634	TA	3	6	2045494	2045499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017634	ACAA	2	8	2045531	2045538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_017634	A	9	9	2045542	2045550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017634	CATA	2	8	2045553	2045560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_017634	ATT	2	6	2045564	2045569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017634	TA	3	6	2045587	2045592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017634	TATT	2	8	2045630	2045637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017634	CTG	2	6	2045638	2045643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_017634	CAAT	2	8	2045644	2045651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_017634	CATA	2	8	2045653	2045660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_017634	ACT	2	6	2045682	2045687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017634	ATC	2	6	2045720	2045725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017634	TTG	2	6	2045881	2045886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017634	ATA	2	6	2045898	2045903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017634	TGG	2	6	2046927	2046932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017634	AGC	2	6	2047103	2047108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_017634	GAT	2	6	2047124	2047129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017634	CT	3	6	2047189	2047194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_017634	CGA	2	6	2047257	2047262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_017634	AGGTC	2	10	2047285	2047294	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5061	NC_017634	ATC	2	6	2047400	2047405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_017634	CTA	2	6	2047422	2047427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_017634	GAAA	2	8	2047463	2047470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017634	AAC	2	6	2047521	2047526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017634	TGA	2	6	2047537	2047542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017634	TCA	2	6	2047650	2047655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_017634	TCAGG	2	10	2047715	2047724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5068	NC_017634	ACAGAC	2	12	2047798	2047809	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_017634	CCA	2	6	2047884	2047889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_017634	CCA	2	6	2047983	2047988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_017634	ACA	2	6	2048033	2048038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017634	AT	3	6	2048112	2048117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017634	CAG	2	6	2048133	2048138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_017634	AAC	2	6	2048162	2048167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017634	TCA	2	6	2048171	2048176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017634	AT	3	6	2048226	2048231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017634	AGG	2	6	2048359	2048364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017634	TCA	2	6	2048407	2048412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017634	TAT	2	6	2048537	2048542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017634	AAT	2	6	2048549	2048554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017634	CGG	2	6	2048577	2048582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017634	ATT	2	6	2048586	2048591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017634	CCT	2	6	2048607	2048612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_017634	TAA	2	6	2048673	2048678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017634	GGT	2	6	2048699	2048704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017634	TCC	2	6	2048722	2048727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_017634	TGA	2	6	2048797	2048802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017634	TGA	2	6	2048822	2048827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017634	CAC	2	6	2048828	2048833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_017634	AATGC	2	10	2049954	2049963	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5091	NC_017634	ATC	2	6	2049975	2049980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_017634	ACA	2	6	2050056	2050061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017634	ATC	2	6	2051571	2051576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_017634	AC	3	6	2051653	2051658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_017634	CTT	2	6	2053126	2053131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_017634	TAAG	2	8	2053154	2053161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017634	TAT	2	6	2053224	2053229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017634	A	6	6	2053284	2053289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017634	CAA	2	6	2053296	2053301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017634	ATA	2	6	2053385	2053390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017634	TAAA	2	8	2053428	2053435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017634	GAG	2	6	2053441	2053446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017634	A	6	6	2054266	2054271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017634	ATA	2	6	2054289	2054294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017634	TTA	2	6	2054296	2054301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017634	TCT	2	6	2054312	2054317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_017634	T	6	6	2054544	2054549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017634	ATTTTT	2	12	2054572	2054583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017634	CTC	2	6	2054629	2054634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_017634	CCG	2	6	2054672	2054677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_017634	CCCA	2	8	2054732	2054739	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5112	NC_017634	T	6	6	2054755	2054760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017634	AAT	2	6	2054782	2054787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017634	CGG	2	6	2056474	2056479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017634	ATA	2	6	2057575	2057580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017634	GCC	2	6	2058565	2058570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_017634	TTAC	2	8	2058572	2058579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_017634	CAG	2	6	2058684	2058689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_017634	AGG	2	6	2058712	2058717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017634	CAC	2	6	2058723	2058728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_017634	CAC	2	6	2058760	2058765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_017634	TTG	2	6	2058767	2058772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017634	GCA	2	6	2058779	2058784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_017634	AACA	2	8	2058785	2058792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_017634	A	7	7	2058792	2058798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017634	CGG	2	6	2058883	2058888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_017634	CTTA	2	8	2058951	2058958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_017634	TGG	2	6	2059046	2059051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017634	GGTT	2	8	2059067	2059074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017634	C	6	6	2059088	2059093	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5132	NC_017634	TC	3	6	2059273	2059278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5264	NC_017634	ATA	2	6	2093601	2093606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_017634	TTCC	2	8	2093628	2093635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5266	NC_017634	AATT	2	8	2093689	2093696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_017634	AAC	2	6	2093716	2093721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5268	NC_017634	AAC	2	6	2093731	2093736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_017634	TAT	2	6	2093759	2093764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_017634	T	8	8	2093824	2093831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_017634	A	7	7	2093846	2093852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_017634	ATG	2	6	2108424	2108429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5276	NC_017634	A	7	7	2110213	2110219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5277	NC_017634	AC	3	6	2110237	2110242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5278	NC_017634	TA	3	6	2110754	2110759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5279	NC_017634	CTG	2	6	2110832	2110837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5280	NC_017634	AAAG	2	8	2110840	2110847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_017634	CTGG	2	8	2112071	2112078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5282	NC_017634	ACT	2	6	2112100	2112105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5284	NC_017634	A	6	6	2113655	2113660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_017634	GAT	2	6	2113698	2113703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_017634	A	6	6	2115121	2115126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5287	NC_017634	T	7	7	2115135	2115141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5289	NC_017634	ATGA	2	8	2115212	2115219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5290	NC_017634	A	6	6	2115232	2115237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5291	NC_017634	T	6	6	2115272	2115277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5294	NC_017634	ATA	2	6	2115336	2115341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5295	NC_017634	GCG	2	6	2116301	2116306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5296	NC_017634	CTG	2	6	2116309	2116314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5298	NC_017634	ATGA	2	8	2117218	2117225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5299	NC_017634	ATG	2	6	2117768	2117773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5301	NC_017634	TATT	2	8	2117787	2117794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5302	NC_017634	CTT	2	6	2117890	2117895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5304	NC_017634	AT	3	6	2117933	2117938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5305	NC_017634	A	6	6	2117939	2117944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5310	NC_017634	T	6	6	2118159	2118164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5311	NC_017634	TGT	3	9	2125269	2125277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5324	NC_017634	A	7	7	2127882	2127888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5351	NC_017634	CGC	2	6	2141857	2141862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5362	NC_017634	AAT	2	6	2160874	2160879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_017634	AGG	2	6	2160882	2160887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5364	NC_017634	TAT	2	6	2161049	2161054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_017634	ATA	2	6	2161098	2161103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5368	NC_017634	ACAGG	2	10	2162829	2162838	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5374	NC_017634	GCTTT	2	10	2170684	2170693	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5382	NC_017634	ACA	2	6	2175636	2175641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5383	NC_017634	CAC	2	6	2175734	2175739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5384	NC_017634	GAT	2	6	2175740	2175745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5388	NC_017634	ATT	2	6	2175897	2175902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_017634	CAC	2	6	2176062	2176067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5390	NC_017634	GAT	3	9	2176068	2176076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_017634	TCA	2	6	2176082	2176087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_017634	TTAT	2	8	2176099	2176106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_017634	TCG	2	6	2176154	2176159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_017634	TTA	2	6	2176223	2176228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5396	NC_017634	TGGC	2	8	2176310	2176317	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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