MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli ABU 83972 chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017631	GAAAAT	2	12	10699	10710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017631	AAGGGA	2	12	86035	86046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017631	ATTGTT	2	12	154711	154722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017631	TTCTCT	2	12	168970	168981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017631	GTAGTG	2	12	206264	206275	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017631	GTTTTC	2	12	273698	273709	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017631	AATATA	2	12	291034	291045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017631	CGTCAA	2	12	303068	303079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017631	ATTGTG	2	12	325257	325268	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017631	ACCACA	2	12	364739	364750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017631	TTTTCT	2	12	414417	414428	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017631	CTATTT	2	12	415454	415465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017631	AATTTC	2	12	422181	422192	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017631	GTAACA	2	12	429745	429756	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017631	TGTCTG	2	12	432104	432115	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017631	TGAGGT	2	12	432297	432308	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017631	TTTATT	2	12	444352	444363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017631	AACAAT	2	12	491030	491041	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017631	TATTGA	2	12	493876	493887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017631	TTTTCA	2	12	556135	556146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017631	CAGGCG	2	12	574978	574989	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017631	GTTTTC	2	12	635879	635890	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017631	TGCAAA	2	12	663885	663896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017631	CATGAG	2	12	705841	705852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017631	ATTTTT	2	12	758959	758970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017631	TTTACC	2	12	769871	769882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017631	TTCATT	2	12	943932	943943	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017631	TAACCG	2	12	951842	951853	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017631	CTGGAA	2	12	989963	989974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017631	AAAGAT	2	12	1012757	1012768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017631	AAAAAG	2	12	1012777	1012788	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017631	TAAGGA	2	12	1048657	1048668	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017631	ATAATG	2	12	1050072	1050083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017631	TGGTAA	2	12	1073853	1073864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017631	TGTTAA	2	12	1082403	1082414	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017631	ATTATC	2	12	1147288	1147299	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017631	ATTTTT	2	12	1159056	1159067	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017631	GGTTTC	2	12	1159314	1159325	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017631	CTTTTT	2	12	1203275	1203286	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017631	ATCACA	2	12	1241099	1241110	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017631	CAAACC	2	12	1250239	1250250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017631	CAAAAA	2	12	1288188	1288199	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017631	ACAGGA	2	12	1380378	1380389	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017631	AAAATG	2	12	1411278	1411289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017631	AGGGGG	2	12	1423198	1423209	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017631	CTTATT	2	12	1498452	1498463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017631	CAAAAG	2	12	1505503	1505514	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017631	CTGATC	2	12	1515981	1515992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017631	AAAGTT	2	12	1520231	1520242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017631	TATAAC	2	12	1569132	1569143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017631	GTTAAT	2	12	1678382	1678393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017631	AAAAAC	2	12	1711569	1711580	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017631	CGTTGT	2	12	1712956	1712967	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017631	ACCGTT	2	12	1719140	1719151	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017631	TGGTTA	2	12	1727970	1727981	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017631	CAAAAA	2	12	1771199	1771210	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017631	ATACTT	2	12	1895900	1895911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017631	AAAATA	2	12	1909558	1909569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017631	TGTTTT	2	12	1910192	1910203	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017631	GAACAG	2	12	1958058	1958069	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017631	ACAGCG	2	12	2024736	2024747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017631	TATTAC	2	12	2027771	2027782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017631	TTTCTT	2	12	2040225	2040236	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017631	TCAACG	2	12	2057841	2057852	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017631	ACTGTC	2	12	2087826	2087837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017631	AATTCA	2	12	2133941	2133952	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017631	TCTTAT	2	12	2147759	2147770	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017631	GTGTAT	2	12	2162106	2162117	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017631	ATTTTT	2	12	2233149	2233160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017631	CTGATA	2	12	2296636	2296647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017631	GAAAAC	2	12	2322528	2322539	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017631	TAAAAA	2	12	2369880	2369891	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017631	TTTTGT	2	12	2386583	2386594	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017631	TCCCCC	2	12	2416705	2416716	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
75	NC_017631	CCTTAC	2	12	2466664	2466675	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017631	TCTTCC	2	12	2525133	2525144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017631	TAAATG	2	12	2660165	2660176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017631	TGTCAC	2	12	2673798	2673809	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017631	AGCGGA	2	12	2675959	2675970	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017631	AGAAAA	2	12	2683102	2683113	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017631	CTGATG	2	12	2748148	2748159	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017631	GTTATG	2	12	2765993	2766004	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017631	TCGATA	2	12	2776498	2776509	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017631	CAAGTG	2	12	2782840	2782851	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017631	TCCTTC	2	12	2878554	2878565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017631	TGAGCG	2	12	2913036	2913047	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017631	TGGACA	2	12	2923046	2923057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017631	CAGTTT	2	12	2937651	2937662	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017631	TGACGC	2	12	3071665	3071676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017631	AATGAT	2	12	3099578	3099589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017631	GGTTTT	2	12	3114903	3114914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017631	ACAAGA	2	12	3119232	3119243	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017631	GTAAGG	2	12	3273439	3273450	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017631	TTTTGT	2	12	3331185	3331196	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017631	TATTGT	2	12	3338076	3338087	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017631	TAAATA	2	12	3366584	3366595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017631	CGTGCG	2	12	3384316	3384327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017631	TAAACA	2	12	3388068	3388079	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017631	ATTCCG	2	12	3401709	3401720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017631	TATAAA	2	12	3413974	3413985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017631	CAATAT	2	12	3417008	3417019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017631	TTTTCG	2	12	3446894	3446905	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017631	ATAAAA	2	12	3512000	3512011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017631	ATTTAA	2	12	3522740	3522751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017631	AGTTGT	2	12	3555770	3555781	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017631	CTTTTT	2	12	3560446	3560457	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017631	AATGAT	2	12	3561281	3561292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017631	TCTCCC	2	12	3583813	3583824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017631	GTAACC	2	12	3609584	3609595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017631	TGCATT	2	12	3618394	3618405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017631	TTTTAT	2	12	3620291	3620302	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017631	AAGCGA	2	12	3625689	3625700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017631	ACAGAA	2	12	3672487	3672498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017631	AGCGTT	2	12	3754272	3754283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017631	TTTATA	2	12	3770951	3770962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017631	CAGGCA	2	12	3865184	3865195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017631	AATTTA	2	12	3877341	3877352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017631	TGATAA	2	12	3904229	3904240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017631	AAGATA	2	12	3973382	3973393	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017631	AGATGC	2	12	3988652	3988663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017631	TGAAAA	2	12	4012539	4012550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017631	TTTGCC	2	12	4049654	4049665	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017631	GCCAGC	2	12	4051731	4051742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017631	CTGAAG	2	12	4054187	4054198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017631	TATCAA	2	12	4109271	4109282	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017631	TCACCT	2	12	4147939	4147950	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017631	GAAAAA	2	12	4158262	4158273	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017631	CAATGG	2	12	4160915	4160926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017631	TTTATA	2	12	4224571	4224582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_017631	AAATGG	2	12	4445469	4445480	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.