MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UM146 plasmid pUM146

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017630	TGCAT	2	10	29072	29081	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017630	ACCTT	2	10	49660	49669	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017630	GGCAC	2	10	49703	49712	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017630	CCCGT	2	10	52249	52258	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017630	GCCGC	2	10	52299	52308	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017630	GCATT	2	10	55994	56003	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017630	GTACG	2	10	59099	59108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017630	TGAAC	2	10	59561	59570	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017630	GGAAG	2	10	61382	61391	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017630	ATGGT	2	10	65693	65702	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017630	AGCTG	2	10	65930	65939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017630	ATTAC	2	10	66411	66420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017630	TCCTT	2	10	66686	66695	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017630	TTATG	2	10	68986	68995	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017630	GTTAT	2	10	70165	70174	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017630	TGATG	2	10	70578	70587	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017630	ATTTT	2	10	71104	71113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017630	ACTTG	2	10	71689	71698	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017630	TAGTT	2	10	72517	72526	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017630	ATAGA	2	10	72780	72789	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017630	TTTGA	2	10	77558	77567	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017630	CGGGG	2	10	111495	111504	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.