MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli IHE3034 chromosome

Total Repeats: 564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017628	GAATT	2	10	15980	15989	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017628	AATGT	2	10	18509	18518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017628	GATGC	2	10	27241	27250	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017628	GATGC	2	10	37333	37342	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017628	AAAGC	2	10	74614	74623	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017628	TAGTG	2	10	79196	79205	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017628	ATTTT	2	10	80912	80921	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017628	CGCCA	2	10	81140	81149	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017628	GTGTT	2	10	123800	123809	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017628	AATTG	2	10	127957	127966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017628	GTAAG	2	10	148707	148716	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017628	TCCTC	2	10	150427	150436	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_017628	AATTT	2	10	163030	163039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017628	TATAT	2	10	163116	163125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017628	TACGT	2	10	188154	188163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017628	TGGCC	2	10	189840	189849	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017628	GTCTG	2	10	197550	197559	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017628	TGCGC	2	10	220732	220741	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017628	CGGTT	2	10	228192	228201	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017628	GGTGA	2	10	230498	230507	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017628	AGATA	2	10	270210	270219	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017628	CATCC	2	10	270845	270854	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017628	TTTTA	2	10	301085	301094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017628	ACCAT	2	10	301129	301138	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017628	ACCAA	2	10	302450	302459	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017628	ACATT	2	10	302697	302706	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017628	GCAAT	2	10	303713	303722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017628	TGTGT	2	10	311554	311563	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017628	TGTTA	2	10	312662	312671	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017628	TTGAT	2	10	313552	313561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017628	AGGGT	2	10	324805	324814	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017628	CAAAA	2	10	329379	329388	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017628	GGTTT	2	10	338900	338909	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017628	AGCGA	2	10	340396	340405	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017628	GCGAA	2	10	356232	356241	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017628	CAGTT	2	10	366098	366107	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017628	TTATT	2	10	389597	389606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017628	CTTCT	2	10	402878	402887	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017628	TGCAG	2	10	410834	410843	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017628	GTTTC	2	10	435656	435665	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017628	CTTTT	2	10	439131	439140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017628	GAGTA	2	10	441704	441713	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017628	ATAAA	2	10	455241	455250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017628	GAAGA	2	10	464843	464852	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017628	TGAGT	2	10	478615	478624	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017628	CAGGT	2	10	479902	479911	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017628	TTTTC	2	10	500444	500453	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017628	TCAGG	2	10	508204	508213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017628	TATTT	2	10	537592	537601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017628	CGATG	2	10	577745	577754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017628	GATTC	2	10	578869	578878	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017628	AAAGG	2	10	609309	609318	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017628	GTCAG	2	10	630156	630165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017628	GTTAA	2	10	650373	650382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017628	ATAGC	2	10	658268	658277	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017628	ATTTG	2	10	677077	677086	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017628	TCAAT	2	10	679384	679393	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017628	CGTAA	2	10	681180	681189	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017628	GCATA	2	10	693375	693384	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017628	AGCAA	2	10	693482	693491	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017628	GTGTT	2	10	698430	698439	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017628	GTGTT	2	10	710672	710681	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017628	CAGGG	2	10	714117	714126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017628	GGCGT	2	10	720466	720475	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017628	TCGCG	2	10	728480	728489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017628	CGTGA	2	10	729968	729977	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017628	GTCGT	2	10	780829	780838	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017628	GATGC	2	10	805674	805683	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017628	ACATA	2	10	835647	835656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017628	AGCGC	2	10	838675	838684	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017628	GATGC	2	10	841086	841095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017628	ACAAA	2	10	847684	847693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017628	AAAAC	2	10	848377	848386	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017628	TATAT	2	10	852419	852428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017628	CAGGG	2	10	875957	875966	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017628	AGTAA	2	10	887799	887808	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017628	TTTAA	2	10	922014	922023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017628	GCAAT	2	10	922429	922438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017628	CGATG	2	10	933152	933161	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017628	TGTAA	2	10	943217	943226	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017628	AGCGA	2	10	973229	973238	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017628	TTTTA	2	10	998268	998277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017628	GCAAC	2	10	1005242	1005251	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017628	TTAAG	2	10	1012811	1012820	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017628	CTGGC	2	10	1013509	1013518	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017628	TTCAC	2	10	1019211	1019220	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017628	TTGTT	2	10	1045129	1045138	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017628	AGCGA	2	10	1046469	1046478	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017628	ATGAC	2	10	1048209	1048218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017628	TTTTC	2	10	1056101	1056110	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017628	TTATT	2	10	1056911	1056920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017628	TTCTT	2	10	1058844	1058853	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017628	GTACA	2	10	1061381	1061390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017628	TTTTA	2	10	1061536	1061545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017628	CTTAT	2	10	1072042	1072051	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017628	TAAAA	2	10	1082639	1082648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017628	GGAGG	2	10	1095479	1095488	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017628	AAGGA	2	10	1095565	1095574	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017628	CAATA	2	10	1129103	1129112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017628	TGAGG	2	10	1131104	1131113	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017628	GTTAT	2	10	1131176	1131185	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017628	GTTTG	2	10	1136953	1136962	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017628	TCTGA	2	10	1137178	1137187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017628	CATTC	2	10	1139381	1139390	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017628	ATTTT	2	10	1144376	1144385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017628	TGTAA	2	10	1162711	1162720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017628	ATAAC	2	10	1165597	1165606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017628	TGGTA	2	10	1170327	1170336	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017628	AAAAT	2	10	1170827	1170836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017628	GATCG	2	10	1197334	1197343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017628	GTCAT	2	10	1208751	1208760	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017628	TAAAA	2	10	1209257	1209266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017628	TGCAG	2	10	1217454	1217463	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017628	GTCGC	2	10	1232515	1232524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017628	GGGGA	2	10	1278604	1278613	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017628	CAGTG	2	10	1290264	1290273	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017628	TTGCA	2	10	1291459	1291468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017628	CTTGG	2	10	1293305	1293314	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017628	CGATG	2	10	1303181	1303190	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017628	GATTC	2	10	1304305	1304314	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017628	TTATT	2	10	1305355	1305364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017628	GATCA	2	10	1310057	1310066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017628	GTGGC	2	10	1310253	1310262	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017628	GCCAT	2	10	1310306	1310315	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017628	ATTAA	2	10	1333656	1333665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017628	GCGAG	2	10	1334958	1334967	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017628	AAGGA	2	10	1338067	1338076	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017628	ATTTT	2	10	1340973	1340982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017628	CTGGT	2	10	1341177	1341186	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017628	GTTTT	2	10	1344793	1344802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017628	TATAA	2	10	1345198	1345207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017628	CCTTA	2	10	1351717	1351726	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017628	ATAAA	2	10	1368428	1368437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017628	GAAAA	2	10	1373820	1373829	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017628	CTTCA	2	10	1389041	1389050	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017628	TTATC	2	10	1396359	1396368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017628	ACCGT	2	10	1407811	1407820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017628	GGCAA	2	10	1414518	1414527	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017628	ATTGA	2	10	1418893	1418902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017628	TGGGG	2	10	1438428	1438437	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017628	GTTTT	2	10	1444580	1444589	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017628	CAGTA	2	10	1447316	1447325	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017628	AATGT	2	10	1453403	1453412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017628	GTTCT	2	10	1453782	1453791	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017628	TTATT	2	10	1454980	1454989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017628	CGTTG	2	10	1481230	1481239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_017628	ATTTT	2	10	1577629	1577638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017628	CATTG	2	10	1577648	1577657	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_017628	TATTG	2	10	2484857	2484866	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017628	ATAAA	2	10	2496700	2496709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017628	ACGCT	2	10	2505679	2505688	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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277	NC_017628	CCTAT	2	10	2559067	2559076	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_017628	GTTAA	2	10	2580010	2580019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017628	AATGG	2	10	2587800	2587809	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017628	ATTTT	2	10	2599730	2599739	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017628	GTTAT	2	10	2617387	2617396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017628	CAGCT	2	10	2624996	2625005	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_017628	CTGTC	2	10	2636233	2636242	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_017628	CCCGC	2	10	2637190	2637199	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
286	NC_017628	TTGTG	2	10	2638143	2638152	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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