MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	AT	3	6	4355	4360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017627	CA	3	6	4377	4382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017627	TA	3	6	4412	4417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017627	TA	3	6	4446	4451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017627	CT	3	6	9612	9617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017627	AG	3	6	9622	9627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017627	CT	3	6	11057	11062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017627	AC	3	6	13960	13965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017627	TA	3	6	15491	15496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017627	CT	3	6	18850	18855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017627	TC	3	6	22008	22013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017627	CA	3	6	25590	25595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017627	CT	3	6	25967	25972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017627	AC	3	6	26370	26375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017627	AT	3	6	26649	26654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017627	TA	3	6	26657	26662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017627	CA	3	6	27960	27965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017627	GA	3	6	28063	28068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017627	CA	3	6	32767	32772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017627	CG	3	6	33212	33217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017627	AT	3	6	38068	38073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017627	AT	3	6	39315	39320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017627	TA	3	6	39593	39598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017627	AT	3	6	41952	41957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017627	AC	3	6	42142	42147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017627	GC	3	6	42387	42392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017627	TC	3	6	43041	43046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017627	TA	3	6	43062	43067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017627	AT	3	6	43185	43190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017627	AT	3	6	43316	43321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017627	GT	3	6	43862	43867	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017627	AT	3	6	44133	44138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017627	CT	3	6	44995	45000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017627	TC	3	6	46119	46124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017627	GT	3	6	49512	49517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017627	CT	3	6	50509	50514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017627	TG	3	6	67505	67510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017627	CA	4	8	84341	84348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017627	TA	4	8	84409	84416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017627	GC	3	6	86478	86483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017627	CG	3	6	90546	90551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017627	TC	3	6	90804	90809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017627	GC	3	6	92247	92252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017627	AC	3	6	99743	99748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017627	GT	3	6	102990	102995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017627	CG	3	6	103162	103167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017627	CG	3	6	103428	103433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017627	TC	3	6	105289	105294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017627	AC	3	6	109054	109059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017627	CG	3	6	109166	109171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017627	CG	3	6	112362	112367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017627	GT	3	6	112474	112479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.