MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli 042

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017626	GAAAAT	2	12	12048	12059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017626	TAAAAA	2	12	65485	65496	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017626	AAGGGA	2	12	91023	91034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017626	TTTATT	2	12	140753	140764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017626	ATTGTT	2	12	154265	154276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017626	GTAGTG	2	12	205404	205415	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017626	GAACCC	2	12	271472	271483	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017626	CTTTTC	2	12	283706	283717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017626	AGGGAG	2	12	300850	300861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017626	GTGCAG	2	12	304182	304193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017626	ATTATC	2	12	366167	366178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017626	TTTTCT	2	12	378511	378522	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017626	CTATTT	2	12	379548	379559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017626	TTTATT	2	12	406855	406866	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017626	TTTTTA	2	12	461669	461680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017626	AACAAT	2	12	467227	467238	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017626	TATTGA	2	12	470073	470084	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017626	TTTTCA	2	12	536730	536741	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017626	CAGGCG	2	12	555572	555583	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017626	TGGCGA	2	12	581328	581339	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017626	GCAACA	2	12	583737	583748	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017626	GAGCGT	2	12	583954	583965	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017626	GTCACC	2	12	584495	584506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017626	ACGCTG	2	12	585401	585412	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017626	ACCGTC	2	12	586295	586306	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017626	GACGGT	2	12	588088	588099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017626	GCGGGC	2	12	591028	591039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017626	CAGCGC	2	12	592698	592709	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017626	GTCAGC	2	12	593332	593343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017626	ACCGTC	2	12	593479	593490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017626	GTCACC	2	12	593779	593790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017626	CTGACC	2	12	597067	597078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017626	GACCTG	2	12	597765	597776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017626	CAACTA	2	12	597804	597815	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017626	ACAGCG	2	12	599054	599065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017626	CCTACA	2	12	599081	599092	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017626	CGGTGG	2	12	600308	600319	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017626	CAACAC	2	12	600582	600593	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017626	CGGCAA	2	12	601425	601436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017626	CGCGCC	2	12	609057	609068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017626	CCAAAC	2	12	685901	685912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017626	TGCAAA	2	12	689926	689937	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017626	ATTTTT	2	12	784989	785000	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017626	TAATGC	2	12	880052	880063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017626	CCACAT	2	12	914752	914763	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017626	CAGAAA	2	12	945500	945511	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017626	TTCATT	2	12	1030611	1030622	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017626	TAACCG	2	12	1038510	1038521	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017626	AAATAA	2	12	1069123	1069134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017626	CTGGAA	2	12	1078686	1078697	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017626	AAAGAT	2	12	1101467	1101478	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017626	TGTCCA	2	12	1115245	1115256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017626	TAAGGA	2	12	1137525	1137536	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017626	ATAATG	2	12	1138939	1138950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017626	ATGTTA	2	12	1172280	1172291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017626	CAAAAA	2	12	1211424	1211435	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017626	TTTTGT	2	12	1296741	1296752	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017626	AGCGAT	2	12	1297151	1297162	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017626	GACAGT	2	12	1298781	1298792	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017626	CACAGG	2	12	1299118	1299129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017626	CAGGCT	2	12	1319419	1319430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017626	CTTATT	2	12	1376746	1376757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017626	CAAAAG	2	12	1382639	1382650	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017626	CGGGGG	2	12	1390858	1390869	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017626	CTGATC	2	12	1393118	1393129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017626	GGGAAA	2	12	1416683	1416694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017626	AAAGTT	2	12	1450857	1450868	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017626	ATTTAA	2	12	1540919	1540930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017626	AAGTGA	2	12	1549504	1549515	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017626	AAAATG	2	12	1583845	1583856	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017626	TGACGT	2	12	1601665	1601676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017626	AATTTG	2	12	1650131	1650142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017626	GTTAAT	2	12	1652569	1652580	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017626	AAAAAC	2	12	1684804	1684815	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017626	ACCGTT	2	12	1699680	1699691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017626	CAAAAA	2	12	1760461	1760472	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017626	TTAAAT	2	12	1762260	1762271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017626	TTTTTC	2	12	1763983	1763994	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017626	GATGCG	2	12	1776142	1776153	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017626	AAAAAC	2	12	1797215	1797226	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017626	TGTTTT	2	12	1924751	1924762	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017626	AAGACT	2	12	1925011	1925022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017626	TTTCTT	2	12	2061956	2061967	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017626	TCAACG	2	12	2079565	2079576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017626	ACTGTC	2	12	2111311	2111322	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017626	TCTTAT	2	12	2172597	2172608	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017626	ATATTT	2	12	2206148	2206159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017626	ATTTTT	2	12	2313309	2313320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017626	CTGATA	2	12	2322398	2322409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017626	TTTTGT	2	12	2385118	2385129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017626	GTTTAG	2	12	2406069	2406080	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017626	GCACTG	2	12	2406507	2406518	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017626	TGGGAG	2	12	2407335	2407346	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017626	TCCCCC	2	12	2416012	2416023	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_017626	CCTTAC	2	12	2469461	2469472	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017626	CCTTAC	2	12	2470069	2470080	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017626	CCTGTT	2	12	2481560	2481571	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017626	TCTTCC	2	12	2529463	2529474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017626	CCACTA	2	12	2621419	2621430	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017626	GGCAAT	2	12	2649704	2649715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017626	TAAATG	2	12	2678784	2678795	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017626	TGTCAC	2	12	2692417	2692428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017626	AGCGGA	2	12	2695553	2695564	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017626	AGAAAA	2	12	2702853	2702864	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017626	GTGGCT	2	12	2741033	2741044	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017626	GGCTGC	2	12	2741053	2741064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017626	CTGAGC	2	12	2744820	2744831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017626	GTTATG	2	12	2769357	2769368	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017626	CAAGTG	2	12	2782331	2782342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017626	TCCTTC	2	12	2893952	2893963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017626	TGGACA	2	12	2944048	2944059	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017626	CAGTTT	2	12	2958652	2958663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017626	GTCAAC	2	12	3018240	3018251	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017626	ACTATA	2	12	3033469	3033480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017626	GGAGAA	2	12	3079968	3079979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017626	AATGAT	2	12	3164630	3164641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017626	ACAAGA	2	12	3184302	3184313	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017626	TCCCCC	2	12	3189656	3189667	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
119	NC_017626	TTTGTT	2	12	3209327	3209338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017626	ATTAGA	2	12	3257548	3257559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017626	ATTCTC	2	12	3274539	3274550	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017626	TGCCGA	2	12	3300218	3300229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017626	ACCGGC	2	12	3301470	3301481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017626	ATCGCG	2	12	3318939	3318950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017626	GTAAGG	2	12	3333614	3333625	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017626	TCAGTG	2	12	3405972	3405983	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017626	AGACAA	2	12	3416951	3416962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017626	TTCAGG	2	12	3422723	3422734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017626	AAATTA	2	12	3424300	3424311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017626	CTTTAA	2	12	3452446	3452457	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017626	CATTAA	2	12	3456312	3456323	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017626	TTTTCG	2	12	3485097	3485108	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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134	NC_017626	ATTTAA	2	12	3550426	3550437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017626	ATATTC	2	12	3550596	3550607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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147	NC_017626	ATTACG	2	12	3837823	3837834	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017626	AATTTA	2	12	3892718	3892729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017626	AGATGC	2	12	4022321	4022332	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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153	NC_017626	CTGAAG	2	12	4091944	4091955	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_017626	TTTTTA	2	12	4242623	4242634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.