MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia sp. Ejp617 chromosome

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017445	ATATAC	2	12	26606	26617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017445	AGTGAC	2	12	27797	27808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017445	AACAGT	2	12	34698	34709	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017445	ACAAAA	2	12	37706	37717	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017445	TAATTT	2	12	122536	122547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017445	ATCAAC	2	12	192954	192965	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017445	AAATTT	2	12	295953	295964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017445	CCCTGC	2	12	298524	298535	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017445	TAAAAA	2	12	395307	395318	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017445	GGTGCG	2	12	397797	397808	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017445	TGTCAT	2	12	443379	443390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017445	ATGCAC	3	18	445287	445304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017445	ATTGTA	2	12	454125	454136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017445	CCACTG	3	18	470106	470123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017445	CGGGAA	2	12	484181	484192	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017445	ATTTCG	2	12	523203	523214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017445	AATGTA	2	12	543250	543261	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017445	CTGATT	2	12	552310	552321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017445	TGTTAA	2	12	552441	552452	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017445	TCATTT	2	12	582940	582951	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017445	TTTCCC	2	12	600296	600307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017445	GAATCC	2	12	639511	639522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017445	ATAAAA	2	12	667795	667806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017445	ATTTTA	2	12	671199	671210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017445	CCTTTT	2	12	679315	679326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017445	GATAAA	2	12	723267	723278	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017445	TGGCAT	2	12	740326	740337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017445	TGGCAA	2	12	754371	754382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017445	CCATCA	2	12	755353	755364	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017445	CTGCCG	2	12	790484	790495	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017445	CGGCAT	2	12	796316	796327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017445	CTGGCG	2	12	808470	808481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017445	AATTCA	2	12	819667	819678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017445	CTGAAG	2	12	836615	836626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017445	AATTAA	2	12	858783	858794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017445	TCGGGG	2	12	859289	859300	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017445	AAAAAT	2	12	954628	954639	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017445	CGCAGC	2	12	1050129	1050140	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017445	AACCGG	2	12	1063531	1063542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017445	TCGCTC	2	12	1070062	1070073	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017445	GGTTAA	2	12	1083028	1083039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017445	TTATCA	2	12	1093468	1093479	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017445	ATAAAA	2	12	1098017	1098028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017445	GGAACG	2	12	1099120	1099131	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017445	GATAAA	2	12	1124263	1124274	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017445	TGCCCC	2	12	1160633	1160644	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017445	AGTCGA	2	12	1194497	1194508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017445	TACATT	2	12	1207715	1207726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017445	TAAGAA	2	12	1209716	1209727	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017445	CTTTAA	2	12	1237741	1237752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017445	ACTTAT	2	12	1244150	1244161	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017445	TCCCGG	2	12	1320289	1320300	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017445	AGAAAA	2	12	1329066	1329077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017445	GGCAAC	2	12	1356759	1356770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017445	AATAAA	2	12	1492022	1492033	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017445	TTACCT	2	12	1532876	1532887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017445	ATCAGA	2	12	1534625	1534636	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017445	CCGGTT	2	12	1630505	1630516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017445	TTTACG	2	12	1634332	1634343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017445	ATTTAT	2	12	1644961	1644972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017445	CACGTA	2	12	1657251	1657262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017445	AGGCGG	2	12	1658212	1658223	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017445	TGGCGC	2	12	1687535	1687546	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017445	GCATAC	2	12	1800531	1800542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017445	GCATAC	2	12	1802022	1802033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017445	TGATTT	2	12	1803969	1803980	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017445	CTGGAT	2	12	1840073	1840084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017445	CCCCTC	2	12	1878661	1878672	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
69	NC_017445	TAATTG	2	12	1878900	1878911	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017445	GATGAG	2	12	1880353	1880364	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017445	TATATT	2	12	1898975	1898986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017445	GCTGAA	2	12	1901542	1901553	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017445	GGCCGT	2	12	1905530	1905541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017445	ACTCAG	2	12	1938646	1938657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017445	TTTACT	2	12	1943903	1943914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017445	CAAACG	2	12	1954543	1954554	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017445	CGGGAA	2	12	1961342	1961353	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017445	GGAACG	2	12	2002093	2002104	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017445	GGAACG	2	12	2009900	2009911	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017445	CCAGTT	2	12	2044428	2044439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017445	CTTAAA	2	12	2052046	2052057	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017445	CCGCGT	2	12	2076463	2076474	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017445	CCAGTT	2	12	2083789	2083800	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017445	TTAAGT	2	12	2145255	2145266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017445	TCCAGT	2	12	2246851	2246862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017445	AGCCGC	2	12	2257656	2257667	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017445	TTATAT	2	12	2267425	2267436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017445	GCTTTT	2	12	2323313	2323324	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017445	AATATC	2	12	2398161	2398172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017445	CATTAT	2	12	2401784	2401795	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017445	TTGTTA	2	12	2433696	2433707	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017445	CATTCA	2	12	2439339	2439350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017445	ATCATG	2	12	2497662	2497673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017445	AGCGAG	2	12	2513947	2513958	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017445	GCGAGA	2	12	2514181	2514192	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017445	TACAGT	2	12	2527528	2527539	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017445	CTGAAA	2	12	2538072	2538083	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017445	ATTAAT	2	12	2539811	2539822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017445	TGTCCT	2	12	2579336	2579347	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017445	CTTATC	2	12	2607113	2607124	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017445	GCGCTG	2	12	2637732	2637743	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017445	GAAAGC	2	12	2647261	2647272	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017445	ATTGGT	4	24	2673610	2673633	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017445	CTGCCA	2	12	2702204	2702215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017445	TCCAGC	2	12	2756431	2756442	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017445	AAAATT	2	12	2777840	2777851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017445	TTATTT	2	12	2780424	2780435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017445	ACTGAT	19	114	2783181	2783294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017445	AATTAA	2	12	2849863	2849874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017445	TGTATT	2	12	2853527	2853538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017445	TTAACG	2	12	2857225	2857236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017445	AGCTAA	2	12	2883918	2883929	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017445	GCTAAT	2	12	2884414	2884425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017445	GATTGA	2	12	2942665	2942676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017445	TTCAAA	2	12	2955420	2955431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017445	ATATCA	2	12	2966684	2966695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017445	CGATGC	2	12	2976564	2976575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017445	CACAAC	2	12	3012980	3012991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017445	TTTGGC	2	12	3060814	3060825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017445	GAACGG	2	12	3096156	3096167	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017445	AAATTA	2	12	3146881	3146892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017445	TTTAAT	2	12	3147115	3147126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017445	AAAGGG	2	12	3171598	3171609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017445	TGCTAA	2	12	3219250	3219261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017445	TTTACT	2	12	3223815	3223826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017445	TTTTAA	2	12	3257578	3257589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017445	TTACCT	2	12	3270281	3270292	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017445	AGCAAC	2	12	3274075	3274086	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017445	TTACCT	2	12	3308902	3308913	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017445	TTACCT	2	12	3309074	3309085	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017445	GTTATG	2	12	3326916	3326927	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017445	GTAAAA	2	12	3339191	3339202	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017445	CTTTTT	2	12	3341354	3341365	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017445	ATAATC	2	12	3394558	3394569	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017445	GTTAAT	2	12	3422250	3422261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017445	ACAGCC	2	12	3444125	3444136	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017445	ATTATC	2	12	3457122	3457133	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017445	CCAGCG	2	12	3463246	3463257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017445	GGGTTA	2	12	3467031	3467042	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017445	TTTAAA	2	12	3482115	3482126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017445	CGGCCC	2	12	3504255	3504266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017445	CCAAGC	2	12	3532235	3532246	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017445	CATCAG	2	12	3532323	3532334	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017445	TCCAGC	2	12	3535617	3535628	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017445	GATAGC	2	12	3650959	3650970	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017445	GTAGAG	2	12	3714875	3714886	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017445	CATGAG	2	12	3717297	3717308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017445	TGCCCC	2	12	3742660	3742671	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017445	AGAAAA	2	12	3742719	3742730	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017445	TACCAG	2	12	3884460	3884471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017445	GTATGC	2	12	3893508	3893519	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_017445	GTATGC	2	12	3896705	3896716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.