MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae DSM 12163

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017390	TCCCGG	2	12	39488	39499	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017390	AGAAAA	2	12	48266	48277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017390	TTCAGA	2	12	79661	79672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017390	TTACCT	2	12	212524	212535	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017390	ATCAGA	2	12	214273	214284	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017390	TTTACG	2	12	361458	361469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017390	ATTTAT	2	12	372081	372092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017390	TGGCGC	2	12	415101	415112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017390	ATGCCA	2	12	549869	549880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017390	GAAAAG	2	12	569815	569826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017390	TAAAAT	2	12	577928	577939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017390	GGATTC	2	12	611569	611580	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017390	AGGGAA	2	12	650490	650501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017390	ATTAAC	2	12	695874	695885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017390	TTACAT	2	12	705051	705062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017390	GCAGGT	2	12	709998	710009	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017390	CTTTTA	2	12	727234	727245	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017390	CGATAA	2	12	754234	754245	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017390	TTCCCG	2	12	763994	764005	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017390	TACAAT	2	12	794942	794953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017390	ATGACA	2	12	805681	805692	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017390	TATGAT	2	12	851678	851689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017390	CCGCAC	2	12	851970	851981	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017390	GCAGGG	2	12	949680	949691	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017390	GACTTT	2	12	956889	956900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017390	GCTAAC	2	12	961841	961852	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017390	TAAATT	2	12	962873	962884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017390	CTTTAC	2	12	1105961	1105972	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017390	AAATTA	2	12	1123396	1123407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017390	GTTTCA	2	12	1170884	1170895	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017390	GCTGCG	2	12	1239709	1239720	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017390	GCGCCA	2	12	1290419	1290430	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017390	GCAGCG	2	12	1290521	1290532	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017390	CAGCTC	2	12	1291131	1291142	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017390	CGGCAG	2	12	1294029	1294040	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017390	GCAGCG	2	12	1294145	1294156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017390	CAGCGC	2	12	1295757	1295768	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017390	CCAGCG	2	12	1296059	1296070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017390	GCGGTC	2	12	1346307	1346318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017390	TCTTAT	2	12	1354243	1354254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017390	TTTTCT	2	12	1422576	1422587	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017390	GGGGCA	2	12	1422635	1422646	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017390	GCTATC	2	12	1515587	1515598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017390	CGCGCC	2	12	1537224	1537235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017390	GCTGGA	2	12	1633492	1633503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017390	ATTTTA	2	12	1666436	1666447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017390	TTAATT	2	12	1705260	1705271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017390	TAACCC	2	12	1710719	1710730	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017390	GCGATG	2	12	1744179	1744190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017390	TGATTA	2	12	1783188	1783199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017390	GACGTT	2	12	1821219	1821230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017390	GAAAAA	2	12	1836381	1836392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017390	TTTTAC	2	12	1838545	1838556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017390	CATAAC	2	12	1850822	1850833	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017390	AAGGTA	2	12	1867287	1867298	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017390	AAGGTA	2	12	1867457	1867468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017390	CAATTT	2	12	1903853	1903864	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017390	AGGTAA	2	12	1907518	1907529	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017390	ATTAAA	2	12	1920222	1920233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017390	CTGCGA	2	12	1920769	1920780	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017390	AGTAAA	2	12	1953753	1953764	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017390	AAATAA	2	12	1953829	1953840	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017390	TTAGCA	2	12	1958327	1958338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017390	GCTAAT	2	12	1982606	1982617	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017390	ACTGCT	2	12	2004850	2004861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017390	AGGGAG	4	24	2037267	2037290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017390	GCCAAA	2	12	2139669	2139680	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017390	CCGCAC	2	12	2167560	2167571	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017390	GCATCG	2	12	2223865	2223876	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017390	TTTACG	2	12	2224540	2224551	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017390	GATTCA	2	12	2234349	2234360	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017390	TTTCAA	2	12	2258179	2258190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017390	TTCATC	2	12	2258241	2258252	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017390	ATCATT	2	12	2306143	2306154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017390	CGTTAA	2	12	2343245	2343256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017390	AATACA	2	12	2346943	2346954	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017390	CAATAC	3	18	2530373	2530390	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017390	GCTTTC	2	12	2557512	2557523	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017390	CAGCGC	2	12	2567036	2567047	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017390	GATAAG	2	12	2597596	2597607	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017390	AGGACA	2	12	2629419	2629430	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017390	TCTCGC	2	12	2696519	2696530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017390	TGATAA	2	12	2703385	2703396	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017390	TCATGA	2	12	2713593	2713604	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017390	TGAATG	2	12	2772139	2772150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017390	TGATAT	2	12	2813125	2813136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017390	TTGTAG	2	12	2816002	2816013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017390	AAAAGC	2	12	2894819	2894830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017390	GCGGCT	2	12	2966069	2966080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017390	TGCCAC	2	12	3050890	3050901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017390	ACTTAA	2	12	3071778	3071789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017390	CCCCTG	2	12	3094438	3094449	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017390	ACGCGG	2	12	3142166	3142177	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017390	GTTTAA	2	12	3166583	3166594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017390	AATTTA	2	12	3195916	3195927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017390	CGTTCC	2	12	3203277	3203288	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017390	CGGAAG	2	12	3210068	3210079	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017390	TTCCCG	2	12	3250081	3250092	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017390	AGAATT	2	12	3269739	3269750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017390	TTCAGC	2	12	3308633	3308644	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017390	TATTGA	2	12	3321157	3321168	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017390	GAATAT	2	12	3350233	3350244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017390	CTCATC	2	12	3376037	3376048	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017390	ATTTTT	2	12	3376406	3376417	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017390	ATACAT	2	12	3416426	3416437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017390	ATCCAG	2	12	3416464	3416475	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017390	GAAATA	2	12	3454979	3454990	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017390	AGCAAT	2	12	3468570	3468581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017390	ACCCTA	2	12	3470237	3470248	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017390	CGTTCC	2	12	3475654	3475665	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017390	AGCAAT	2	12	3476335	3476346	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017390	ACCCTA	2	12	3478002	3478013	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017390	ATGTTA	2	12	3500879	3500890	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017390	TTTAGC	2	12	3502999	3503010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017390	CCATCA	2	12	3506235	3506246	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017390	CTGCCG	2	12	3538153	3538164	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017390	CGGCAT	2	12	3543984	3543995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017390	CTGGCG	2	12	3556725	3556736	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017390	GAAGCC	2	12	3579007	3579018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017390	GGAACG	2	12	3592978	3592989	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017390	GGATCA	2	12	3687560	3687571	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017390	AAGATA	2	12	3765193	3765204	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017390	CGCCAG	2	12	3765840	3765851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017390	GCCGCA	2	12	3766418	3766429	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017390	AACCGG	2	12	3816725	3816736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017390	GCTATC	2	12	3823199	3823210	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017390	TTATCA	2	12	3853427	3853438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017390	AAAAAT	2	12	3859018	3859029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017390	TGCCCC	2	12	3905002	3905013	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017390	AGTCGA	2	12	3938879	3938890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017390	TAAGAA	2	12	3955437	3955448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017390	ACTTAT	2	12	3989997	3990008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.