MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Eggerthella sp. YY7918

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015738	GGAAC	2	10	28046	28055	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015738	AAAAG	2	10	28913	28922	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015738	CAAGT	2	10	30294	30303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015738	TCTGA	2	10	32210	32219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015738	GAAAG	2	10	39976	39985	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015738	TCCTG	2	10	74035	74044	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015738	GGGGT	2	10	84286	84295	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015738	CTCTC	2	10	86506	86515	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015738	CGTTT	2	10	86671	86680	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015738	CGTTG	2	10	110841	110850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015738	AACGC	2	10	128401	128410	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015738	CTCTG	2	10	134557	134566	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015738	CGATA	2	10	134672	134681	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015738	CTTTT	2	10	141232	141241	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015738	GACAT	2	10	145853	145862	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015738	TTGTC	2	10	155974	155983	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015738	TTCCT	2	10	159620	159629	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_015738	ATATA	2	10	162359	162368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015738	GCGGT	2	10	176927	176936	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015738	TACTG	2	10	201396	201405	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015738	CCGAA	2	10	209340	209349	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_015738	CGAAT	2	10	212146	212155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015738	CTCGC	2	10	225017	225026	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_015738	CCCTT	2	10	226183	226192	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_015738	GCAAT	2	10	228398	228407	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015738	CGTGC	2	10	238932	238941	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015738	AAGGA	2	10	245289	245298	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015738	CCGCT	2	10	250729	250738	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_015738	GGCGG	2	10	250784	250793	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015738	TCCCC	2	10	272452	272461	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_015738	CCGGG	2	10	293990	293999	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015738	TCCTC	2	10	308352	308361	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_015738	GGATA	2	10	308475	308484	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015738	AGGGG	2	10	308521	308530	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015738	AAGGC	2	10	313996	314005	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015738	AGGTG	2	10	352114	352123	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015738	AAATC	2	10	364219	364228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015738	GCGAC	2	10	374396	374405	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_015738	CAGAT	2	10	377575	377584	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015738	CGAGC	2	10	380346	380355	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015738	CGCGC	2	10	380956	380965	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_015738	ACGGT	2	10	383696	383705	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015738	CGAAG	2	10	387184	387193	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015738	TTTCC	2	10	388660	388669	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015738	ATGCG	2	10	398631	398640	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015738	TCGTG	2	10	447223	447232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015738	TCGTT	2	10	464079	464088	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015738	AGCGC	2	10	465279	465288	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015738	CGCGC	2	10	474708	474717	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_015738	CATTG	2	10	477864	477873	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015738	CGTGG	2	10	489468	489477	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015738	TCGAA	2	10	497851	497860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015738	CTGTT	2	10	523439	523448	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015738	GATCG	2	10	525232	525241	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015738	GCGGG	2	10	531480	531489	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015738	TTGCC	2	10	536093	536102	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015738	GCCGC	2	10	542732	542741	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_015738	CCCGC	2	10	555018	555027	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
59	NC_015738	TTCCC	2	10	589461	589470	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_015738	CAAAC	2	10	632771	632780	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_015738	CTTTC	2	10	668257	668266	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_015738	TAGTG	2	10	689342	689351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015738	GGTTT	2	10	698024	698033	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015738	GGCGT	2	10	708975	708984	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015738	GAAAG	2	10	714674	714683	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015738	ACGCC	2	10	722461	722470	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_015738	ACGAA	2	10	732383	732392	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015738	TAATG	2	10	770869	770878	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015738	AAGAT	2	10	780647	780656	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015738	GCGTT	2	10	780820	780829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015738	TGCGT	2	10	785103	785112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015738	CGCTG	2	10	799254	799263	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_015738	GGGGA	2	10	801406	801415	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015738	TCTGA	2	10	804697	804706	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015738	GCGCG	2	10	811184	811193	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015738	ATGAG	2	10	830272	830281	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015738	ACAAG	2	10	831668	831677	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015738	CAAGA	2	10	831693	831702	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015738	CCAAA	2	10	842464	842473	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015738	ATACG	2	10	846463	846472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015738	ATGTT	2	10	847716	847725	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015738	AGCTA	2	10	848547	848556	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015738	TTCTT	2	10	850158	850167	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015738	TTTTC	2	10	852359	852368	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015738	GTAAG	2	10	852598	852607	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015738	GAACG	2	10	867739	867748	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015738	GGAAG	2	10	870997	871006	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015738	GGTGG	2	10	885403	885412	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015738	GTTTT	2	10	911288	911297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015738	CCGGG	2	10	920642	920651	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015738	ACGCC	2	10	923611	923620	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_015738	TGGGG	2	10	927503	927512	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015738	CAGTA	2	10	938880	938889	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015738	CATAC	2	10	953153	953162	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015738	GAATC	2	10	976831	976840	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015738	ATAAC	2	10	976939	976948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015738	TCGTG	2	10	978001	978010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015738	CCTGT	2	10	978045	978054	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_015738	TCGGA	2	10	978232	978241	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015738	ACGGC	2	10	981583	981592	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015738	TTAGG	2	10	989939	989948	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015738	GCAAA	2	10	1001853	1001862	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015738	ACTAT	2	10	1004544	1004553	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015738	TTCTT	2	10	1009144	1009153	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015738	TCGTT	2	10	1009164	1009173	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015738	TTGTT	2	10	1019160	1019169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015738	TAGAG	2	10	1036446	1036455	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015738	ACCCG	2	10	1054602	1054611	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_015738	TTTTC	2	10	1074156	1074165	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015738	CGCCC	2	10	1074187	1074196	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
111	NC_015738	TGCGC	2	10	1084250	1084259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015738	ATACC	2	10	1086888	1086897	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015738	GTATT	2	10	1087116	1087125	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015738	GAATC	2	10	1087383	1087392	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015738	ATAAC	2	10	1087491	1087500	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015738	TCGTG	2	10	1088553	1088562	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015738	CCTGT	2	10	1088597	1088606	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015738	TCGGA	2	10	1088784	1088793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015738	ACGGC	2	10	1092135	1092144	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015738	ATCGC	2	10	1120717	1120726	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015738	AAATC	2	10	1123880	1123889	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015738	AAAGA	2	10	1123928	1123937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015738	TCTCC	2	10	1134928	1134937	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_015738	CTTTG	2	10	1171125	1171134	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015738	AACGC	2	10	1174415	1174424	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015738	TACTA	2	10	1177527	1177536	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015738	GTGGC	2	10	1189619	1189628	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015738	GGGAA	2	10	1256978	1256987	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015738	CTGAT	2	10	1259606	1259615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015738	TCTCC	2	10	1265066	1265075	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_015738	CGTCT	2	10	1270316	1270325	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_015738	ATACT	2	10	1270331	1270340	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015738	CAAAA	2	10	1273977	1273986	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015738	GGGAG	2	10	1274128	1274137	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015738	GGTTT	2	10	1280591	1280600	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015738	TTCGA	2	10	1280852	1280861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015738	TTCTT	2	10	1282590	1282599	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015738	AATGT	2	10	1295529	1295538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015738	CCCGT	2	10	1301870	1301879	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_015738	TTTGT	2	10	1359772	1359781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015738	TGAAA	2	10	1363845	1363854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015738	GCATG	2	10	1375743	1375752	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015738	ATCTC	2	10	1386614	1386623	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015738	TCTGC	2	10	1407600	1407609	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015738	GAGCG	2	10	1419296	1419305	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_015738	TGCTT	2	10	2672602	2672611	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
284	NC_015738	TCTTT	2	10	2674068	2674077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_015738	TCTTG	2	10	2688603	2688612	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_015738	TTACC	2	10	2693650	2693659	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
287	NC_015738	CCTTC	2	10	2716781	2716790	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
288	NC_015738	TGCCA	2	10	2723551	2723560	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_015738	CGCTG	2	10	2736276	2736285	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
290	NC_015738	GACTT	2	10	2767409	2767418	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_015738	CTGTA	2	10	2770812	2770821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_015738	ATGCG	2	10	2772416	2772425	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
293	NC_015738	ACCTC	2	10	2775121	2775130	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
294	NC_015738	CCTGG	2	10	2777528	2777537	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
295	NC_015738	AGTGA	2	10	2782685	2782694	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015738	ATACC	2	10	2786546	2786555	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
297	NC_015738	AGAAT	2	10	2797203	2797212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015738	GTCGA	2	10	2802433	2802442	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
299	NC_015738	TATCA	2	10	2815248	2815257	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_015738	ATTTC	2	10	2822741	2822750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_015738	AGGGA	2	10	2830808	2830817	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
302	NC_015738	TCACT	2	10	2833836	2833845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
303	NC_015738	AAACG	2	10	2852260	2852269	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
304	NC_015738	GGAAG	2	10	2855427	2855436	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
305	NC_015738	TCCTT	2	10	2871079	2871088	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
306	NC_015738	ACCGA	2	10	2871711	2871720	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
307	NC_015738	ACACG	2	10	2875446	2875455	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
308	NC_015738	TTGGC	2	10	2883258	2883267	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
309	NC_015738	TATGT	2	10	2889671	2889680	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
310	NC_015738	TTGAC	2	10	2890419	2890428	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
311	NC_015738	ACCTG	2	10	2910641	2910650	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
312	NC_015738	CCTGA	2	10	2910738	2910747	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
313	NC_015738	TCCCT	2	10	2926336	2926345	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
314	NC_015738	TTCTT	2	10	2928792	2928801	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
315	NC_015738	ATTCG	2	10	2957844	2957853	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
316	NC_015738	TCGTT	2	10	2960340	2960349	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
317	NC_015738	TTCTT	2	10	2964016	2964025	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
318	NC_015738	GATAA	2	10	2964063	2964072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
319	NC_015738	AAAAG	2	10	2964577	2964586	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
320	NC_015738	AATTG	2	10	2966530	2966539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
321	NC_015738	GAGCG	2	10	2973964	2973973	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
322	NC_015738	AGCGA	2	10	2974006	2974015	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
323	NC_015738	AGGAA	2	10	2974475	2974484	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
324	NC_015738	TCCCT	2	10	3016557	3016566	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
325	NC_015738	AACAC	2	10	3026107	3026116	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
326	NC_015738	TGGCG	2	10	3030563	3030572	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
327	NC_015738	TCGGC	2	10	3032334	3032343	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
328	NC_015738	GAATT	2	10	3032663	3032672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
329	NC_015738	GCAAG	2	10	3042521	3042530	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
330	NC_015738	GTCAA	2	10	3053927	3053936	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
331	NC_015738	AAAGA	2	10	3054352	3054361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
332	NC_015738	AGGGG	2	10	3066060	3066069	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
333	NC_015738	CTTCG	2	10	3073499	3073508	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
334	NC_015738	GCAGG	2	10	3089778	3089787	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
335	NC_015738	ACGAA	2	10	3089804	3089813	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
336	NC_015738	GTTCG	2	10	3092893	3092902	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
337	NC_015738	GCCCC	2	10	3092903	3092912	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
338	NC_015738	AAGGA	2	10	3118427	3118436	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
339	NC_015738	CACAA	2	10	3122027	3122036	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.