MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015601	TTTAA	2	10	45617	45626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015601	TAAAA	2	10	55730	55739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015601	GTTAT	2	10	66859	66868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015601	ATCAA	2	10	78475	78484	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015601	GGTAA	2	10	78960	78969	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015601	TCGTG	2	10	79763	79772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015601	AGAAA	2	10	80346	80355	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015601	GAAAA	2	10	80765	80774	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015601	GCAAA	2	10	82081	82090	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015601	GGTAA	2	10	84392	84401	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015601	TCGTG	2	10	85195	85204	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015601	AGAAA	2	10	85778	85787	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015601	GAAAA	2	10	86197	86206	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015601	GCAAA	2	10	87513	87522	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015601	GTTTT	2	10	89102	89111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015601	AGGAG	2	10	96070	96079	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015601	ATAAA	2	10	98505	98514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015601	ATTTT	2	10	124642	124651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015601	TTTTA	2	10	146019	146028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015601	TAGAA	2	10	196037	196046	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015601	TAGAA	2	10	202206	202215	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015601	AAAAG	2	10	214727	214736	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015601	CAGAA	2	10	223556	223565	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015601	TTCCT	2	10	237768	237777	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015601	AGCAT	2	10	238415	238424	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015601	ATTTG	2	10	319931	319940	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015601	TGGAT	2	10	330868	330877	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015601	ATGAA	2	10	331002	331011	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015601	GTAAA	2	10	331377	331386	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015601	AGAAA	2	10	339161	339170	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015601	AGAAA	2	10	342316	342325	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015601	TTGAT	2	10	350101	350110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015601	TATAA	2	10	361427	361436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015601	GGTAT	2	10	378223	378232	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015601	TGGTA	2	10	378555	378564	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015601	GAAAC	2	10	392200	392209	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015601	CTTTT	2	10	393792	393801	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015601	AAAGA	2	10	393810	393819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015601	GATAT	2	10	408036	408045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015601	ATGAT	2	10	414885	414894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015601	ATAAA	2	10	418763	418772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015601	AATCG	2	10	422557	422566	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015601	GTATC	2	10	423465	423474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015601	TTTTA	2	10	424096	424105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015601	AAAGA	2	10	431277	431286	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015601	TATAA	2	10	433985	433994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015601	ACAAA	2	10	442265	442274	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015601	TTAAC	2	10	443399	443408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015601	AAATA	2	10	446191	446200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015601	GGTAA	2	10	446639	446648	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015601	TCGTG	2	10	447442	447451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015601	AGAAA	2	10	448025	448034	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015601	GAAAA	2	10	448444	448453	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015601	GCAAA	2	10	449760	449769	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015601	TGATA	2	10	467943	467952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015601	TTTTA	2	10	494752	494761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015601	GAATA	2	10	494866	494875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015601	TAATT	2	10	507032	507041	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015601	AAAGA	2	10	537187	537196	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015601	CTTTT	2	10	563383	563392	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015601	TGATA	2	10	578754	578763	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015601	TATAA	2	10	591167	591176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015601	AATTT	2	10	606936	606945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015601	TAGAA	2	10	625638	625647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015601	ATTGT	2	10	662321	662330	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015601	ATAAA	2	10	671979	671988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015601	ACTCA	2	10	723699	723708	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015601	TTTAA	2	10	723765	723774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015601	AATTA	2	10	733503	733512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015601	TTAAT	2	10	743749	743758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015601	TCAAA	2	10	747049	747058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015601	AGTGC	2	10	747185	747194	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015601	ATAGG	2	10	748930	748939	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015601	TATAA	2	10	753247	753256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015601	GGTAT	2	10	756678	756687	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015601	TTGGT	2	10	756981	756990	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015601	ATGAT	2	10	756991	757000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015601	CTTGA	2	10	757087	757096	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015601	TAAAT	2	10	758459	758468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015601	CCAAA	2	10	767525	767534	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015601	GGCAT	2	10	767593	767602	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015601	GAGAC	2	10	776545	776554	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015601	ATTTT	3	15	779297	779311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015601	ACATA	2	10	817694	817703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015601	GAGAA	2	10	825505	825514	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015601	CGATT	2	10	832756	832765	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015601	CTTAA	2	10	836775	836784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015601	TATAA	2	10	850438	850447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015601	GAAAC	2	10	850646	850655	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015601	ATTGG	2	10	854598	854607	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015601	TATAG	2	10	861270	861279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015601	GATAT	2	10	861360	861369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015601	TAAAC	2	10	887360	887369	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015601	AATGA	2	10	905414	905423	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015601	TCAAA	2	10	989479	989488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015601	AAACG	2	10	1007316	1007325	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015601	CCCTG	2	10	1017582	1017591	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_015601	CAATT	2	10	1018458	1018467	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015601	TATCG	2	10	1063621	1063630	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015601	CTTTG	2	10	1119220	1119229	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015601	TCGGT	2	10	1119991	1120000	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015601	TTTTC	2	10	1120537	1120546	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015601	CACGA	2	10	1121539	1121548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_015601	TTACC	2	10	1122342	1122351	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015601	CTTTG	2	10	1124652	1124661	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015601	TCGGT	2	10	1125423	1125432	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015601	TTTTC	2	10	1125969	1125978	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015601	CACGA	2	10	1126971	1126980	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015601	TTACC	2	10	1127774	1127783	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015601	CTTTG	2	10	1130084	1130093	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015601	TCGGT	2	10	1130855	1130864	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015601	TTTTC	2	10	1131401	1131410	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015601	CACGA	2	10	1132403	1132412	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015601	TTACC	2	10	1133206	1133215	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015601	CTTTG	2	10	1135516	1135525	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015601	TCGGT	2	10	1136287	1136296	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015601	TTTTC	2	10	1136833	1136842	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015601	CACGA	2	10	1137835	1137844	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015601	TTACC	2	10	1138638	1138647	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015601	TATCA	2	10	1148895	1148904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015601	TAAAA	2	10	1172880	1172889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015601	TTTCA	2	10	1180368	1180377	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015601	ATTAT	2	10	1181300	1181309	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015601	TTTTA	2	10	1193046	1193055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015601	TCCTG	2	10	1199572	1199581	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015601	ATTTG	2	10	1202969	1202978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015601	GAAAA	2	10	1212113	1212122	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015601	AAATT	2	10	1213921	1213930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015601	TATAA	2	10	1214511	1214520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015601	AATGA	2	10	1215912	1215921	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015601	AACTT	2	10	1224815	1224824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015601	TAACT	2	10	1251908	1251917	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015601	TATAG	2	10	1257435	1257444	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015601	AAATC	2	10	1263156	1263165	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015601	TGTCA	2	10	1299275	1299284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015601	ATGAT	2	10	1323681	1323690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015601	TCACC	2	10	1327859	1327868	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_015601	TATCA	2	10	1327871	1327880	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015601	TTACG	2	10	1329308	1329317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015601	CATAG	2	10	1333523	1333532	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015601	TCAAA	2	10	1333546	1333555	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015601	TAATC	2	10	1333637	1333646	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015601	CAATT	2	10	1334565	1334574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015601	TTATT	2	10	1335202	1335211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015601	ATATT	2	10	1342725	1342734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015601	TATCA	2	10	1343550	1343559	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015601	TGGTA	2	10	1343588	1343597	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015601	TTATG	2	10	1351052	1351061	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015601	TAAAA	2	10	1351743	1351752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_015601	TATAA	2	10	1375761	1375770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015601	TAAAA	2	10	1389849	1389858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015601	GTTAT	2	10	1402715	1402724	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015601	TTAGT	2	10	1406662	1406671	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015601	TAAAA	2	10	1420663	1420672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015601	ATCAT	2	10	1422035	1422044	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_015601	TTTAT	2	10	1430054	1430063	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015601	CCTTT	2	10	1438054	1438063	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_015601	ATGTT	2	10	1442626	1442635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015601	TTCAA	2	10	1495746	1495755	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_015601	TCGGT	2	10	1495857	1495866	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_015601	TCCAT	2	10	1500518	1500527	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_015601	TATCA	2	10	1513214	1513223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_015601	AAGAA	2	10	1532105	1532114	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015601	ATTCT	2	10	1537546	1537555	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_015601	AATTG	2	10	1601967	1601976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015601	CAAAC	2	10	1603012	1603021	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_015601	AGTAG	2	10	1615102	1615111	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015601	ATATC	2	10	1652602	1652611	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_015601	CTCTT	2	10	1661945	1661954	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
187	NC_015601	TTTCA	2	10	1666142	1666151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_015601	CATAA	2	10	1681637	1681646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_015601	ATAAA	2	10	1721329	1721338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015601	TCAAT	2	10	1741772	1741781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_015601	CTATT	2	10	1751775	1751784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_015601	CATCG	2	10	1773991	1774000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.