MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 4615

< Previous12345678910Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015601	ATAAA	2	10	1721329	1721338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_015601	T	8	8	1721349	1721356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015601	ATC	2	6	1723566	1723571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_015601	TAA	2	6	1723587	1723592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_015601	AT	3	6	1724097	1724102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_015601	CCT	2	6	1726377	1726382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_015601	TTGATA	2	12	1726389	1726400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015601	TAG	2	6	1726413	1726418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015601	A	8	8	1726437	1726444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015601	CTT	2	6	1728233	1728238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_015601	AC	3	6	1728242	1728247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_015601	ATC	2	6	1728265	1728270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_015601	TA	3	6	1728330	1728335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015601	CATTAA	2	12	1728362	1728373	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4515	NC_015601	A	6	6	1728399	1728404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_015601	ATC	2	6	1728419	1728424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_015601	GT	3	6	1738475	1738480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_015601	A	8	8	1738510	1738517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015601	A	8	8	1740762	1740769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_015601	TTG	2	6	1740787	1740792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_015601	GAA	2	6	1741665	1741670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015601	TTTG	2	8	1741684	1741691	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015601	AAT	2	6	1741695	1741700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015601	TTGT	2	8	1741713	1741720	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015601	A	6	6	1741738	1741743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015601	TCAAT	2	10	1741772	1741781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4527	NC_015601	ATT	2	6	1742267	1742272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015601	CT	3	6	1742275	1742280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_015601	TAT	2	6	1742293	1742298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_015601	AATT	2	8	1742314	1742321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015601	T	8	8	1742341	1742348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015601	AAT	2	6	1742370	1742375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015601	TA	4	8	1742402	1742409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015601	T	7	7	1742416	1742422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015601	T	7	7	1742439	1742445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_015601	TCT	2	6	1742478	1742483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_015601	TTA	3	9	1742484	1742492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015601	T	8	8	1742520	1742527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015601	ATT	2	6	1742528	1742533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015601	AAAT	2	8	1742540	1742547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015601	T	6	6	1742558	1742563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015601	ATG	2	6	1744018	1744023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015601	AAGT	2	8	1744041	1744048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_015601	AG	3	6	1744065	1744070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015601	GATG	2	8	1744089	1744096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015601	TAA	2	6	1744221	1744226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_015601	GGT	2	6	1744232	1744237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_015601	T	6	6	1744270	1744275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015601	AGG	2	6	1744283	1744288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015601	A	6	6	1748001	1748006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_015601	A	8	8	1750211	1750218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_015601	CTATT	2	10	1751775	1751784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4553	NC_015601	TTA	2	6	1755559	1755564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015601	ATC	2	6	1755575	1755580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_015601	CAA	2	6	1755643	1755648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015601	A	6	6	1755672	1755677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015601	TACA	2	8	1758204	1758211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_015601	CAA	2	6	1758270	1758275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_015601	A	7	7	1758311	1758317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015601	ATTA	2	8	1758343	1758350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_015601	T	6	6	1760162	1760167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015601	ATA	2	6	1760268	1760273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_015601	TTG	2	6	1760310	1760315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015601	TAAT	2	8	1760350	1760357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015601	TAC	2	6	1760375	1760380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_015601	ATG	2	6	1760388	1760393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_015601	T	7	7	1760399	1760405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015601	AAG	2	6	1760442	1760447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015601	AAT	2	6	1760536	1760541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015601	A	7	7	1760571	1760577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015601	ACA	2	6	1763458	1763463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_015601	TTAT	2	8	1763491	1763498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_015601	ATG	2	6	1763519	1763524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015601	AGG	2	6	1763555	1763560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015601	A	7	7	1766799	1766805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015601	TCC	2	6	1769401	1769406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_015601	TTTA	2	8	1769489	1769496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015601	CCT	2	6	1773885	1773890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_015601	ATT	2	6	1773931	1773936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015601	ATT	2	6	1773957	1773962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015601	T	7	7	1773982	1773988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015601	CATCG	2	10	1773991	1774000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4583	NC_015601	CACT	2	8	1774073	1774080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_015601	TGA	2	6	1774513	1774518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015601	A	6	6	1774529	1774534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_015601	T	7	7	1774549	1774555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_015601	ATC	2	6	1774960	1774965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_015601	CTT	2	6	1778461	1778466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_015601	TG	3	6	1778508	1778513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_015601	ATT	2	6	1778528	1778533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_015601	GAA	2	6	1778545	1778550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015601	T	6	6	1779330	1779335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_015601	AT	3	6	1779371	1779376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_015601	A	7	7	1780415	1780421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_015601	CTC	2	6	1780780	1780785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_015601	T	6	6	1780790	1780795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_015601	TTTA	2	8	1780801	1780808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_015601	A	6	6	1780835	1780840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_015601	TCC	2	6	1785093	1785098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_015601	A	6	6	1785106	1785111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_015601	TCC	2	6	1785749	1785754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4602	NC_015601	A	6	6	1786981	1786986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_015601	ACC	2	6	1787146	1787151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_015601	TA	4	8	1787162	1787169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015601	TA	3	6	1787192	1787197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_015601	ATC	2	6	1787296	1787301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015601	T	7	7	1787336	1787342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_015601	T	8	8	1787345	1787352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015601	A	7	7	1787385	1787391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015601	GTT	2	6	1787491	1787496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015601	TGGA	2	8	1787542	1787549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015601	ATA	2	6	1787647	1787652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015601	CTAT	2	8	1787804	1787811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_015601	TG	3	6	1787846	1787851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015601	T	7	7	1787868	1787874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12345678910Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.