MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ethanoligenens harbinense YUAN-3 chromosome

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014828	TGCAGA	2	12	33	44	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014828	CAAATT	2	12	38947	38958	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014828	TACATA	2	12	51073	51084	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014828	AAACGG	2	12	82819	82830	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014828	GAACCT	2	12	126769	126780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014828	CATTCG	2	12	129298	129309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014828	TGCAAA	2	12	130274	130285	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014828	TATCCA	2	12	153897	153908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014828	TTCCTG	2	12	159126	159137	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014828	ATCCAT	2	12	192761	192772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014828	GGGCGC	2	12	199155	199166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014828	ACAAAA	2	12	219738	219749	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014828	GACTCC	2	12	270042	270053	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014828	TTTTTG	2	12	270233	270244	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014828	CGTCTC	2	12	271009	271020	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014828	GAGGCA	2	12	359366	359377	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014828	CTGTTC	2	12	395465	395476	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014828	CGAAAA	2	12	453537	453548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014828	AGCGAG	2	12	454745	454756	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014828	TCCTTA	2	12	471639	471650	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014828	AAAGGA	2	12	487045	487056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014828	CGTTTT	2	12	547506	547517	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014828	TTTGAG	2	12	547957	547968	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014828	CGAAAT	2	12	556295	556306	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014828	ACGCCA	2	12	556633	556644	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014828	TGCCGG	2	12	597030	597041	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014828	CGTTTG	2	12	604171	604182	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014828	AATTAT	2	12	613734	613745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014828	TATTTT	2	12	623497	623508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014828	CGGAGG	2	12	629435	629446	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014828	CATTTT	2	12	646872	646883	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014828	TGAATA	2	12	660706	660717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014828	TTGGAT	2	12	675767	675778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014828	AGGGCA	2	12	681425	681436	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014828	CATTTC	2	12	682658	682669	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014828	TGGATA	2	12	723493	723504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014828	GATATA	2	12	733784	733795	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014828	TGTAGT	2	12	764480	764491	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014828	CTATTT	2	12	773979	773990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014828	CTGCCG	2	12	816508	816519	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014828	AAGCGA	2	12	862305	862316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014828	TTGGAT	2	12	876659	876670	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014828	CTGCGG	2	12	878484	878495	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014828	TTATAC	2	12	879614	879625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014828	AAAGAA	2	12	886410	886421	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014828	GCCATA	2	12	896064	896075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014828	CTGTTT	2	12	900623	900634	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014828	GCCATT	2	12	925446	925457	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014828	GAAACG	2	12	934828	934839	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014828	TTACTT	2	12	971751	971762	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014828	GCGGGC	2	12	975962	975973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014828	CCAAAA	2	12	976685	976696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014828	CGGGTA	2	12	1013926	1013937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014828	GTCGTT	2	12	1037425	1037436	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014828	ATATGC	2	12	1075579	1075590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014828	ATTTGG	2	12	1077183	1077194	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014828	ATTTTA	2	12	1104221	1104232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014828	GCCGCA	2	12	1111343	1111354	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014828	AGGCGC	2	12	1117247	1117258	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014828	TGCAAA	2	12	1147742	1147753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014828	ATATGT	2	12	1201876	1201887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014828	ATAAAA	2	12	1211724	1211735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014828	CTTTTG	3	18	1249431	1249448	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014828	GGATGC	2	12	1249469	1249480	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014828	CAAAAG	2	12	1251951	1251962	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014828	AATAAA	2	12	1298511	1298522	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014828	CAGAGT	2	12	1298614	1298625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014828	AAACAA	2	12	1368869	1368880	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014828	GGCGGA	2	12	1369538	1369549	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014828	AATCAT	2	12	1395964	1395975	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014828	GAAAAT	2	12	1460217	1460228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014828	CGTTTC	2	12	1474486	1474497	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014828	CAAAAC	2	12	1507191	1507202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014828	TTGTAT	2	12	1538886	1538897	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014828	GAAAAA	2	12	1547352	1547363	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014828	TTACGT	2	12	1642473	1642484	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014828	AAACCC	2	12	1644979	1644990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014828	GAAACA	2	12	1700384	1700395	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014828	TTTTTC	2	12	1719672	1719683	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014828	CCCGCG	2	12	1724112	1724123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014828	ATTTTA	2	12	1824554	1824565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014828	CTGCCG	2	12	1859612	1859623	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014828	CGTTTT	2	12	1902189	1902200	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014828	GGTTCC	2	12	1919586	1919597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014828	AAAGCC	2	12	2049659	2049670	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014828	TGAAAA	2	12	2087333	2087344	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014828	TGCGGT	2	12	2092571	2092582	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014828	AGCAAG	2	12	2092795	2092806	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014828	GCCTTT	2	12	2093655	2093666	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014828	AAAGCA	2	12	2124005	2124016	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014828	AAGCCG	2	12	2127983	2127994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014828	ATAAAA	2	12	2177695	2177706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014828	CCTTTC	2	12	2217975	2217986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014828	CTCGCT	2	12	2302573	2302584	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014828	TTTTCG	2	12	2303783	2303794	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014828	GCCGTC	2	12	2329364	2329375	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014828	GGCCCG	2	12	2329424	2329435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014828	CTTTTT	2	12	2354111	2354122	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014828	TGCTTT	2	12	2361279	2361290	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014828	ACTGGT	2	12	2361430	2361441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014828	GCATAC	2	12	2364421	2364432	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014828	AGATGG	2	12	2370549	2370560	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014828	CGTATT	2	12	2387989	2388000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014828	TTGTAT	2	12	2403809	2403820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014828	TATACA	3	18	2409574	2409591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014828	TGCAAG	2	12	2424276	2424287	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014828	ATCAGC	2	12	2429947	2429958	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014828	GATGCA	2	12	2444379	2444390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014828	AAGCCA	2	12	2528596	2528607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014828	TAAATG	2	12	2537717	2537728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014828	TATTTT	2	12	2538867	2538878	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014828	CGGTGC	2	12	2540499	2540510	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014828	TCCGGT	2	12	2541235	2541246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014828	GACCGT	2	12	2556023	2556034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014828	CTCCTG	2	12	2560308	2560319	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014828	CAAATA	2	12	2561039	2561050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014828	TTCCAA	2	12	2592133	2592144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014828	ATATCT	2	12	2596981	2596992	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014828	TGGTAG	2	12	2623025	2623036	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014828	GGAAAA	2	12	2636536	2636547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014828	GTGTAC	2	12	2637083	2637094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014828	GCTTTT	2	12	2686442	2686453	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014828	GCGGGC	2	12	2735148	2735159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014828	TGCGGT	2	12	2741161	2741172	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014828	GCGGCA	2	12	2795506	2795517	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014828	GGAAAT	2	12	2808211	2808222	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014828	GCCCCG	2	12	2857241	2857252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014828	ACCGAC	2	12	2926487	2926498	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014828	CTCGCT	2	12	2982773	2982784	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014828	TTTTCG	2	12	2983983	2983994	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.