MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium limosum KIST612 chromosome

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014624	AGACCG	2	12	29370	29381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014624	TAAAAA	2	12	46741	46752	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014624	GTTGAA	2	12	153190	153201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014624	CCAAAT	2	12	173375	173386	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014624	AAGCGA	2	12	181763	181774	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014624	GTTTTT	2	12	208669	208680	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014624	CTAAAA	2	12	244040	244051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014624	AAAGGA	2	12	359592	359603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014624	ATCGGC	2	12	393006	393017	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014624	AGCAAA	2	12	438020	438031	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014624	GAATTT	2	12	483328	483339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014624	TTACCT	2	12	483984	483995	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014624	CATTAT	2	12	489392	489403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014624	TTGACG	2	12	503231	503242	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014624	TGTTTT	2	12	597088	597099	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014624	CACAGT	2	12	603972	603983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014624	CAGAAT	2	12	619234	619245	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014624	TAAGGA	2	12	624754	624765	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014624	GAAGGA	2	12	748300	748311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014624	TCTTTT	2	12	784946	784957	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014624	GAGAAA	2	12	789052	789063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014624	TTCTGC	2	12	828715	828726	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014624	AAAGAA	2	12	858496	858507	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014624	TAAAAT	2	12	864076	864087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014624	AATATA	2	12	892714	892725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014624	AATTTA	2	12	925147	925158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014624	TAAAAA	2	12	941385	941396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014624	AAGCGA	2	12	946480	946491	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014624	GATAAT	2	12	954563	954574	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014624	AAAAGC	2	12	954630	954641	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014624	AATTTG	2	12	958989	959000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014624	TGCCCT	2	12	959852	959863	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014624	AAGCTC	2	12	968720	968731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014624	ATTAAA	2	12	1015229	1015240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014624	CAGCCC	2	12	1025684	1025695	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014624	TATAAA	2	12	1041004	1041015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014624	GGAAGA	2	12	1123112	1123123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014624	TTATAA	2	12	1151670	1151681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014624	GCTGTC	2	12	1208326	1208337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014624	ATGTTC	2	12	1208423	1208434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014624	GCTGCC	2	12	1208728	1208739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014624	AAGAAA	2	12	1221781	1221792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014624	AGCAAG	2	12	1229689	1229700	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014624	ATTTTA	2	12	1268942	1268953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014624	CGAAAA	2	12	1304322	1304333	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014624	TAACTT	2	12	1330382	1330393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014624	GGCCGC	2	12	1351564	1351575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014624	GGCAGG	2	12	1363586	1363597	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014624	CCTTGA	2	12	1394548	1394559	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014624	GCCGGA	2	12	1441559	1441570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014624	AGAGGC	2	12	1449647	1449658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014624	GGATTA	2	12	1467695	1467706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014624	TGAAAA	2	12	1499307	1499318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014624	CAGCTT	2	12	1561515	1561526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014624	TCAAAG	2	12	1569440	1569451	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014624	TGTATA	2	12	1605306	1605317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014624	GATTCA	2	12	1614753	1614764	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014624	GAAAGC	2	12	1674562	1674573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014624	ATGAAG	2	12	1680275	1680286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014624	TTTTTA	2	12	1681161	1681172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014624	ATTTTT	3	18	1681281	1681298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014624	AATACG	2	12	1710527	1710538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014624	AGAAAA	2	12	1710704	1710715	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014624	TCCTAC	2	12	1742417	1742428	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014624	GGATAC	2	12	1742651	1742662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014624	ATTTTT	2	12	1745018	1745029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014624	TTCCGT	2	12	1881577	1881588	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014624	AATATA	2	12	1901155	1901166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014624	ATCAGG	2	12	1930741	1930752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014624	ATTTAT	2	12	1946598	1946609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014624	TCTGGA	2	12	1964924	1964935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014624	AGATCA	2	12	2016160	2016171	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014624	ACGTTG	2	12	2065668	2065679	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014624	CTGATA	2	12	2072368	2072379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014624	TTTAGT	2	12	2125588	2125599	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014624	CTTTTT	2	12	2165512	2165523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014624	ATCTTT	2	12	2175372	2175383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014624	TTTCTT	2	12	2186238	2186249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014624	TGTTAT	2	12	2208740	2208751	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014624	TTTTTG	2	12	2208788	2208799	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014624	TGAAAA	2	12	2231499	2231510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014624	TATTTT	2	12	2242298	2242309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014624	AATTTA	2	12	2242475	2242486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014624	AAAGCC	2	12	2314498	2314509	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014624	TTTGTT	2	12	2342850	2342861	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014624	TTAAGC	2	12	2348993	2349004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014624	GTTATT	2	12	2431416	2431427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014624	TTCTTT	2	12	2557806	2557817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014624	TTTTTA	2	12	2573953	2573964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014624	TTCTAA	2	12	2579230	2579241	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014624	TATACC	2	12	2642452	2642463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014624	AAGGGC	2	12	2661243	2661254	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014624	CACCTT	2	12	2664796	2664807	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014624	TCGCTT	2	12	2691799	2691810	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014624	CGTTCA	2	12	2720058	2720069	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014624	GCTGAA	2	12	2724164	2724175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014624	ATTTTT	2	12	2726366	2726377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014624	AAAAAG	2	12	2850201	2850212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014624	CAATGG	2	12	2855313	2855324	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014624	TTTTAT	2	12	2865272	2865283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014624	CTTTTT	2	12	2919250	2919261	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014624	CTTATA	2	12	3008373	3008384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014624	ATGTCC	2	12	3041151	3041162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014624	TGAAGC	2	12	3041173	3041184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014624	AGGTAT	2	12	3041329	3041340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014624	GCCAGG	2	12	3041709	3041720	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014624	GCTTTT	2	12	3066288	3066299	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014624	GTTCCA	2	12	3170726	3170737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014624	TTTAGG	2	12	3170889	3170900	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014624	TAAAAA	2	12	3222511	3222522	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014624	TTTGAA	2	12	3229044	3229055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014624	GTTTAA	2	12	3231436	3231447	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014624	AATAAA	2	12	3255546	3255557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014624	CAAAAA	2	12	3354749	3354760	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014624	ATTTCA	2	12	3358378	3358389	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014624	ACTTTT	2	12	3372814	3372825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014624	TTTTTA	2	12	3382607	3382618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014624	GCAGAA	2	12	3386104	3386115	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014624	ATTTTT	2	12	3411182	3411193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014624	TAAAAA	2	12	3415706	3415717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014624	TTAATC	2	12	3456997	3457008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014624	CACATA	2	12	3474257	3474268	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014624	ATTTAA	2	12	3543177	3543188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014624	TATTCA	2	12	3546090	3546101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014624	TAAAAA	2	12	3553484	3553495	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014624	TTCAAA	2	12	3567164	3567175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014624	TACAAT	2	12	3583160	3583171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014624	GCTTAA	2	12	3613629	3613640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014624	TCGCTT	2	12	3616075	3616086	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014624	GTTTTT	2	12	3663852	3663863	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014624	TTAGTT	2	12	3672598	3672609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014624	ACATTT	2	12	3706160	3706171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014624	TTTAAA	2	12	3709452	3709463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014624	TTTTTA	2	12	3732762	3732773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014624	GGCATA	2	12	3737442	3737453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014624	TAAATT	2	12	3745725	3745736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014624	TTATTT	2	12	3768335	3768346	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014624	TGAAAA	2	12	3824715	3824726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014624	TTTGTT	2	12	3846150	3846161	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014624	GATTTT	2	12	3927571	3927582	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014624	AACTTC	2	12	3936263	3936274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_014624	ATTCCA	2	12	3959626	3959637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014624	TTATTT	2	12	3997325	3997336	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014624	GAACTT	2	12	4022040	4022051	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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147	NC_014624	TGGCTT	2	12	4034036	4034047	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_014624	ATTTTT	2	12	4047498	4047509	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014624	TTTTAT	2	12	4047707	4047718	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014624	AAACTA	2	12	4068300	4068311	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014624	TCATAT	2	12	4101327	4101338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_014624	TCGCTT	2	12	4116424	4116435	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014624	TTTTAT	2	12	4186210	4186221	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014624	AGTCAA	2	12	4212801	4212812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_014624	GAGATT	2	12	4237248	4237259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014624	ATAAAA	2	12	4304618	4304629	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.