MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium limosum KIST612 chromosome

Total Repeats: 488

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014624	TAAAA	2	10	62872	62881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014624	ATTTT	2	10	77242	77251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014624	TATAA	2	10	80216	80225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014624	AATTA	2	10	80316	80325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014624	TATGC	2	10	85475	85484	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014624	AAAAG	2	10	98719	98728	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014624	ATTTT	2	10	100093	100102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014624	AAAAT	2	10	102204	102213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014624	TTGCA	2	10	109834	109843	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014624	TTTAT	2	10	110296	110305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014624	AAAAC	2	10	125261	125270	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014624	AGAAA	2	10	126216	126225	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014624	TAAAA	2	10	126277	126286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014624	TTAAT	2	10	135970	135979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014624	CTTTT	2	10	137723	137732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014624	AAAAC	2	10	150207	150216	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014624	TTAAA	2	10	150591	150600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014624	GTTGA	2	10	150627	150636	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014624	GGATT	2	10	151260	151269	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014624	TATTT	2	10	152984	152993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014624	GAAAA	2	10	155443	155452	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014624	ATTAT	2	10	168414	168423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014624	TCGTG	2	10	180462	180471	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014624	AAAAC	2	10	181112	181121	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014624	GGGAG	2	10	181630	181639	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014624	AAGAG	2	10	182374	182383	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014624	AGTGA	2	10	182407	182416	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014624	CCGTA	2	10	182739	182748	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014624	TAAGA	2	10	183884	183893	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014624	TCGAG	2	10	188062	188071	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014624	ATTTG	2	10	194495	194504	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014624	CTTTT	2	10	215370	215379	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014624	CAACC	2	10	221578	221587	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_014624	TAAAT	2	10	221653	221662	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014624	TGGAG	2	10	228639	228648	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014624	AAAAG	2	10	228664	228673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014624	GCTGT	2	10	228693	228702	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014624	ATTTT	2	10	228946	228955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014624	GATTT	2	10	236637	236646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014624	TAATA	2	10	243828	243837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014624	ATTAT	2	10	243851	243860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014624	AAAGA	2	10	243923	243932	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014624	CTTTT	2	10	248974	248983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014624	AATAA	2	10	252798	252807	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014624	TGATT	2	10	259534	259543	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014624	TATAA	2	10	260041	260050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014624	TTTCC	2	10	276563	276572	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014624	TAATT	2	10	280262	280271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014624	TTCAA	2	10	286559	286568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014624	TATAT	2	10	290074	290083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014624	GAAAA	2	10	290101	290110	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014624	TAAAA	2	10	290942	290951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014624	GTAAA	2	10	291021	291030	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014624	AAATT	2	10	319371	319380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014624	ATAAG	2	10	325638	325647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014624	CAGCC	2	10	332117	332126	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_014624	AATTT	2	10	332610	332619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014624	AAATT	2	10	358125	358134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014624	AGCAT	2	10	359514	359523	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014624	TTTAT	2	10	363763	363772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014624	ATGAA	2	10	378014	378023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014624	TATAA	3	15	402629	402643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014624	TTTAA	2	10	403634	403643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014624	ATTTT	2	10	422629	422638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014624	AAATA	2	10	424102	424111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014624	CGGCG	2	10	424356	424365	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014624	ACCGT	2	10	444030	444039	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014624	TAAGA	2	10	445821	445830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014624	AAAAT	2	10	455772	455781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014624	AATAA	2	10	477660	477669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014624	TTTTG	2	10	487328	487337	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014624	GGGAT	2	10	489012	489021	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014624	AAAAT	2	10	498872	498881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014624	TTTAT	2	10	500178	500187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014624	TAAAA	2	10	505986	505995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014624	ATTTT	2	10	520353	520362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014624	ATAAC	2	10	531248	531257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014624	ATTAA	2	10	534621	534630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014624	AATTC	2	10	544304	544313	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014624	AAACA	2	10	547853	547862	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014624	TAAAA	2	10	548953	548962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014624	AGGAA	2	10	558342	558351	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014624	AACGA	2	10	559723	559732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014624	TACTT	2	10	565540	565549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014624	TATAA	2	10	566026	566035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014624	ATAGA	2	10	569099	569108	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014624	TTTTA	2	10	634481	634490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014624	ATACT	2	10	665089	665098	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014624	ATAAA	2	10	690016	690025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014624	TTTTA	2	10	698472	698481	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014624	AGTGA	2	10	702636	702645	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014624	AAATA	2	10	706721	706730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014624	AGGTA	2	10	727743	727752	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014624	AAGCA	2	10	732784	732793	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014624	TTAAT	2	10	748183	748192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014624	AGAAA	2	10	771285	771294	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014624	TTATA	2	10	772325	772334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014624	GAATT	2	10	781396	781405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014624	AAATA	2	10	782046	782055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014624	ATATA	2	10	789015	789024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014624	ATAAA	2	10	808217	808226	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014624	TGGGT	2	10	828610	828619	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014624	TTGCG	2	10	845980	845989	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014624	ATATA	2	10	852986	852995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014624	CCCGT	2	10	854812	854821	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_014624	AACCC	2	10	861356	861365	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_014624	ATTAA	2	10	861566	861575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014624	CCCTT	2	10	874527	874536	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_014624	TAAAA	2	10	874575	874584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014624	ATATA	2	10	878970	878979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014624	TCTTT	2	10	895143	895152	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014624	ACCCC	2	10	934555	934564	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
113	NC_014624	TCGTG	2	10	944879	944888	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014624	AAAAC	2	10	945829	945838	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014624	GGGAG	2	10	946347	946356	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014624	AAGAG	2	10	947091	947100	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014624	AGTGA	2	10	947124	947133	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014624	CCGTA	2	10	947456	947465	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014624	TAAGA	2	10	948601	948610	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014624	TGGTT	2	10	959048	959057	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014624	GATCA	2	10	968195	968204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014624	GCATA	2	10	968921	968930	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014624	CTTGA	2	10	982459	982468	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014624	AATAC	2	10	996291	996300	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014624	AGAAA	2	10	997611	997620	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014624	TAATA	2	10	1041066	1041075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014624	AAGTA	2	10	1050470	1050479	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014624	AAAAC	2	10	1050577	1050586	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014624	AATGC	2	10	1055694	1055703	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014624	TTGGT	2	10	1055773	1055782	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014624	AAAAT	2	10	1056437	1056446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014624	TTTAA	2	10	1060828	1060837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014624	TTTAT	2	10	1077773	1077782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014624	TAAAA	2	10	1078323	1078332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014624	CTTGA	2	10	1082912	1082921	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014624	GCTGT	2	10	1102606	1102615	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014624	TAAAA	2	10	1103447	1103456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014624	TTTCT	2	10	1117252	1117261	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014624	AAAAG	2	10	1119407	1119416	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014624	TATAA	2	10	1122128	1122137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014624	GAACA	2	10	1130786	1130795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014624	AGGAA	2	10	1148529	1148538	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014624	ATTAA	2	10	1151706	1151715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014624	AGGGG	2	10	1183010	1183019	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014624	TCACT	2	10	1202131	1202140	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_014624	ATTCT	2	10	1221703	1221712	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014624	AATAG	2	10	1222899	1222908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014624	AAAGA	2	10	1235046	1235055	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014624	TTTAT	2	10	1262458	1262467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014624	AAAAT	2	10	1270915	1270924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014624	TATAA	2	10	1272790	1272799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014624	AATAA	2	10	1274752	1274761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_014624	TTAAA	2	10	1281111	1281120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014624	TAAAA	2	10	1292918	1292927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_014624	GCCAG	2	10	1373404	1373413	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
165	NC_014624	GGTGC	2	10	1387995	1388004	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_014624	CTTTA	2	10	1420787	1420796	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_014624	AATTG	2	10	1436078	1436087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014624	AAGCA	2	10	1441395	1441404	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_014624	CTTTT	2	10	1578534	1578543	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_014624	ATATA	2	10	1619208	1619217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_014624	ATTAT	2	10	1637784	1637793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_014624	CCCTG	2	10	2133558	2133567	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
263	NC_014624	TTTCT	2	10	2133721	2133730	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_014624	TCAAG	2	10	2135125	2135134	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
265	NC_014624	AAATA	2	10	2141634	2141643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_014624	TATTT	2	10	2150128	2150137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014624	CTTAC	2	10	2183782	2183791	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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271	NC_014624	TGATT	2	10	2229670	2229679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014624	TAAAA	2	10	2262588	2262597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_014624	TTATA	2	10	2271161	2271170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_014624	AATCA	2	10	2297064	2297073	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
278	NC_014624	TCATT	2	10	2318149	2318158	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_014624	TTCTT	2	10	2321703	2321712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
280	NC_014624	TATAA	2	10	2321750	2321759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014624	TGAAC	2	10	2338030	2338039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
282	NC_014624	TATTT	2	10	2348934	2348943	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014624	CTTTA	2	10	2349256	2349265	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_014624	TCACC	2	10	2363015	2363024	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
285	NC_014624	TCAGT	2	10	2397136	2397145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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464	NC_014624	AGGTA	2	10	4036420	4036429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_014624	TACGG	2	10	4115450	4115459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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482	NC_014624	TTCCG	2	10	4136464	4136473	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
483	NC_014624	ATATT	2	10	4194066	4194075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_014624	ATATG	2	10	4310300	4310309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.