MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterobacter cloacae SCF1 chromosome

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014618	TGTCAT	2	12	92800	92811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014618	AACGCG	2	12	192938	192949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014618	TGATAA	2	12	205511	205522	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014618	GATAAA	2	12	252939	252950	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014618	AAAACG	2	12	261448	261459	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014618	TCAGCG	2	12	295648	295659	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014618	TCTCCC	2	12	316821	316832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014618	AATGAT	2	12	324880	324891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014618	TGACGT	2	12	387083	387094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014618	GGGAAA	2	12	466352	466363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014618	GAAAAG	2	12	579757	579768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014618	CTTTCG	2	12	593631	593642	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014618	CGTATA	2	12	602240	602251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014618	ATTGTT	2	12	602890	602901	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014618	TCCTCT	2	12	620774	620785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014618	TCTCCC	2	12	633993	634004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014618	ATTTTT	2	12	656757	656768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014618	ATCATT	2	12	668292	668303	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014618	TTGTTT	2	12	697811	697822	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014618	AATTTA	2	12	714042	714053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014618	ATTTAT	2	12	728454	728465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014618	GAGGGG	2	12	760867	760878	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014618	ACGCCG	2	12	761876	761887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014618	CTCCCT	2	12	833441	833452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014618	AGATAC	2	12	862848	862859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014618	TCTCCC	2	12	884101	884112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014618	TGATGG	2	12	901370	901381	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014618	TGACGA	2	12	1029258	1029269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014618	TTTTAT	2	12	1051063	1051074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014618	TTTTGT	2	12	1076307	1076318	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014618	ATTTAT	2	12	1100720	1100731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014618	TCATGT	2	12	1104110	1104121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014618	GCCATC	2	12	1118755	1118766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014618	TGACCC	2	12	1119035	1119046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014618	GGGTCA	2	12	1139700	1139711	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014618	AGCTGC	2	12	1140606	1140617	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014618	ATACAT	2	12	1141066	1141077	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014618	TTGCAA	2	12	1167107	1167118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014618	GGATGC	2	12	1271110	1271121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014618	GTCACA	2	12	1318970	1318981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014618	GTTACG	2	12	1409691	1409702	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014618	GCACTT	2	12	1412045	1412056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014618	GTTTTT	2	12	1421226	1421237	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014618	ATGGTC	2	12	1461291	1461302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014618	TGTTAA	2	12	1461989	1462000	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014618	TTTTCT	2	12	1466635	1466646	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014618	TTTTCT	2	12	1488953	1488964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014618	TGTTTT	2	12	1515352	1515363	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014618	ATGTAA	2	12	1516646	1516657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014618	TTAATG	2	12	1517032	1517043	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014618	GCGCTG	2	12	1590341	1590352	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014618	ATGGTG	2	12	1601301	1601312	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014618	TTTTCA	2	12	1604973	1604984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014618	AACGAG	2	12	1621598	1621609	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014618	GCAAGA	2	12	1657106	1657117	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014618	GTGATG	2	12	1789040	1789051	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014618	CGAATC	2	12	1800116	1800127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014618	GGGTCA	2	12	1819825	1819836	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014618	TCCGTC	2	12	1845044	1845055	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014618	GTCGTT	2	12	1845658	1845669	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014618	GTTATT	2	12	1884893	1884904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014618	TTTTAT	2	12	1885024	1885035	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014618	TTTTCA	2	12	1971087	1971098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014618	AATGAT	2	12	2005679	2005690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014618	ATAATG	2	12	2130317	2130328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014618	ATATAA	2	12	2221338	2221349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014618	TATTTT	2	12	2231956	2231967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014618	AAAAGG	2	12	2406788	2406799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014618	TTTAAT	2	12	2436377	2436388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014618	ATTGAT	2	12	2449509	2449520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014618	GTATTC	2	12	2458309	2458320	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014618	ACAAAA	2	12	2507566	2507577	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014618	TACAAA	2	12	2508489	2508500	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014618	ATGTTT	2	12	2593002	2593013	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014618	TGCGCC	2	12	2633921	2633932	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014618	GCTGGG	2	12	2646017	2646028	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014618	CAGTGA	2	12	2741236	2741247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014618	CGCTGT	2	12	2761589	2761600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014618	ATTGAA	2	12	2770843	2770854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014618	TTTTAT	2	12	2800010	2800021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014618	CGAAAA	2	12	2814701	2814712	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014618	ATGACG	2	12	2834024	2834035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014618	TAAAAA	2	12	2895743	2895754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014618	ATCGTT	2	12	2899905	2899916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014618	CCCATA	2	12	2934578	2934589	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014618	GCCACA	2	12	3141649	3141660	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014618	TATCAG	2	12	3144509	3144520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014618	GCTTAC	2	12	3186099	3186110	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014618	ATGAAA	2	12	3199616	3199627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014618	CGTCGC	2	12	3239405	3239416	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014618	TATGGT	2	12	3277362	3277373	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014618	TTTATT	2	12	3292117	3292128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014618	GATCAT	2	12	3298681	3298692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014618	ATAAAA	2	12	3346193	3346204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014618	TGAGCA	2	12	3359582	3359593	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014618	CGACAA	2	12	3388654	3388665	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014618	TATAAA	2	12	3399728	3399739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014618	CGATAA	2	12	3418643	3418654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014618	ATTTGC	2	12	3426911	3426922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014618	CCAGTA	2	12	3444019	3444030	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014618	GCATCG	2	12	3445543	3445554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014618	CAGTTT	2	12	3486617	3486628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014618	AGCGAC	2	12	3515083	3515094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014618	TCTCCC	2	12	3518345	3518356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014618	TAAACA	2	12	3669768	3669779	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014618	AAATTT	2	12	3679930	3679941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014618	CAAGAA	2	12	3710116	3710127	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014618	AGCTGA	2	12	3796982	3796993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014618	TGGCGC	2	12	3886986	3886997	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014618	AACCAT	2	12	3914499	3914510	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014618	GCAAAT	2	12	4028827	4028838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014618	TCTCCC	2	12	4035540	4035551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014618	GCTGGA	2	12	4039570	4039581	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014618	ATCATT	2	12	4050334	4050345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014618	AGGGAG	2	12	4092517	4092528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014618	TCTTTC	2	12	4132834	4132845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014618	GATTAA	2	12	4146628	4146639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014618	GACTCA	2	12	4170500	4170511	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014618	GCGCTT	2	12	4188410	4188421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014618	TTGCTA	2	12	4199024	4199035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014618	ACCTGA	2	12	4213070	4213081	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014618	GCCCCT	2	12	4229994	4230005	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014618	AGACGC	2	12	4234810	4234821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014618	GAAACA	2	12	4260147	4260158	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014618	TAAAAA	2	12	4291380	4291391	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014618	AATCAG	2	12	4299232	4299243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014618	TAAAAA	2	12	4320544	4320555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014618	AATATG	2	12	4322321	4322332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014618	ATCCTC	2	12	4323764	4323775	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014618	TTTTAT	2	12	4379762	4379773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014618	AAAGAC	2	12	4417768	4417779	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014618	TGGTTA	2	12	4458156	4458167	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014618	GGGAGA	2	12	4472619	4472630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014618	AAAAAG	2	12	4545276	4545287	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014618	ATCACA	2	12	4668423	4668434	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014618	TACCCT	2	12	4675955	4675966	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014618	ATGAGG	2	12	4682176	4682187	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014618	GCTTAC	2	12	4799937	4799948	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014618	ACATTT	2	12	4803659	4803670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.