MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterobacter cloacae SCF1 chromosome

Total Repeats: 460

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014618	CATCC	2	10	6778	6787	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014618	TTTGC	2	10	26079	26088	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014618	ATTTT	2	10	62519	62528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014618	CGGGA	2	10	64692	64701	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014618	TCATT	2	10	91131	91140	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014618	GCTTT	2	10	97508	97517	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014618	GCGCT	2	10	111676	111685	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014618	GCGGG	2	10	173394	173403	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014618	CCGCG	2	10	186139	186148	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_014618	CCGGG	2	10	189589	189598	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014618	CAGCG	2	10	195144	195153	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014618	CTCGC	2	10	198407	198416	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_014618	AAAGA	2	10	200192	200201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014618	AGCGA	2	10	209946	209955	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014618	GCCGC	2	10	237779	237788	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014618	CGCGG	2	10	244008	244017	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014618	AGGGG	2	10	244023	244032	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014618	AAGTT	2	10	251970	251979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014618	CATCT	2	10	256871	256880	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014618	TGCGT	2	10	273852	273861	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014618	ATTTT	2	10	273894	273903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014618	AATAA	2	10	296367	296376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014618	GCTCA	2	10	302447	302456	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014618	CATGT	2	10	316961	316970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014618	GCGCT	2	10	318366	318375	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014618	TCACT	2	10	348172	348181	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014618	TTTGT	2	10	354627	354636	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014618	TTTTC	2	10	357482	357491	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014618	TTTCT	2	10	397511	397520	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014618	CAAAT	2	10	397564	397573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014618	AAACT	2	10	418702	418711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014618	TAACT	2	10	419282	419291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014618	CACCG	2	10	422787	422796	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_014618	TGCTA	2	10	463644	463653	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014618	GTTCT	2	10	463899	463908	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014618	TTGCC	2	10	503940	503949	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014618	GGCGC	2	10	511493	511502	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014618	TTAAA	2	10	514130	514139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014618	AAAGG	2	10	528880	528889	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014618	GTAAA	2	10	534582	534591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014618	TTTTC	2	10	538555	538564	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014618	CGTCC	2	10	546332	546341	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014618	AATGG	2	10	560418	560427	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014618	GGCCA	2	10	563307	563316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014618	TGCTT	2	10	579605	579614	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014618	AAAAT	2	10	584929	584938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014618	AAAGG	2	10	585042	585051	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014618	CGGCG	2	10	586018	586027	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014618	CGATG	2	10	602358	602367	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014618	ATTTT	2	10	603006	603015	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014618	ATAAA	2	10	603120	603129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014618	CGCGC	2	10	612949	612958	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_014618	GTTAT	2	10	624889	624898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014618	GTGAT	2	10	629760	629769	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014618	CTTTA	2	10	654931	654940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014618	AGCGA	2	10	665712	665721	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014618	ATTAC	2	10	670189	670198	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014618	AAGCG	2	10	689104	689113	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014618	GTCTC	2	10	697833	697842	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014618	GGGCG	2	10	741761	741770	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014618	CGAAA	2	10	747771	747780	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014618	TTCAT	2	10	757339	757348	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014618	GGGAG	2	10	760441	760450	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014618	CAGGC	2	10	761228	761237	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014618	GTTTT	2	10	795913	795922	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014618	GTCGT	2	10	808992	809001	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014618	GTGTT	2	10	830024	830033	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014618	CTTAA	2	10	854773	854782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014618	TATTT	2	10	854868	854877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014618	ACTGT	2	10	854883	854892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014618	CTTAT	2	10	865784	865793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014618	GAAAA	2	10	873199	873208	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014618	CAACA	2	10	875216	875225	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014618	GCGCT	2	10	887873	887882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014618	TTTTA	2	10	890617	890626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014618	ATGGG	2	10	894831	894840	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014618	AAGCG	2	10	900911	900920	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014618	CTGAA	2	10	913819	913828	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014618	CTCAT	2	10	915899	915908	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014618	GGGCA	2	10	959367	959376	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014618	TAAAA	2	10	965856	965865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014618	GTTTT	2	10	969788	969797	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014618	CTTTT	2	10	983264	983273	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014618	AAGCG	2	10	991782	991791	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014618	CACAA	2	10	994164	994173	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014618	TTTTC	2	10	1005510	1005519	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014618	CACGA	2	10	1006067	1006076	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014618	GCCTG	2	10	1006095	1006104	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014618	GCGCA	2	10	1016482	1016491	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014618	GCGCG	2	10	1022899	1022908	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014618	GCCGG	2	10	1037212	1037221	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014618	TTTTG	2	10	1046578	1046587	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014618	TATTT	2	10	1062588	1062597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014618	AACAG	2	10	1075164	1075173	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014618	CTTAT	2	10	1076936	1076945	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014618	GGCGA	2	10	1080897	1080906	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014618	AGAAA	2	10	1084278	1084287	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014618	GTGGC	2	10	1099661	1099670	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014618	CAACC	2	10	1101637	1101646	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_014618	ATTTA	2	10	1103977	1103986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014618	TCATA	2	10	1105011	1105020	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014618	ATCGC	2	10	1119266	1119275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014618	CCCCG	2	10	1131473	1131482	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
104	NC_014618	ACCCC	2	10	1131512	1131521	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
105	NC_014618	ACAAG	2	10	1147256	1147265	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014618	TTCTT	2	10	1149273	1149282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014618	TGATT	2	10	1157462	1157471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014618	TTAAA	2	10	1188875	1188884	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014618	GACAG	2	10	1193342	1193351	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014618	CGCAG	2	10	1211704	1211713	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014618	GTTAC	2	10	1221356	1221365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014618	TGTAG	2	10	1224373	1224382	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014618	AGCGC	2	10	1274555	1274564	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014618	ATATT	2	10	1296605	1296614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014618	CAGTA	2	10	1311945	1311954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014618	AAATG	2	10	1318937	1318946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014618	AATGC	2	10	1334161	1334170	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014618	CCCCG	2	10	1343689	1343698	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
119	NC_014618	CTGAA	2	10	1354637	1354646	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014618	GCGCT	2	10	1386606	1386615	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014618	TATCG	2	10	1395848	1395857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014618	TTTCA	2	10	1395900	1395909	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014618	GAAGG	2	10	1399018	1399027	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014618	ACACG	2	10	1420987	1420996	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014618	TTACG	2	10	1420999	1421008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014618	GCATG	2	10	1421037	1421046	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014618	GCATG	2	10	1421153	1421162	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014618	TGTTA	2	10	1424943	1424952	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014618	CAGCG	2	10	1433779	1433788	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014618	GAATT	2	10	1462446	1462455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014618	GAAAA	2	10	1464559	1464568	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014618	GGCGG	2	10	1483129	1483138	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014618	AGGGC	2	10	1486788	1486797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014618	AGAGG	2	10	1488845	1488854	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014618	AAGCG	2	10	1505415	1505424	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014618	TTAGG	2	10	1515258	1515267	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014618	AATAT	2	10	1549655	1549664	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014618	CTCTT	2	10	1563178	1563187	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014618	GTTTT	2	10	1563236	1563245	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014618	GAAAA	2	10	1568364	1568373	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014618	GTTTT	2	10	1590686	1590695	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014618	GCAGG	2	10	1608976	1608985	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014618	TTGTC	2	10	1613015	1613024	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014618	TTTCT	2	10	1613070	1613079	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014618	ACGAA	2	10	1621772	1621781	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014618	ATTCA	2	10	1628567	1628576	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014618	CACTT	2	10	1639093	1639102	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014618	CGGGC	2	10	1657151	1657160	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014618	CTGGT	2	10	1667916	1667925	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014618	TTTTC	2	10	1670281	1670290	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_014618	GCGCT	2	10	1678176	1678185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_014618	AGGTA	2	10	1699043	1699052	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_014618	GGTCA	2	10	1712083	1712092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_014618	AGGCG	2	10	1712455	1712464	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_014618	TAATT	2	10	1736269	1736278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014618	TAAGA	2	10	1777584	1777593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014618	TTCAT	2	10	1789170	1789179	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_014618	TTGGT	2	10	1809243	1809252	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_014618	CGGGC	2	10	1827050	1827059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
165	NC_014618	CTGTG	2	10	1836456	1836465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_014618	GTGAT	2	10	1884877	1884886	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_014618	AGATA	2	10	2191863	2191872	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_014618	AAAGC	2	10	2912472	2912481	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_014618	AACGT	2	10	2913681	2913690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_014618	CCCGC	2	10	2929603	2929612	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
265	NC_014618	GCGCA	2	10	2929701	2929710	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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269	NC_014618	CTATT	2	10	2995950	2995959	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
270	NC_014618	GTTTT	2	10	3002875	3002884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_014618	TCATA	2	10	3025617	3025626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_014618	GCGCA	2	10	3060557	3060566	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
274	NC_014618	AACTC	2	10	3061859	3061868	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
275	NC_014618	ATATG	2	10	3063038	3063047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014618	TTTAT	2	10	3063212	3063221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014618	GCCAG	2	10	3077253	3077262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
278	NC_014618	TTGAA	2	10	3098883	3098892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014618	TAATG	2	10	3110770	3110779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014618	CCAGC	2	10	3115625	3115634	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
281	NC_014618	GTATA	2	10	3148393	3148402	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014618	TGCCC	2	10	3157867	3157876	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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459	NC_014618	AAAAT	2	10	4789843	4789852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_014618	CGGCG	2	10	4798367	4798376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.