MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia billingiae Eb661 plasmid pEB170

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014305	AAAG	2	8	1671	1678	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014305	AAAG	2	8	5948	5955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014305	CGTA	2	8	6104	6111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014305	ACCT	2	8	7004	7011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014305	GATG	2	8	7105	7112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014305	CCGC	2	8	9424	9431	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_014305	ACCG	2	8	9832	9839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014305	CAAC	2	8	13593	13600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014305	TGAC	2	8	19815	19822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014305	GGAA	2	8	21638	21645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014305	CAGG	2	8	21671	21678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014305	CCCT	2	8	21888	21895	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_014305	GCGT	2	8	26171	26178	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014305	GCCG	2	8	27625	27632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014305	TAAC	2	8	34407	34414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014305	TCAG	2	8	34455	34462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014305	TTCT	2	8	34544	34551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014305	TCTG	2	8	34715	34722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014305	CGGA	2	8	36839	36846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014305	TGAG	2	8	38767	38774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014305	TATT	2	8	39253	39260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014305	AAGA	2	8	40536	40543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014305	TACG	2	8	40840	40847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014305	TTAA	2	8	41392	41399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014305	TGCC	2	8	41566	41573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014305	TGAT	2	8	41642	41649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014305	TGAT	2	8	41659	41666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014305	TGTA	2	8	43236	43243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014305	GCTT	2	8	43990	43997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014305	GCTT	2	8	46178	46185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014305	CCGG	2	8	46284	46291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014305	GATG	2	8	47314	47321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014305	TTCC	2	8	47449	47456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014305	CATC	2	8	47640	47647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014305	GACA	2	8	49235	49242	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014305	AGCC	2	8	49243	49250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014305	GCAT	2	8	49326	49333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014305	AGGG	2	8	49340	49347	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014305	GCTA	2	8	52188	52195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014305	ACTG	2	8	52220	52227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014305	GGAT	2	8	52386	52393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014305	CTTT	2	8	52469	52476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014305	GGAT	2	8	53108	53115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014305	CCTG	2	8	56514	56521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014305	TAAA	2	8	58649	58656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014305	TAAA	2	8	58663	58670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014305	CTTC	2	8	60392	60399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014305	AAGA	2	8	60616	60623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014305	TTAA	2	8	61792	61799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014305	TGCA	2	8	66397	66404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014305	TCCC	2	8	67347	67354	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_014305	GCGT	2	8	67385	67392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014305	TGAT	2	8	67739	67746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014305	TTGA	2	8	68006	68013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014305	CAGG	2	8	68509	68516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014305	GCAT	2	8	68535	68542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014305	AGTA	2	8	71309	71316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014305	ATAA	2	8	71652	71659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014305	CTTT	2	8	71760	71767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014305	TTTA	2	8	72270	72277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014305	TCTG	2	8	74373	74380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014305	CCGG	2	8	76831	76838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014305	AAAG	2	8	76885	76892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014305	GATG	2	8	77220	77227	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014305	AGGC	2	8	77885	77892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014305	ATGG	2	8	78026	78033	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014305	CAGA	2	8	80762	80769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014305	ATGT	2	8	80996	81003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014305	ATTT	2	8	81590	81597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014305	GGAC	2	8	82691	82698	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014305	CTGT	2	8	84070	84077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014305	TTCC	2	8	84121	84128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014305	ATTG	2	8	84578	84585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014305	CTGA	2	8	84593	84600	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014305	ATGA	2	8	84735	84742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014305	ATTT	2	8	86829	86836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014305	TAAT	2	8	94071	94078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014305	TGGC	2	8	94134	94141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014305	GTAT	2	8	104454	104461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014305	ATAA	2	8	104464	104471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014305	GTAT	2	8	104765	104772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014305	AGTA	2	8	106745	106752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014305	GGCT	2	8	107320	107327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014305	AGGA	2	8	108157	108164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014305	TTAG	2	8	109638	109645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014305	CATA	2	8	109649	109656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014305	TGTT	2	8	110378	110385	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014305	ATTT	2	8	110677	110684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014305	AGTT	2	8	110777	110784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014305	TAAA	2	8	112582	112589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014305	GGTA	2	8	113410	113417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014305	CAGC	2	8	115345	115352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014305	CTGA	2	8	115772	115779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014305	TCAA	2	8	115801	115808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014305	TGGC	2	8	119726	119733	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014305	GTTG	2	8	119987	119994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014305	CTTC	2	8	121186	121193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014305	CTGC	2	8	122333	122340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014305	AAGA	2	8	125126	125133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014305	ATTT	2	8	125148	125155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014305	GATT	2	8	130739	130746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014305	ATGT	2	8	135912	135919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014305	TGAG	2	8	136343	136350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014305	TCTA	2	8	136374	136381	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014305	TGAA	2	8	136458	136465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014305	AATA	2	8	136581	136588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014305	CCCT	2	8	140673	140680	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_014305	TTTA	2	8	140683	140690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014305	CGTC	2	8	141145	141152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014305	TTCA	2	8	141830	141837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014305	CCTG	2	8	146670	146677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014305	GCAG	2	8	146679	146686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014305	CTTG	2	8	153282	153289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014305	TTTC	2	8	159393	159400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014305	GCCT	2	8	159575	159582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014305	GGGC	2	8	159591	159598	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014305	AAGT	2	8	169488	169495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014305	GGAT	2	8	169746	169753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.