MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 chromosome

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013961	TCATTC	2	12	83263	83274	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013961	TAATTT	2	12	85046	85057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013961	GTGTCA	2	12	87031	87042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013961	TTTTTC	2	12	89627	89638	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013961	TTACCT	2	12	202026	202037	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013961	ATCAGA	2	12	203775	203786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013961	TCCCGA	2	12	347512	347523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013961	TGGCGC	2	12	389228	389239	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013961	CATTGC	2	12	433739	433750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013961	TCAGGT	2	12	441314	441325	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013961	TTATGA	2	12	465479	465490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013961	CATTAT	2	12	534637	534648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013961	ATGTAT	2	12	569255	569266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013961	GATGAG	2	12	618520	618531	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013961	CAGATG	2	12	663430	663441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013961	TGCAGC	2	12	666226	666237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013961	TGGCGC	2	12	669027	669038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013961	CGGGAA	2	12	706973	706984	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013961	AACGAA	2	12	743428	743439	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013961	CCGCGT	2	12	803869	803880	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013961	CTGAAT	2	12	803923	803934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013961	GCTAAC	2	12	885615	885626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013961	ATGGTG	2	12	957952	957963	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013961	TATTTT	2	12	1001398	1001409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013961	TTAACC	2	12	1055583	1055594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013961	CGTCAG	2	12	1138765	1138776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013961	AATGTT	2	12	1194462	1194473	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013961	TAGTAT	2	12	1220992	1221003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013961	AGCGAG	2	12	1246356	1246367	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013961	CGTAGT	2	12	1246411	1246422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013961	CGGCGA	2	12	1335034	1335045	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013961	GCCCGC	2	12	1373069	1373080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013961	GGCAAA	2	12	1479191	1479202	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013961	TTTAAT	2	12	1546793	1546804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013961	TGGTAT	2	12	1592068	1592079	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013961	CCGGGA	2	12	1605420	1605431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013961	GTAGCG	2	12	1618436	1618447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013961	TTTTAT	2	12	1683554	1683565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013961	CACAAC	2	12	1703963	1703974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013961	GTCAGC	2	12	1739186	1739197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013961	TCCGAC	2	12	1774200	1774211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013961	AGCGTA	2	12	1839362	1839373	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013961	ATTTGC	2	12	1884803	1884814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013961	TTCAGG	2	12	1895658	1895669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013961	GATAAG	2	12	1898709	1898720	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013961	GTCTGA	2	12	1935414	1935425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013961	TTGCGC	2	12	1967111	1967122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013961	TTACCT	2	12	1975561	1975572	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013961	GTAAAA	2	12	2058708	2058719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013961	CTTTTT	2	12	2060868	2060879	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013961	GGACCG	2	12	2093963	2093974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013961	CGGCTG	2	12	2096523	2096534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013961	ATAATC	2	12	2115376	2115387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013961	ATTATC	2	12	2172417	2172428	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013961	GGGTTA	2	12	2184288	2184299	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013961	CTGCCA	2	12	2208563	2208574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013961	TAAAAA	2	12	2219434	2219445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013961	CTTTCA	2	12	2233227	2233238	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013961	TCCAGC	2	12	2255341	2255352	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013961	ACGCTG	2	12	2379105	2379116	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013961	TGAGCC	2	12	2388068	2388079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013961	AGAAAA	2	12	2476844	2476855	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013961	CATTAT	2	12	2519239	2519250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013961	CGCAGC	2	12	2636669	2636680	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013961	ACAAAA	2	12	2651786	2651797	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013961	ATGCTG	2	12	2682789	2682800	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013961	AAGGGG	2	12	2706826	2706837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013961	TGAAAT	2	12	2715242	2715253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013961	ATGATA	2	12	2795868	2795879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013961	TTATCG	2	12	2822060	2822071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013961	TGCAAA	2	12	2823187	2823198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013961	TAAAAA	2	12	2899877	2899888	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013961	CTGCAT	2	12	2926309	2926320	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013961	TAAAAA	2	12	2995269	2995280	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013961	GCATAC	2	12	3096964	3096975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013961	AATGAT	2	12	3140272	3140283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013961	CATAGC	2	12	3148469	3148480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013961	TTTCCC	2	12	3188590	3188601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013961	CAAAAA	2	12	3197241	3197252	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013961	CAAAAA	2	12	3197476	3197487	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013961	CAAAAA	2	12	3197594	3197605	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013961	AAAAAC	2	12	3197712	3197723	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013961	AAAAAC	2	12	3197829	3197840	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013961	TCTGTC	2	12	3261133	3261144	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013961	TGTGTT	2	12	3286882	3286893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013961	CCGGTC	2	12	3290700	3290711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013961	GAAACA	2	12	3316135	3316146	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013961	GTTAAA	2	12	3332350	3332361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013961	AACCTG	2	12	3352899	3352910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013961	AATTTA	2	12	3363464	3363475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013961	AGAAAT	2	12	3378362	3378373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013961	CATTTT	2	12	3420789	3420800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013961	TAAACA	2	12	3472698	3472709	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013961	GCGGCT	2	12	3500370	3500381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013961	CAGCGG	2	12	3587458	3587469	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013961	ATTCAA	2	12	3633424	3633435	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013961	GCTAAA	2	12	3633572	3633583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013961	AATGAG	3	18	3650891	3650908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013961	CTTGAT	2	12	3675547	3675558	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013961	ATTTAA	2	12	3733947	3733958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013961	TCAATA	2	12	3787714	3787725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.