MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 chromosome

Total Repeats: 592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013941	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013941	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013941	TTAAT	2	10	24762	24771	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013941	ATTTA	2	10	33586	33595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013941	GATGC	2	10	39086	39095	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013941	TGTTA	2	10	46533	46542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013941	TAGTG	2	10	80389	80398	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013941	GTAAC	2	10	80530	80539	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013941	ATTTT	2	10	83114	83123	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013941	GGGAG	2	10	83278	83287	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013941	CGCCA	2	10	83342	83351	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_013941	AATGC	2	10	121417	121426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013941	GGCAT	2	10	146324	146333	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013941	GTAAG	2	10	147088	147097	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013941	TCCTC	2	10	148808	148817	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_013941	TAAGA	2	10	161494	161503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013941	AAATA	2	10	161504	161513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013941	TTATC	2	10	171688	171697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013941	TACGT	2	10	186564	186573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013941	TGGCC	2	10	188289	188298	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013941	GTCTG	2	10	196125	196134	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013941	CGGTT	2	10	226814	226823	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013941	AAAAT	2	10	263471	263480	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013941	CTAAT	2	10	263686	263695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013941	TTTGT	2	10	263713	263722	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013941	GCCCG	2	10	267218	267227	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_013941	CGGGG	2	10	267447	267456	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013941	GAAGG	2	10	268520	268529	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013941	TGACC	2	10	269084	269093	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_013941	GGCAG	2	10	270358	270367	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013941	GGCAG	2	10	272923	272932	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013941	GGGCA	2	10	278551	278560	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013941	ATGGT	2	10	283885	283894	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013941	CCTTT	2	10	288036	288045	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013941	AAAAC	2	10	304466	304475	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013941	CAGTG	2	10	309063	309072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013941	TTCGT	2	10	310498	310507	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013941	ACAAA	2	10	310666	310675	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013941	TGTAT	2	10	323072	323081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013941	ATCCC	2	10	353263	353272	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_013941	AATTT	2	10	354654	354663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013941	TTTCG	2	10	356300	356309	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013941	CGCTT	2	10	356461	356470	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013941	TGGCA	2	10	358461	358470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013941	TGCAA	2	10	358842	358851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013941	ATCAA	2	10	364084	364093	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013941	TGTGT	2	10	385059	385068	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013941	TGTTA	2	10	386168	386177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013941	TTGAT	2	10	387057	387066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013941	CAAAA	2	10	401368	401377	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013941	ATTAG	2	10	401401	401410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013941	TTCCC	2	10	405871	405880	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_013941	GACAA	2	10	405975	405984	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013941	ATAAA	2	10	406551	406560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013941	AAAAT	2	10	406613	406622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013941	GGTTT	2	10	410886	410895	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013941	ATTGA	2	10	411080	411089	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013941	AGCGA	2	10	412369	412378	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013941	TGTCA	2	10	418810	418819	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013941	ATTTT	2	10	418874	418883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013941	GGCTG	2	10	453819	453828	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013941	AAGCG	2	10	457378	457387	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013941	TTGCG	2	10	462576	462585	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013941	TAGCG	2	10	465487	465496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013941	CGGCG	2	10	485659	485668	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013941	ATGGA	2	10	485692	485701	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013941	CTTCT	2	10	498821	498830	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013941	GTTTC	2	10	536067	536076	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013941	CTTTT	2	10	539543	539552	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013941	GGAGT	2	10	544038	544047	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013941	GTTTT	2	10	560599	560608	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013941	GAAGA	2	10	567179	567188	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013941	TCAGG	2	10	574601	574610	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013941	TGAGT	2	10	580950	580959	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013941	CAGGT	2	10	582239	582248	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013941	TTTTC	2	10	602611	602620	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013941	TCAGG	2	10	610373	610382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013941	ATTTT	2	10	656995	657004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013941	TGGCG	2	10	657149	657158	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013941	GCCCG	2	10	657251	657260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_013941	GCAGC	2	10	657492	657501	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_013941	GCGGG	2	10	658165	658174	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013941	TGACC	2	10	659112	659121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013941	TAAAT	2	10	660975	660984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013941	AAGCG	2	10	675672	675681	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013941	GTTTC	2	10	690267	690276	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013941	GTTGA	2	10	702090	702099	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013941	GTTGT	2	10	702223	702232	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013941	TGAGT	2	10	707601	707610	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013941	TTGGG	2	10	710127	710136	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013941	AAATA	2	10	710202	710211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013941	GTTCT	2	10	717578	717587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013941	AAATT	2	10	746354	746363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013941	GTCAG	2	10	779954	779963	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013941	GTCAG	2	10	780457	780466	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013941	GCAGT	2	10	783682	783691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013941	GTTAA	2	10	800674	800683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013941	TGCTA	2	10	827294	827303	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013941	ATTTG	2	10	828735	828744	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013941	TCAAT	2	10	831040	831049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013941	GGAAC	2	10	832230	832239	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013941	CGTAA	2	10	833438	833447	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013941	GCATA	2	10	845634	845643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013941	AGCAA	2	10	845741	845750	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013941	CGTTG	2	10	851523	851532	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013941	CAGGG	2	10	872279	872288	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013941	ATAAA	2	10	877508	877517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013941	TCGCG	2	10	877695	877704	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_013941	AATGT	2	10	902360	902369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013941	GAAAA	2	10	902468	902477	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013941	TTAAT	2	10	903337	903346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013941	ACGCT	2	10	943863	943872	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013941	ATAAC	2	10	944746	944755	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013941	GTCGT	2	10	954333	954342	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013941	AAGCG	2	10	954999	955008	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013941	GATGC	2	10	979274	979283	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013941	AAAAT	2	10	980777	980786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013941	AAAAC	2	10	982276	982285	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013941	GTTGG	2	10	982389	982398	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013941	CAGTG	2	10	986965	986974	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013941	TTTCA	2	10	988671	988680	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013941	ATGTA	2	10	988747	988756	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013941	AATTC	2	10	994907	994916	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013941	TGATT	2	10	998459	998468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013941	TAACT	2	10	1000276	1000285	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013941	GGGAT	2	10	1006068	1006077	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013941	ACATA	2	10	1057797	1057806	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013941	GATGC	2	10	1063063	1063072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013941	CAAAA	2	10	1069661	1069670	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013941	TATAT	2	10	1074394	1074403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013941	TGATG	2	10	1080402	1080411	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013941	CAGGG	2	10	1100375	1100384	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013941	AGTAA	2	10	1112235	1112244	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013941	CAAAT	2	10	1122064	1122073	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013941	TGATA	2	10	1132048	1132057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013941	GCTGT	2	10	1176897	1176906	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013941	GCAAC	2	10	1184285	1184294	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_013941	TTCAC	2	10	1198254	1198263	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013941	TTGTT	2	10	1224020	1224029	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013941	AATCG	2	10	1227919	1227928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013941	AACGT	2	10	1227950	1227959	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013941	AGCGA	2	10	1232375	1232384	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013941	ATGAC	2	10	1234115	1234124	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013941	TATTT	2	10	1234178	1234187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013941	TTTTC	2	10	1242153	1242162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_013941	TTATT	2	10	1242963	1242972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013941	TTCTT	2	10	1244896	1244905	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013941	GTACA	2	10	1247432	1247441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013941	TTATG	2	10	1247589	1247598	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013941	CTTAT	2	10	1258092	1258101	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_013941	AATGT	2	10	1272311	1272320	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_013941	ACAGC	2	10	1293913	1293922	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_013941	GGAAT	2	10	1316632	1316641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013941	TTCGC	2	10	1316727	1316736	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_013941	TAAAA	2	10	1378772	1378781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013941	TGCAG	2	10	1386969	1386978	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_013941	TCTGC	2	10	1392233	1392242	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
162	NC_013941	CATCA	2	10	1451104	1451113	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_013941	CATGA	2	10	1464614	1464623	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_013941	ATTAA	2	10	1466462	1466471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_013941	GTTTA	2	10	1471893	1471902	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013941	AAGCA	2	10	1472142	1472151	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
170	NC_013941	CAACT	2	10	1473840	1473849	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_013941	TTTTG	2	10	1479337	1479346	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_013941	TTATC	2	10	1540642	1540651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_013941	CAAAA	2	10	1627516	1627525	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_013941	GCCAG	2	10	1639495	1639504	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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199	NC_013941	TTAAT	2	10	1714356	1714365	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_013941	TAGCG	2	10	2381624	2381633	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
274	NC_013941	AGCGC	2	10	2394160	2394169	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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283	NC_013941	AAAAC	2	10	2464888	2464897	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_013941	ATTCT	2	10	2474493	2474502	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_013941	CTTTT	2	10	2478163	2478172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_013941	GCGCA	2	10	2489080	2489089	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_013941	AATGC	2	10	2497538	2497547	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_013941	GAACA	2	10	2509979	2509988	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
289	NC_013941	GTATT	2	10	2510583	2510592	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013941	AACGC	2	10	2517711	2517720	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
291	NC_013941	ATTCG	2	10	2518355	2518364	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
292	NC_013941	AGGTG	2	10	2518881	2518890	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_013941	ATTTG	2	10	2630297	2630306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_013941	ATTTT	2	10	2856405	2856414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_013941	AAAGC	2	10	3422064	3422073	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
403	NC_013941	TGCCT	2	10	3446399	3446408	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
404	NC_013941	AAGGT	2	10	3450034	3450043	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
405	NC_013941	CGCTG	2	10	3453079	3453088	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
406	NC_013941	GCCAG	2	10	3453618	3453627	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
407	NC_013941	GATTC	2	10	3482964	3482973	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
408	NC_013941	GTTTA	2	10	3485794	3485803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
409	NC_013941	TCCCC	2	10	3488152	3488161	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
410	NC_013941	TCATT	2	10	3488213	3488222	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
411	NC_013941	TGATG	2	10	3497849	3497858	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
412	NC_013941	TCCCT	2	10	3532015	3532024	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
413	NC_013941	TCCAG	2	10	3560228	3560237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
414	NC_013941	ATTGC	2	10	3561177	3561186	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
415	NC_013941	AGGAT	2	10	3569835	3569844	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
416	NC_013941	ACGCC	2	10	3621040	3621049	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
417	NC_013941	ATCAC	2	10	3622191	3622200	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
418	NC_013941	CCCTG	2	10	3632922	3632931	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
419	NC_013941	GCCCC	2	10	3635388	3635397	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
420	NC_013941	TTATT	2	10	3643955	3643964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_013941	AAAAT	2	10	3643987	3643996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_013941	GATGC	2	10	3647375	3647384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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424	NC_013941	GACGA	2	10	3675836	3675845	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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465	NC_013941	GCATC	2	10	4113452	4113461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
466	NC_013941	TCAAA	2	10	4127073	4127082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
467	NC_013941	GCATC	2	10	4148688	4148697	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_013941	CAGGT	2	10	4545950	4545959	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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