MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	GGCG	2	8	3608	3615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013655	GGGA	2	8	4854	4861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013655	ATTT	2	8	6713	6720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013655	AAAT	2	8	6930	6937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013655	ATTA	2	8	7437	7444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013655	AAAT	2	8	31371	31378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013655	AAAT	2	8	31402	31409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013655	GGAA	2	8	44705	44712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013655	TCAT	2	8	45649	45656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013655	TAAT	2	8	45898	45905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013655	TGGC	2	8	52206	52213	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013655	GCTC	2	8	52405	52412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013655	CATT	2	8	53609	53616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013655	GACA	2	8	53650	53657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013655	CTGG	2	8	53878	53885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013655	ATCA	2	8	54053	54060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013655	GAAA	2	8	55282	55289	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013655	TGAA	2	8	55981	55988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013655	CTGC	2	8	56841	56848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013655	GCCT	2	8	56901	56908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013655	GCCA	2	8	66697	66704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013655	CCTG	2	8	66760	66767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013655	CTTG	2	8	66810	66817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013655	AAAG	2	8	69330	69337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013655	TTCT	2	8	70036	70043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013655	TAGA	2	8	70394	70401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013655	AAAT	2	8	70680	70687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013655	GTAC	2	8	71021	71028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013655	AAAC	2	8	71109	71116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013655	CTGG	2	8	71166	71173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013655	GCCG	2	8	71853	71860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013655	CAAG	2	8	71938	71945	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013655	CATT	2	8	72078	72085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013655	TAAT	2	8	72102	72109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013655	TAAT	2	8	73926	73933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013655	TTGT	2	8	77727	77734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013655	GCAA	2	8	81926	81933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013655	GCAA	2	8	82385	82392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013655	CAGG	2	8	82436	82443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013655	GCTG	2	8	82497	82504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013655	CGCC	2	8	88394	88401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_013655	ATTT	2	8	92682	92689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013655	TACT	2	8	92938	92945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013655	TCAT	2	8	93405	93412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013655	TCAT	2	8	93459	93466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013655	TCAT	2	8	93547	93554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013655	GATG	2	8	93619	93626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013655	AAAT	2	8	93791	93798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013655	GTAA	2	8	95436	95443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013655	ATTT	2	8	95456	95463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013655	CATG	2	8	95561	95568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013655	CAAA	2	8	95863	95870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013655	TCAC	2	8	96885	96892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013655	ACTG	2	8	98037	98044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013655	ACTT	2	8	98110	98117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013655	GTCG	2	8	98892	98899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013655	TGCC	2	8	99083	99090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013655	AATT	2	8	100200	100207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013655	TGAT	2	8	100318	100325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013655	TGTC	2	8	100418	100425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013655	GATG	2	8	100628	100635	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013655	AGGT	2	8	100939	100946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013655	GATT	2	8	101078	101085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013655	GTTT	2	8	101899	101906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013655	ATAA	2	8	101955	101962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013655	TGTA	2	8	108035	108042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013655	GGTG	2	8	108063	108070	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013655	GCGG	2	8	116088	116095	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013655	ACGG	2	8	116755	116762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013655	ATTT	2	8	118160	118167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013655	GTCA	2	8	118199	118206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013655	TGAC	2	8	121999	122006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.