MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE15

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013654	GAAAAT	2	12	10501	10512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013654	AAGGGA	2	12	93225	93236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013654	ATTGTT	2	12	160946	160957	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013654	TATGAA	2	12	169624	169635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013654	ATTTAA	2	12	170384	170395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013654	GTAGTG	2	12	217699	217710	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013654	CTTTTC	2	12	262188	262199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013654	TTTTCT	2	12	314810	314821	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013654	CTATTT	2	12	315847	315858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013654	GTCACT	2	12	319348	319359	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013654	AATTTC	2	12	322568	322579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013654	TGTCTG	2	12	332490	332501	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013654	TGAGGT	2	12	332683	332694	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013654	TTTATT	2	12	344561	344572	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013654	AACAAT	2	12	396091	396102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013654	ATATCA	2	12	397408	397419	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013654	TATTGA	2	12	398937	398948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013654	TTTTCA	2	12	461071	461082	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013654	CAGGCG	2	12	479745	479756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013654	TGCAAA	2	12	586223	586234	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013654	ATTTTT	2	12	687076	687087	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013654	TTTACC	2	12	697988	697999	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013654	AAGTGA	2	12	736000	736011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013654	TTTTCT	2	12	766579	766590	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013654	AAAAAC	2	12	819874	819885	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013654	TTCATT	2	12	884118	884129	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013654	TAACCG	2	12	891948	891959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013654	CTGGAA	2	12	930132	930143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013654	AAAGAT	2	12	952926	952937	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013654	TAAGGA	2	12	988675	988686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013654	ATAATG	2	12	990090	990101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013654	TGGTAA	2	12	1013782	1013793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013654	TGTTAA	2	12	1022332	1022343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013654	CAAAAA	2	12	1065939	1065950	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013654	CAGGAG	2	12	1157007	1157018	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013654	ATAAAT	2	12	1192071	1192082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013654	ACTTAA	2	12	1192669	1192680	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013654	GGTGAA	2	12	1202334	1202345	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013654	CCATTG	2	12	1252039	1252050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013654	CTTATT	2	12	1303793	1303804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013654	GATCAA	2	12	1309870	1309881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013654	CAAAAG	2	12	1310844	1310855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013654	CTGATC	2	12	1321322	1321333	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013654	TATAAC	2	12	1374633	1374644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013654	AAAAAC	2	12	1504456	1504467	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013654	CGTTGT	2	12	1505842	1505853	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013654	ACCGTT	2	12	1512025	1512036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013654	CAAAAA	2	12	1551376	1551387	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013654	ATACTT	2	12	1637838	1637849	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013654	AAAATA	2	12	1651496	1651507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013654	TGTTTT	2	12	1652129	1652140	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013654	AAGACT	2	12	1652389	1652400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013654	TATTAC	2	12	1765896	1765907	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013654	TTTCTT	2	12	1778349	1778360	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013654	ACTGTC	2	12	1825949	1825960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013654	AATTCA	2	12	1873420	1873431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013654	TCTTAT	2	12	1887227	1887238	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013654	GTGTAT	2	12	1899725	1899736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013654	CTGATA	2	12	1981016	1981027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013654	GAAAAC	2	12	2009450	2009461	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013654	TTTTGT	2	12	2072230	2072241	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013654	CCTTAC	2	12	2155948	2155959	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013654	CCTGTT	2	12	2167439	2167450	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013654	TCTTCC	2	12	2214428	2214439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013654	TAAATG	2	12	2349808	2349819	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013654	TGTCAC	2	12	2363442	2363453	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013654	AGCGGA	2	12	2365603	2365614	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013654	AGAAAA	2	12	2372746	2372757	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013654	CTGATG	2	12	2436222	2436233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013654	GTTATG	2	12	2454064	2454075	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013654	TCGATA	2	12	2464690	2464701	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013654	CAAGTG	2	12	2471033	2471044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013654	TCCTTC	2	12	2566715	2566726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013654	TGAGCG	2	12	2601077	2601088	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013654	TGGACA	2	12	2611087	2611098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013654	CAGTTT	2	12	2625692	2625703	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013654	GGAGAA	2	12	2711059	2711070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013654	GGTTTT	2	12	2806608	2806619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013654	ACAAGA	2	12	2810938	2810949	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013654	TTTGTT	2	12	2835763	2835774	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013654	ATCGCG	2	12	2953469	2953480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013654	GTAAGG	2	12	2968144	2968155	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013654	ATTTTA	2	12	3034987	3034998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013654	TTTTCG	2	12	3070928	3070939	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_013654	ATTTAA	2	12	3084132	3084143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013654	ATAAAA	2	12	3136001	3136012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013654	ATTTAA	2	12	3146741	3146752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013654	AGTTGT	2	12	3177935	3177946	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013654	CTTTTT	2	12	3182611	3182622	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013654	AATGAT	2	12	3183446	3183457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013654	TCTCCC	2	12	3206255	3206266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013654	GTAACC	2	12	3231953	3231964	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013654	TGCATT	2	12	3240772	3240783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013654	TTTTAT	2	12	3242669	3242680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013654	AAGCGA	2	12	3248068	3248079	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013654	ACAGAA	2	12	3295468	3295479	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013654	AGCGTT	2	12	3377244	3377255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013654	TTTATA	2	12	3393928	3393939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013654	AATTTA	2	12	3500883	3500894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013654	AAGATA	2	12	3584848	3584859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013654	AGATGC	2	12	3600120	3600131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013654	TGAAAA	2	12	3624009	3624020	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013654	TTTGCC	2	12	3663453	3663464	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013654	GCCAGC	2	12	3665530	3665541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013654	CTGAAG	2	12	3667986	3667997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013654	CTTTTT	2	12	3902293	3902304	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013654	AAATGG	2	12	4032634	4032645	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013654	GATATC	2	12	4062732	4062743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013654	GGGAGT	2	12	4068474	4068485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013654	ATTCTG	2	12	4069457	4069468	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013654	ATAAAA	2	12	4089944	4089955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013654	TCATTT	2	12	4213384	4213395	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013654	TAACCA	2	12	4232855	4232866	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013654	ATTTAT	2	12	4281769	4281780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013654	GTCTTT	2	12	4290579	4290590	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013654	AATATC	2	12	4322907	4322918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013654	CTGATA	2	12	4358579	4358590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013654	TATTTT	2	12	4372841	4372852	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013654	TTTTTA	2	12	4424121	4424132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013654	TTTAAT	2	12	4455974	4455985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013654	CAGCCT	2	12	4495666	4495677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013654	TTCTGC	2	12	4570536	4570547	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013654	TTGTTC	2	12	4604161	4604172	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013654	ATATAG	2	12	4604267	4604278	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013654	AACAGG	2	12	4637391	4637402	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013654	TTTTCA	2	12	4672179	4672190	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013654	AATGAT	2	12	4681924	4681935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013654	TTATCA	2	12	4682017	4682028	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.