MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_2

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013370	CAC	2	6	181	186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013370	TGA	2	6	442	447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013370	ATT	2	6	1898	1903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013370	AAG	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013370	TCT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013370	CAT	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013370	GGC	2	6	2446	2451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013370	GCC	2	6	2458	2463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013370	AAC	2	6	3830	3835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013370	ACG	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013370	ACG	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013370	GTA	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013370	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013370	ATC	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013370	ATT	2	6	12619	12624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013370	TTG	2	6	16344	16349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013370	ATT	2	6	16355	16360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013370	GGT	2	6	16899	16904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013370	TGG	2	6	17002	17007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013370	AAT	2	6	17939	17944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013370	ATT	2	6	17945	17950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013370	TAA	2	6	17961	17966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013370	ATT	2	6	17971	17976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013370	TCT	2	6	17979	17984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013370	TTA	2	6	18506	18511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013370	GTC	2	6	18542	18547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013370	CCT	2	6	25552	25557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013370	AGG	2	6	25566	25571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013370	TAA	2	6	26030	26035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013370	TAA	2	6	26045	26050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013370	ATT	2	6	26083	26088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013370	TGA	2	6	26231	26236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013370	TGT	2	6	30807	30812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013370	TTC	2	6	36916	36921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013370	AGT	2	6	39089	39094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013370	ATT	2	6	39611	39616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013370	CAT	2	6	39639	39644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013370	TTA	2	6	40359	40364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013370	TAA	2	6	40400	40405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013370	CAT	2	6	40441	40446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013370	CCG	2	6	40478	40483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013370	AGC	2	6	40510	40515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013370	GTT	2	6	40694	40699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013370	TAA	2	6	42065	42070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013370	GTA	2	6	42950	42955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013370	ACC	2	6	42959	42964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013370	AGA	2	6	44173	44178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013370	CCT	3	9	45698	45706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013370	TTG	2	6	49957	49962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013370	GGA	2	6	50006	50011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013370	TGC	2	6	52371	52376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013370	ATA	2	6	52382	52387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013370	AGC	2	6	52937	52942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013370	TGA	2	6	53321	53326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013370	CCA	2	6	53424	53429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013370	CCA	2	6	53539	53544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013370	CAA	2	6	54534	54539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013370	CAA	2	6	54596	54601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013370	CAA	2	6	54617	54622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013370	TCT	2	6	54712	54717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013370	TCC	2	6	55813	55818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013370	GAA	2	6	55820	55825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013370	AGT	2	6	56844	56849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013370	AGG	2	6	56864	56869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013370	TCC	2	6	56882	56887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013370	TTG	2	6	56911	56916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013370	ATT	2	6	56940	56945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013370	TAA	2	6	57018	57023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013370	GTC	2	6	57091	57096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013370	TTA	2	6	61325	61330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013370	GCG	2	6	61393	61398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013370	TCC	2	6	61419	61424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_013370	ACC	2	6	61432	61437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013370	GCG	2	6	61555	61560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013370	GAT	2	6	61594	61599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013370	TGA	2	6	61601	61606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013370	AAG	2	6	61619	61624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013370	GTC	2	6	61645	61650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013370	GGT	2	6	62131	62136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013370	CAC	2	6	62154	62159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013370	CCA	2	6	62937	62942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_013370	ATT	2	6	63007	63012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013370	GGA	2	6	63060	63065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013370	AAT	2	6	63095	63100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013370	CCA	2	6	64254	64259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013370	CGT	2	6	64291	64296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013370	CAA	2	6	64343	64348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013370	TGA	2	6	64464	64469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013370	GAT	2	6	71720	71725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013370	ATT	2	6	71753	71758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013370	ATT	2	6	71776	71781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013370	TTC	2	6	71827	71832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013370	ATA	2	6	72675	72680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013370	AAT	2	6	72733	72738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013370	TTC	2	6	74710	74715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013370	TGG	2	6	74720	74725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013370	ATT	2	6	74784	74789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013370	TGG	2	6	74871	74876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013370	GTT	2	6	74888	74893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013370	GAT	2	6	76223	76228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013370	CCA	2	6	76289	76294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013370	ACT	2	6	76433	76438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013370	GAT	2	6	76481	76486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013370	TGT	2	6	76540	76545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013370	AAT	2	6	76615	76620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013370	AAT	2	6	76704	76709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013370	TAA	2	6	76717	76722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013370	TCA	2	6	76751	76756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013370	ACT	2	6	76815	76820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013370	CGG	2	6	76846	76851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013370	TCA	2	6	76863	76868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013370	CAA	2	6	76879	76884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013370	TGG	2	6	78297	78302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013370	CCA	2	6	78311	78316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013370	GAG	2	6	78335	78340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013370	TAA	2	6	78859	78864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013370	GGC	2	6	79014	79019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013370	TCG	2	6	79021	79026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013370	GCC	2	6	82573	82578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013370	TAA	2	6	82590	82595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013370	TGC	2	6	82827	82832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013370	ATT	2	6	85862	85867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013370	AGA	2	6	85871	85876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013370	CCA	2	6	85881	85886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013370	TGG	2	6	85911	85916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013370	TGA	2	6	85976	85981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013370	TAT	2	6	86937	86942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013370	ACT	2	6	86972	86977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013370	TTC	2	6	87115	87120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013370	CAA	2	6	87168	87173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013370	TTG	2	6	87178	87183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013370	CTG	2	6	87277	87282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013370	TCA	2	6	87305	87310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013370	CCA	2	6	87353	87358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013370	ACA	2	6	87371	87376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013370	CCA	2	6	87415	87420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013370	TTA	2	6	87521	87526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013370	TGA	2	6	87561	87566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013370	TAG	2	6	87568	87573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013370	ATC	2	6	87588	87593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013370	GGT	2	6	87597	87602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013370	CTT	2	6	87634	87639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013370	TAT	2	6	90041	90046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013370	GAA	2	6	96298	96303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_013370	TAA	2	6	97879	97884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.