MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	CATC	2	8	9313	9320	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013369	AGAT	2	8	11109	11116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013369	ATGA	2	8	11172	11179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013369	TCCT	2	8	11203	11210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013369	GCAG	2	8	12500	12507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013369	CTGA	2	8	12538	12545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013369	AGTG	2	8	14336	14343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013369	CGCC	2	8	14514	14521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_013369	GTCT	2	8	15737	15744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013369	CTCA	2	8	15777	15784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013369	CAGG	2	8	16008	16015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013369	CCAC	2	8	16566	16573	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_013369	TCCG	2	8	17427	17434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013369	GTAA	2	8	17594	17601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013369	GTCA	2	8	17631	17638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013369	GTCA	2	8	17693	17700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013369	TGGC	2	8	19404	19411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013369	CAAA	2	8	21251	21258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013369	AACA	2	8	21376	21383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013369	TTAT	2	8	32297	32304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013369	CGGG	2	8	33319	33326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013369	CTGC	2	8	34132	34139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013369	ATTC	2	8	35424	35431	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013369	CGGT	2	8	35543	35550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013369	GCCT	2	8	35648	35655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013369	ATTT	2	8	35960	35967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013369	CTCC	2	8	36183	36190	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_013369	GACT	2	8	36260	36267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013369	CGGA	2	8	37005	37012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013369	TACG	2	8	37391	37398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013369	GGCT	2	8	37405	37412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013369	AGAT	2	8	37500	37507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013369	ATTG	2	8	37779	37786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013369	CTTC	2	8	38401	38408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013369	TTGT	2	8	39204	39211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013369	TCGA	2	8	39265	39272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013369	CTGC	2	8	39332	39339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013369	TCCG	2	8	40660	40667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013369	CCAG	2	8	41544	41551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013369	GTCA	2	8	41702	41709	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013369	CCTG	2	8	43036	43043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013369	TGAG	2	8	43267	43274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013369	CAGA	2	8	43306	43313	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013369	CACT	2	8	44796	44803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013369	ACTG	2	8	45947	45954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013369	ACAG	2	8	46364	46371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013369	TTGT	2	8	46549	46556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013369	CCTC	2	8	50266	50273	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_013369	GTTG	2	8	50682	50689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013369	ATAC	2	8	50705	50712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013369	TTAC	2	8	51515	51522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013369	TTTA	2	8	53016	53023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013369	GCGG	2	8	57960	57967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013369	CAGG	2	8	58749	58756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013369	GCCT	2	8	58762	58769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013369	CTAT	2	8	59932	59939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013369	ATAA	2	8	61767	61774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013369	CGCA	2	8	63712	63719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013369	TCCT	2	8	67386	67393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013369	CAGA	2	8	67823	67830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013369	GCAG	2	8	68683	68690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013369	CTGA	2	8	68721	68728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013369	AGTG	2	8	70519	70526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013369	CGCC	2	8	70697	70704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_013369	GTCT	2	8	71920	71927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013369	CTCA	2	8	71960	71967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013369	CAGG	2	8	72191	72198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013369	CCAC	2	8	72749	72756	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_013369	TCGA	2	8	73492	73499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013369	CTGC	2	8	73559	73566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013369	TCGC	2	8	75346	75353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013369	TGGT	2	8	77597	77604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013369	CTGA	2	8	77632	77639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013369	CAGC	2	8	83058	83065	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013369	TTAT	2	8	83325	83332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013369	ATTT	2	8	83393	83400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013369	ATTT	2	8	83423	83430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013369	ATTT	2	8	83818	83825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013369	GTAA	2	8	84659	84666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013369	ATCA	2	8	84954	84961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013369	TTAT	2	8	85151	85158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.