MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_1

Total Repeats: 615

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013369	AGG	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013369	AGG	2	6	3543	3548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013369	TA	3	6	7128	7133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013369	AAT	2	6	7172	7177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013369	A	7	7	7928	7934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013369	AT	3	6	7943	7948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013369	ATA	2	6	7994	7999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013369	T	6	6	8027	8032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013369	AGA	2	6	8035	8040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013369	T	6	6	9274	9279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013369	CATC	2	8	9313	9320	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013369	CAT	2	6	9353	9358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013369	ATC	3	9	9365	9373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013369	GGA	2	6	9417	9422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013369	AAT	2	6	9487	9492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013369	CA	3	6	9729	9734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013369	CA	3	6	9756	9761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013369	GA	3	6	9811	9816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013369	CGG	2	6	10609	10614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013369	TGC	2	6	10658	10663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013369	TCCAGT	2	12	10809	10820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013369	T	6	6	10872	10877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013369	GCT	2	6	10889	10894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013369	CTG	2	6	10958	10963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013369	AGCCCG	2	12	10990	11001	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013369	CAC	2	6	11074	11079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013369	CGA	2	6	11103	11108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013369	AGAT	2	8	11109	11116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013369	CTG	2	6	11140	11145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013369	ATGA	2	8	11172	11179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013369	TCCT	2	8	11203	11210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013369	TAA	2	6	11236	11241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013369	CCG	2	6	11377	11382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013369	AT	3	6	11485	11490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013369	A	7	7	11492	11498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013369	ACA	2	6	11557	11562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013369	CGT	2	6	12458	12463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013369	TTC	2	6	12474	12479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013369	CAG	2	6	12488	12493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013369	GCAG	2	8	12500	12507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013369	AAC	2	6	12529	12534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013369	CTGA	2	8	12538	12545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013369	TGCTGA	2	12	12590	12601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013369	A	6	6	12612	12617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013369	CAT	2	6	12671	12676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013369	A	6	6	12680	12685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013369	GAA	2	6	12703	12708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013369	ATG	2	6	12764	12769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013369	AT	3	6	12777	12782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013369	TTA	2	6	12817	12822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013369	GCAGAA	2	12	12899	12910	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013369	TTA	2	6	12916	12921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013369	GAT	2	6	12938	12943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013369	T	7	7	13017	13023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013369	GTGTCC	2	12	13036	13047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013369	G	6	6	13074	13079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013369	TAT	2	6	13122	13127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013369	TGT	2	6	14078	14083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013369	TTA	2	6	14084	14089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013369	ATC	2	6	14090	14095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013369	CAT	2	6	14110	14115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013369	GAA	2	6	14284	14289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013369	CTG	2	6	14322	14327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013369	AGTG	2	8	14336	14343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013369	CTT	2	6	14346	14351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013369	GC	4	8	14498	14505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013369	CGCC	2	8	14514	14521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_013369	CAA	2	6	14593	14598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013369	TA	3	6	14610	14615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013369	AAC	2	6	15671	15676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013369	AC	3	6	15675	15680	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013369	CGA	2	6	15685	15690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013369	CTG	2	6	15710	15715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013369	CAG	2	6	15722	15727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013369	GTCT	2	8	15737	15744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013369	CTCA	2	8	15777	15784	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013369	TGT	2	6	15812	15817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013369	GCA	2	6	15824	15829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013369	AGA	2	6	15845	15850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013369	AGA	2	6	15857	15862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013369	GA	3	6	15941	15946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013369	CAGG	2	8	16008	16015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013369	AAC	2	6	16088	16093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013369	ATC	2	6	16099	16104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013369	CCA	2	6	16186	16191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013369	CTG	2	6	16225	16230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013369	CAT	2	6	16344	16349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013369	AGC	2	6	16355	16360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013369	ATG	2	6	16373	16378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013369	CCAC	2	8	16566	16573	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_013369	CGT	2	6	16744	16749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013369	AGA	2	6	16797	16802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013369	CTG	2	6	16921	16926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013369	TG	3	6	16988	16993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013369	GCG	2	6	17022	17027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013369	TTC	2	6	17038	17043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013369	TGG	2	6	17052	17057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013369	GTT	2	6	17184	17189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013369	CGGTG	2	10	17268	17277	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013369	CAG	3	9	17293	17301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013369	GTG	2	6	17307	17312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013369	GCA	2	6	17340	17345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013369	AAT	2	6	17350	17355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013369	A	7	7	17386	17392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013369	CAG	2	6	17416	17421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013369	TCCG	2	8	17427	17434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013369	AG	3	6	17500	17505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013369	GTAA	2	8	17594	17601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013369	TCC	2	6	17617	17622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013369	GTCA	2	8	17631	17638	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013369	AAC	2	6	17639	17644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013369	CTT	2	6	17665	17670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013369	AGA	2	6	17679	17684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013369	GTCA	2	8	17693	17700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013369	AGA	2	6	17703	17708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013369	AGG	2	6	17724	17729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013369	GAT	2	6	17731	17736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013369	AAC	2	6	17737	17742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013369	ATA	2	6	17789	17794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013369	A	6	6	17794	17799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013369	A	7	7	17833	17839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013369	A	6	6	18558	18563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013369	A	8	8	18630	18637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013369	GTC	2	6	18662	18667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013369	TGT	3	9	19239	19247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013369	TGGC	2	8	19404	19411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013369	AT	3	6	19429	19434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013369	AGT	2	6	19455	19460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013369	AGC	2	6	19485	19490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013369	TG	3	6	19505	19510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013369	GAT	2	6	19520	19525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013369	A	6	6	19569	19574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013369	T	6	6	19617	19622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013369	A	7	7	19633	19639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013369	T	6	6	19645	19650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013369	GGT	2	6	19652	19657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013369	ACG	2	6	19820	19825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013369	TGCCGG	2	12	19832	19843	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013369	A	6	6	19851	19856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013369	TCT	2	6	19891	19896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013369	AGA	2	6	19918	19923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013369	TA	3	6	19954	19959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013369	ATC	2	6	21092	21097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013369	TCA	2	6	21206	21211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013369	GTT	2	6	21224	21229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013369	CAAA	2	8	21251	21258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013369	AAG	2	6	21266	21271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013369	ATT	2	6	21315	21320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013369	CGC	2	6	21339	21344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_013369	AACA	2	8	21376	21383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013369	GCCGC	2	10	21413	21422	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
152	NC_013369	CG	3	6	21452	21457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013369	CAA	2	6	21486	21491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013369	A	7	7	21490	21496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013369	CA	3	6	21515	21520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_013369	GCA	2	6	21524	21529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_013369	GCC	3	9	21558	21566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_013369	TGT	2	6	21608	21613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013369	CAT	3	9	21621	21629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_013369	CA	3	6	21689	21694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
161	NC_013369	CG	3	6	21817	21822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_013369	CT	3	6	31535	31540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_013369	CAA	2	6	31548	31553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_013369	GTT	2	6	31596	31601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013369	ATT	2	6	31613	31618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013369	TAG	2	6	31643	31648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_013369	A	7	7	31841	31847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013369	AGC	2	6	31854	31859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_013369	TAC	2	6	32312	32317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_013369	GTA	2	6	32362	32367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_013369	TAA	2	6	32565	32570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013369	T	6	6	32624	32629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013369	TTC	2	6	32643	32648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_013369	CAT	2	6	33138	33143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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196	NC_013369	GCT	2	6	33405	33410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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261	NC_013369	CGA	2	6	37065	37070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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265	NC_013369	AGCCAG	2	12	37354	37365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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267	NC_013369	GGCT	2	8	37405	37412	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
268	NC_013369	AGAT	2	8	37500	37507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
269	NC_013369	ATT	2	6	37587	37592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_013369	AG	3	6	37625	37630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
271	NC_013369	A	6	6	37711	37716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_013369	TA	3	6	37753	37758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_013369	ATTG	2	8	37779	37786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
274	NC_013369	T	7	7	37806	37812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_013369	CAT	2	6	37893	37898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_013369	TTA	2	6	38048	38053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_013369	CAC	2	6	38168	38173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
279	NC_013369	TCA	2	6	38174	38179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_013369	TTC	2	6	38187	38192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_013369	CGT	2	6	38194	38199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_013369	TGT	2	6	38210	38215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013369	CGG	2	6	38271	38276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_013369	TG	3	6	38311	38316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013369	ATTCC	2	10	38382	38391	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_013369	CTTC	2	8	38401	38408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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431	NC_013369	GCG	2	6	57809	57814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_013369	CGG	2	6	57848	57853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_013369	AAC	2	6	68712	68717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_013369	CTGA	2	8	68721	68728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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493	NC_013369	A	6	6	68863	68868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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