MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128 plasmid pO111_3

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013366	AGG	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013366	AGG	2	6	3543	3548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013366	AAT	2	6	7172	7177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013366	CAT	2	6	7712	7717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013366	GCT	2	6	7793	7798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013366	GCC	2	6	7898	7903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013366	CAG	2	6	9555	9560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013366	CAG	2	6	9591	9596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013366	AGG	2	6	9682	9687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013366	CAG	2	6	9711	9716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013366	TGG	2	6	10289	10294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013366	GAA	2	6	10396	10401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013366	AGC	2	6	10463	10468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013366	ACA	3	9	10643	10651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013366	TTC	2	6	10702	10707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013366	TGG	2	6	10719	10724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013366	CTT	2	6	10925	10930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013366	AGA	2	6	10942	10947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013366	AGC	2	6	11221	11226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013366	AAT	2	6	11256	11261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013366	GTA	2	6	12995	13000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013366	AGA	2	6	13469	13474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013366	CTT	2	6	13555	13560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013366	CCT	2	6	14466	14471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013366	AAT	2	6	14475	14480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013366	CAC	2	6	14538	14543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013366	TCA	2	6	14559	14564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013366	GCC	2	6	14700	14705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013366	ACT	2	6	14758	14763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013366	GCG	2	6	14840	14845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013366	ACA	2	6	14871	14876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013366	ACC	2	6	14887	14892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013366	TGT	2	6	15005	15010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013366	TAA	2	6	15014	15019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013366	TCT	2	6	15036	15041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013366	TCG	2	6	15124	15129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013366	CCG	2	6	15777	15782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013366	GCC	2	6	17125	17130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013366	TCA	2	6	17201	17206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013366	AGA	2	6	17220	17225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013366	AAG	2	6	17252	17257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013366	GCA	2	6	17275	17280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013366	TCT	2	6	17324	17329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013366	AAG	2	6	17336	17341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013366	TCG	2	6	17345	17350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013366	CTT	2	6	17381	17386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013366	TCT	2	6	22193	22198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013366	ATC	2	6	22372	22377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013366	ATG	2	6	22459	22464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013366	ATA	2	6	22485	22490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013366	TTA	2	6	22498	22503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013366	TTA	2	6	22550	22555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013366	GCG	2	6	23911	23916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013366	TGA	2	6	24817	24822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013366	AGA	2	6	24928	24933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013366	TGA	2	6	24937	24942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013366	TCA	2	6	24983	24988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013366	CTT	2	6	25004	25009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013366	GAT	2	6	25028	25033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013366	GAA	2	6	26395	26400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013366	ATC	2	6	26427	26432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013366	GTT	2	6	26463	26468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013366	GCT	2	6	26714	26719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013366	AGA	2	6	26736	26741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013366	CTT	2	6	26765	26770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013366	TTG	2	6	28278	28283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013366	ACT	2	6	28340	28345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013366	GAG	2	6	28364	28369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013366	CGC	2	6	28476	28481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013366	GTG	2	6	28588	28593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013366	CCG	2	6	28706	28711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013366	GCC	2	6	30054	30059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_013366	TCA	2	6	30130	30135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013366	AGA	2	6	30149	30154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013366	AAG	2	6	30181	30186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013366	GCA	2	6	30204	30209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013366	TCT	2	6	30253	30258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013366	AAG	2	6	30265	30270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013366	TCG	2	6	30274	30279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013366	CTT	2	6	30310	30315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013366	AAC	2	6	30591	30596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013366	GGA	2	6	30597	30602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013366	GGC	2	6	31046	31051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013366	GCC	2	6	31055	31060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_013366	GCC	2	6	31712	31717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013366	TGT	4	12	31862	31873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013366	CTG	2	6	31882	31887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013366	ACT	2	6	31899	31904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013366	GTT	2	6	31910	31915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013366	GGC	2	6	31952	31957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013366	GTC	2	6	31963	31968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013366	GCT	2	6	31989	31994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013366	CCG	2	6	32012	32017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013366	CGC	2	6	32096	32101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013366	GCC	2	6	32145	32150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013366	CGT	2	6	32191	32196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013366	GCG	2	6	32198	32203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013366	GTT	2	6	32215	32220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013366	AGG	2	6	32600	32605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013366	GCC	2	6	32968	32973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013366	GGC	2	6	32982	32987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013366	AGC	2	6	33019	33024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013366	GCC	2	6	33047	33052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013366	ACA	2	6	33093	33098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013366	ATG	2	6	33153	33158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013366	CTC	2	6	33230	33235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013366	TGA	2	6	33352	33357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013366	GAT	2	6	33376	33381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013366	CGC	2	6	33422	33427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_013366	CGT	2	6	33431	33436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013366	GAG	2	6	33503	33508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013366	CGT	2	6	33566	33571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013366	TCA	2	6	33681	33686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013366	GAT	2	6	33788	33793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013366	CAT	2	6	33796	33801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013366	CAC	2	6	33802	33807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013366	CAA	2	6	33860	33865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013366	GCG	3	9	33924	33932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013366	CAT	2	6	33997	34002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013366	AGA	2	6	34126	34131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013366	CCG	2	6	34163	34168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_013366	GCC	2	6	34220	34225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_013366	AGA	2	6	34267	34272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013366	AAT	2	6	34307	34312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013366	CGC	2	6	34472	34477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013366	CCG	2	6	34776	34781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_013366	CAG	2	6	34877	34882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013366	GAG	2	6	34913	34918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013366	CGA	2	6	34953	34958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013366	ATT	2	6	34961	34966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013366	ACT	2	6	35271	35276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013366	GGC	2	6	35324	35329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013366	GTC	2	6	35335	35340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013366	GCT	2	6	35361	35366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013366	CCG	2	6	35384	35389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013366	CGC	2	6	35468	35473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013366	CGT	2	6	35563	35568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013366	GCG	2	6	35570	35575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013366	GTT	2	6	35587	35592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013366	GAT	2	6	35868	35873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013366	GAT	2	6	36776	36781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013366	GCA	2	6	38776	38781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_013366	GCT	2	6	76847	76852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_013366	CAT	2	6	76944	76949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_013366	ATC	2	6	77023	77028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_013366	GTT	2	6	77060	77065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013366	TAC	2	6	77156	77161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_013366	TAT	2	6	77295	77300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013366	TAA	2	6	77422	77427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013366	TAT	3	9	77540	77548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_013366	TGT	2	6	77555	77560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_013366	CTT	2	6	77608	77613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.