MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013364	GAAAAT	2	12	10613	10624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013364	AAAGGA	2	12	18820	18831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013364	TTTCAC	2	12	19583	19594	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013364	AAGGGA	2	12	86086	86097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013364	TCTCCC	2	12	166076	166087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013364	GTAGTG	2	12	201726	201737	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013364	AACAAA	2	12	239364	239375	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013364	AGGGAG	2	12	297310	297321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013364	TGACGG	2	12	333680	333691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013364	AGCTAA	2	12	347786	347797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013364	TTGGTG	2	12	348073	348084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013364	ACGTTG	2	12	349285	349296	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013364	TTTTCT	2	12	356369	356380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013364	CTATTT	2	12	357405	357416	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013364	TTTATT	2	12	389063	389074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013364	TATTGA	2	12	426781	426792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013364	GGTGAA	2	12	432610	432621	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013364	AACAAT	2	12	447091	447102	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013364	TATTGA	2	12	449937	449948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013364	GCAATG	2	12	463915	463926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013364	TTTTCA	2	12	514420	514431	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013364	CAGGCG	2	12	535802	535813	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013364	CGCTAC	2	12	569080	569091	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013364	TGTCGC	2	12	570629	570640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013364	AACCGG	2	12	571195	571206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013364	GCACCG	2	12	608585	608596	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013364	AATATG	2	12	619336	619347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013364	TGCAAA	2	12	658985	658996	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013364	TGGCGA	2	12	682356	682367	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013364	ATTTTT	2	12	755069	755080	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013364	AACCAG	2	12	762857	762868	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013364	TTTACC	2	12	765982	765993	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013364	TGCTAT	2	12	844696	844707	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013364	CAATAT	2	12	844771	844782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013364	GTACAA	2	12	857292	857303	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013364	CAGCGA	2	12	858169	858180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013364	AGCATG	2	12	884730	884741	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013364	TTGATG	2	12	885453	885464	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013364	AATATT	2	12	900980	900991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013364	CAGAAA	2	12	913212	913223	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013364	TAACCG	2	12	1011765	1011776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013364	AAATAA	2	12	1043604	1043615	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013364	AAAGAT	2	12	1076134	1076145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013364	TGTCCA	2	12	1096933	1096944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013364	TAAGGA	2	12	1119201	1119212	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013364	ATAATG	2	12	1120615	1120626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013364	CTGGTT	2	12	1123222	1123233	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013364	AGATGT	2	12	1192049	1192060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013364	GTGTGA	2	12	1222797	1222808	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013364	TGTTAA	2	12	1279495	1279506	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013364	ACTTCA	2	12	1281726	1281737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013364	CTGAAC	2	12	1299155	1299166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013364	ATTCAA	2	12	1309339	1309350	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013364	ATTTTT	2	12	1320530	1320541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013364	CAAAAA	2	12	1373490	1373501	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013364	TTTATT	2	12	1459487	1459498	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013364	CTTTTT	2	12	1469154	1469165	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013364	AGGCGA	2	12	1476111	1476122	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013364	ATTTTA	2	12	1491311	1491322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013364	TTTTGT	2	12	1514347	1514358	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013364	GACAGT	2	12	1516361	1516372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013364	CACAGG	2	12	1516697	1516708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013364	ACGCTT	2	12	1534966	1534977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013364	ACTCGA	2	12	1534986	1534997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013364	CAGGCT	2	12	1535118	1535129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013364	CTTATT	2	12	1587003	1587014	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013364	CAAAAG	2	12	1593899	1593910	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013364	GGGGGT	2	12	1602119	1602130	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013364	CTGATC	2	12	1604376	1604387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013364	AACAGA	2	12	1606605	1606616	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013364	AAAAAT	2	12	1623514	1623525	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013364	GACGGA	2	12	1636605	1636616	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013364	AATCTG	2	12	1645051	1645062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013364	GAAACA	2	12	1676359	1676370	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013364	CTATAA	2	12	1687483	1687494	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013364	CTTTTT	2	12	1757159	1757170	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013364	GTGTCG	2	12	1856653	1856664	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013364	TTTTAT	2	12	1865084	1865095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013364	AAAAGA	2	12	1865258	1865269	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013364	AAAAAC	2	12	1889554	1889565	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013364	ATTAAT	2	12	1890243	1890254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013364	ACCGTT	2	12	1904432	1904443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013364	TTTCAT	2	12	1913250	1913261	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013364	GTTATG	2	12	1913264	1913275	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013364	ACCGCT	2	12	1931417	1931428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013364	CGTACC	2	12	1933328	1933339	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013364	TGCCTG	2	12	1935284	1935295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013364	GATATA	2	12	1935378	1935389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013364	AAGCGA	2	12	1943070	1943081	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013364	TTTCTG	2	12	1954209	1954220	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013364	CAAAAA	2	12	1973374	1973385	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013364	TAAATA	2	12	1975174	1975185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013364	AAAAAC	2	12	1987146	1987157	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013364	ATGCTG	2	12	2004612	2004623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013364	ATGAAG	2	12	2005047	2005058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013364	TGATTA	2	12	2009524	2009535	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013364	GCCAGT	2	12	2021604	2021615	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013364	CCCCAG	2	12	2023788	2023799	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013364	AATAAA	2	12	2036442	2036453	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013364	TACCAT	2	12	2055425	2055436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013364	ATACTT	2	12	2137059	2137070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013364	AAAATA	2	12	2150716	2150727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013364	TGTTTT	2	12	2151349	2151360	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013364	AAGACT	2	12	2151609	2151620	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013364	CAGTTC	2	12	2194772	2194783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013364	GAACAG	2	12	2231681	2231692	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013364	TATTAC	2	12	2291130	2291141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013364	TTTCTT	2	12	2312432	2312443	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013364	ATAACC	2	12	2316376	2316387	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013364	ACTGTC	2	12	2360032	2360043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013364	CATTAA	2	12	2371762	2371773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013364	TTTCAT	2	12	2373905	2373916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013364	AATAAA	2	12	2417708	2417719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013364	TTAATG	2	12	2467762	2467773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013364	AATTCA	2	12	2474887	2474898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013364	TCTTAT	2	12	2488704	2488715	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013364	GTGTAT	2	12	2504429	2504440	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013364	ATATTT	2	12	2525844	2525855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013364	CCGGAA	2	12	2565270	2565281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013364	GAACCA	2	12	2584420	2584431	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013364	GTACTG	2	12	2591021	2591032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013364	ATTTTT	2	12	2594704	2594715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013364	CTGATA	2	12	2603795	2603806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013364	TTCTGC	2	12	2605785	2605796	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013364	GCTCCT	2	12	2634297	2634308	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013364	ATGAAA	2	12	2652321	2652332	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013364	AATATT	2	12	2681948	2681959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013364	GCCATA	3	18	2701492	2701509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013364	TCCCCC	2	12	2722124	2722135	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
130	NC_013364	GAAAAA	2	12	2765998	2766009	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013364	ATACCG	2	12	2766375	2766386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013364	CCTTAC	2	12	2772502	2772513	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013364	CCTTAC	2	12	2773110	2773121	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013364	CCTGTT	2	12	2784597	2784608	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013364	ACGCAG	2	12	2803004	2803015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013364	TCGCTA	2	12	2821020	2821031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013364	TCTTCC	2	12	2832653	2832664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013364	CCACTA	2	12	2932931	2932942	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013364	CATTGC	2	12	2947732	2947743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013364	TAAATG	2	12	2983641	2983652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013364	TGTCAC	2	12	2997275	2997286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013364	AGAAAA	2	12	3007555	3007566	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013364	GTTAAC	2	12	3045970	3045981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_013364	GTTAAC	2	12	3046034	3046045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_013364	CTGATG	2	12	3064795	3064806	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_013364	GTTATG	2	12	3082636	3082647	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013364	CAAGTG	2	12	3099749	3099760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_013364	TCCTTC	2	12	3200336	3200347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013364	CTGTAC	2	12	3239877	3239888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_013364	CGCCAG	2	12	3241938	3241949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_013364	TGGACA	2	12	3250122	3250133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_013364	CAGTTT	2	12	3264726	3264737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_013364	GGGCGG	2	12	3276236	3276247	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_013364	ACAGCA	2	12	3330311	3330322	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013364	AAAAAT	2	12	3336882	3336893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013364	ATGAAA	2	12	3346559	3346570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013364	ATTAAC	2	12	3351573	3351584	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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160	NC_013364	GGTTTT	2	12	3485971	3485982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_013364	AATTTT	2	12	3568345	3568356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013364	ATCGGT	2	12	3577726	3577737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.