MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128

Total Repeats: 649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013364	GTTTT	2	10	19282	19291	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013364	TTAAT	2	10	22303	22312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013364	ATTTA	2	10	31136	31145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013364	TAGTG	2	10	77370	77379	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013364	ATTTT	2	10	79086	79095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013364	GGCAT	2	10	143480	143489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013364	GTAAG	2	10	144244	144253	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013364	TCCTC	2	10	145964	145973	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013364	GCGGT	2	10	151181	151190	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013364	AAATT	2	10	158588	158597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013364	TTATC	2	10	168886	168895	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013364	TACGT	2	10	183762	183771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013364	TGGCC	2	10	185487	185496	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013364	AAATA	2	10	194094	194103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013364	GTCTG	2	10	194179	194188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013364	TGCGC	2	10	217363	217372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013364	CGGTT	2	10	224824	224833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013364	GCGCG	2	10	243390	243399	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013364	CCAGA	2	10	243459	243468	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013364	ATCGC	2	10	245827	245836	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013364	CCAGC	2	10	255720	255729	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_013364	CCAGG	2	10	256376	256385	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013364	AAGGC	2	10	256503	256512	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013364	AAAAT	2	10	261357	261366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013364	CTAAT	2	10	261571	261580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013364	ACTGT	2	10	262626	262635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013364	GGGCA	2	10	269664	269673	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013364	AAAAG	2	10	270143	270152	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013364	GTAAC	2	10	270504	270513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013364	ATATT	2	10	270626	270635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013364	GATGC	2	10	277131	277140	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013364	AATTA	2	10	287553	287562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013364	AAGCG	2	10	294764	294773	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013364	CGAAA	2	10	311407	311416	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013364	TGTTA	2	10	345915	345924	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013364	TTGAT	2	10	346804	346813	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013364	GCGTG	2	10	347545	347554	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013364	AGCAA	2	10	348636	348645	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013364	CAAAA	2	10	356393	356402	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013364	ATTAG	2	10	356426	356435	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013364	TTCCC	2	10	360896	360905	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_013364	AAAAT	2	10	361638	361647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013364	TGTCA	2	10	367847	367856	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013364	ATTTT	2	10	367911	367920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013364	CGCTT	2	10	390042	390051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013364	TTGCG	2	10	409946	409955	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013364	CTTCT	2	10	439180	439189	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013364	ACGCA	2	10	448534	448543	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013364	CAAAG	2	10	462280	462289	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013364	TGGCT	2	10	463061	463070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013364	CCTGG	2	10	463602	463611	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013364	GTTTC	2	10	471797	471806	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013364	CTTTT	2	10	475273	475282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013364	GGAGT	2	10	477970	477979	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013364	TAGTG	2	10	486363	486372	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013364	GTTTT	2	10	496803	496812	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013364	GAAGA	2	10	503383	503392	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013364	TCAGG	2	10	510794	510803	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013364	TGAGT	2	10	517142	517151	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013364	CAGGT	2	10	518429	518438	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013364	CCTTT	2	10	532182	532191	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013364	TCAGG	2	10	549376	549385	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013364	ATTTT	2	10	567482	567491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013364	TGGCG	2	10	567636	567645	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013364	GCCCG	2	10	567738	567747	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_013364	GCAGC	2	10	567979	567988	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013364	GCGGG	2	10	568651	568660	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013364	TGACC	2	10	569598	569607	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013364	GGTGT	2	10	570844	570853	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013364	TAAAT	2	10	571477	571486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013364	TATTT	2	10	580660	580669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013364	GTTTC	2	10	600754	600763	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013364	GGGCG	2	10	612104	612113	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013364	AGCCC	2	10	633822	633831	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_013364	GGTGT	2	10	634903	634912	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013364	ACCGG	2	10	636692	636701	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013364	CCGTA	2	10	639816	639825	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013364	GTCAG	2	10	655202	655211	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013364	GTCAG	2	10	655705	655714	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013364	GCAGT	2	10	658930	658939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013364	GTTAA	2	10	676102	676111	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013364	TCCCA	2	10	681196	681205	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_013364	TGGGT	2	10	681437	681446	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013364	ATAGC	2	10	684058	684067	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013364	AAACG	2	10	689682	689691	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013364	TATAT	2	10	702517	702526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013364	TGCTA	2	10	702763	702772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013364	ATTTG	2	10	704204	704213	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013364	TCAAT	2	10	706509	706518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013364	GGAAC	2	10	707698	707707	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013364	CGTAA	2	10	708906	708915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013364	GCATA	2	10	721102	721111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013364	AGCAA	2	10	721209	721218	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013364	ATATT	2	10	722831	722840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013364	CAGGG	2	10	749722	749731	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013364	ATAAA	2	10	754819	754828	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013364	TCGCG	2	10	755006	755015	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013364	AGGCC	2	10	762579	762588	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013364	CGATG	2	10	782154	782163	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013364	AGAAA	2	10	796260	796269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013364	ATTTT	2	10	796540	796549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013364	AGCGC	2	10	801959	801968	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_013364	ATACA	2	10	809210	809219	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013364	TATAA	2	10	814122	814131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013364	GTCGT	2	10	823648	823657	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013364	AAGCG	2	10	824512	824521	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013364	TTGAG	2	10	824846	824855	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013364	GATGC	2	10	848903	848912	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013364	GATGC	2	10	848996	849005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013364	AAAAT	2	10	850499	850508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013364	GTATG	2	10	853286	853295	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013364	AATCA	2	10	855962	855971	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013364	TGAAT	2	10	859513	859522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013364	AATAA	2	10	859614	859623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013364	GACAT	2	10	883172	883181	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013364	CCTGT	2	10	883689	883698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_013364	GTTCA	2	10	885489	885498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013364	TTATA	2	10	887196	887205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013364	GTGGC	2	10	887312	887321	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013364	ACATA	2	10	916549	916558	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013364	GATGC	2	10	921815	921824	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013364	CAAAA	2	10	928414	928423	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013364	TATAT	2	10	933147	933156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013364	GTGAT	2	10	936432	936441	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013364	TAGTG	2	10	936573	936582	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013364	TAAAG	2	10	939349	939358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013364	AGTGA	2	10	939411	939420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013364	AAGTA	2	10	940225	940234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013364	ATTAA	2	10	941675	941684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013364	TGATG	2	10	948044	948053	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013364	CAGGG	2	10	966969	966978	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013364	AGTAA	2	10	978830	978839	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013364	AGCGC	2	10	988679	988688	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013364	GCAAC	2	10	1046622	1046631	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_013364	TTCAC	2	10	1060591	1060600	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013364	GATGC	2	10	1082355	1082364	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013364	AGCGA	2	10	1095054	1095063	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013364	TAGGG	2	10	1095090	1095099	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013364	ATGAC	2	10	1096794	1096803	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013364	TATTT	2	10	1096857	1096866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013364	TTTTC	2	10	1104832	1104841	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013364	TTATT	2	10	1105642	1105651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013364	TTCTT	2	10	1107575	1107584	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013364	GTACA	2	10	1110111	1110120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013364	TTATG	2	10	1110268	1110277	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013364	CTTAT	2	10	1120771	1120780	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013364	GAACG	2	10	1121151	1121160	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_013364	GTTTT	2	10	1121341	1121350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013364	GTTTC	2	10	1123146	1123155	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_013364	GTTCC	2	10	1123204	1123213	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_013364	GTTCT	2	10	1145163	1145172	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_013364	ATTAT	2	10	1146520	1146529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013364	GCATC	2	10	1157298	1157307	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_013364	TAAAA	2	10	1167215	1167224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_013364	CCTGA	2	10	1222343	1222352	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_013364	TCCTT	2	10	1242944	1242953	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
165	NC_013364	GTTTA	2	10	1243635	1243644	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013364	TCGCA	2	10	1243927	1243936	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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169	NC_013364	TCGCT	2	10	1263879	1263888	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
170	NC_013364	TCGCT	2	10	1264058	1264067	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
171	NC_013364	CAATA	2	10	1269259	1269268	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_013364	TTTTA	2	10	1281783	1281792	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_013364	GCCCT	2	10	1317565	1317574	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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184	NC_013364	TCTGT	2	10	1328693	1328702	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_013364	CCTGC	2	10	1936351	1936360	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
262	NC_013364	TTATT	2	10	1936607	1936616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_013364	TTTAA	2	10	2011854	2011863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_013364	CAGTG	2	10	2108451	2108460	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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299	NC_013364	ATTTT	2	10	2233242	2233251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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