MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013361	GAAAAT	2	12	10613	10624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013361	AAAGGA	2	12	18836	18847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013361	TTTCAC	2	12	19599	19610	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013361	AAGGGA	2	12	86102	86113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013361	TCTCCC	2	12	167274	167285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013361	GTAGTG	2	12	202920	202931	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013361	CACAAT	2	12	285969	285980	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013361	AGGGAG	2	12	288470	288481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013361	AATCAA	2	12	325146	325157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013361	GTGCAG	2	12	333992	334003	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013361	TAAGGG	2	12	348339	348350	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013361	TTTTCT	2	12	359871	359882	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013361	CTATTT	2	12	360907	360918	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013361	TTTATT	2	12	392564	392575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013361	TATTGA	2	12	430283	430294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013361	GGTGAA	2	12	437373	437384	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013361	CTACGG	2	12	438561	438572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013361	AACGGT	2	12	438610	438621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013361	GGCGCT	2	12	438715	438726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013361	AACAAT	2	12	452628	452639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013361	TATTGA	2	12	455474	455485	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013361	TTTTCA	2	12	520007	520018	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013361	CAGGCG	2	12	540129	540140	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013361	CGCTAC	2	12	573405	573416	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013361	TGTCGC	2	12	574954	574965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013361	AACCGG	2	12	575520	575531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013361	ATTTCA	2	12	621774	621785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013361	TGGAAC	2	12	622142	622153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013361	CAGGAG	2	12	626097	626108	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013361	AATAAA	2	12	628030	628041	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013361	AATATG	2	12	659106	659117	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013361	TGCAAA	2	12	698692	698703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013361	ATTTTT	2	12	794778	794789	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013361	TTTACC	2	12	805688	805699	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013361	CAAATA	2	12	848917	848928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013361	TCGCTG	2	12	907638	907649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013361	TTGTAC	2	12	908515	908526	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013361	GTGATG	2	12	909491	909502	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013361	AGCATG	2	12	937207	937218	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013361	AATATT	2	12	956165	956176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013361	TTTCTG	2	12	972308	972319	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013361	TAACCG	2	12	1060677	1060688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013361	AAATAA	2	12	1092516	1092527	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013361	AAAGAT	2	12	1126328	1126339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013361	TGTCCA	2	12	1147127	1147138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013361	TAAGGA	2	12	1169394	1169405	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013361	ATAATG	2	12	1170808	1170819	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013361	AAATTT	3	18	1227276	1227293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013361	TTCCGG	2	12	1239854	1239865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013361	CTTTTT	2	12	1255002	1255013	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013361	GAACCA	2	12	1306612	1306623	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013361	TGTTAA	2	12	1308057	1308068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013361	ACTTCA	2	12	1310288	1310299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013361	ATTCAA	2	12	1337748	1337759	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013361	ATTTTT	2	12	1348945	1348956	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013361	CAAAAA	2	12	1410401	1410412	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013361	CTTTTT	2	12	1505483	1505494	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013361	ACCTGC	2	12	1530675	1530686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013361	TGCCGT	2	12	1531175	1531186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013361	TTTATT	2	12	1586730	1586741	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013361	CTTTTT	2	12	1596235	1596246	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013361	TTTTGT	2	12	1646534	1646545	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013361	ACGCTT	2	12	1667155	1667166	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013361	ACTCGA	2	12	1667175	1667186	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013361	CAGGCT	2	12	1667307	1667318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013361	CTTATT	2	12	1719015	1719026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013361	CAAAAG	2	12	1725911	1725922	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013361	GGGGGT	2	12	1734131	1734142	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013361	CTGATC	2	12	1736388	1736399	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013361	GTTTTT	2	12	1752184	1752195	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013361	TTAAAA	2	12	1763976	1763987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013361	CTTCAT	2	12	1772138	1772149	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013361	CTATAA	2	12	1815377	1815388	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013361	ATTTAA	2	12	1876975	1876986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013361	ACGGCT	2	12	1984712	1984723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013361	TTTTAT	2	12	2009797	2009808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013361	AAAAGA	2	12	2009972	2009983	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013361	AAAAAC	2	12	2034254	2034265	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013361	ATTAAT	2	12	2034943	2034954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013361	ACCGTT	2	12	2048841	2048852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013361	TTTCAT	2	12	2057659	2057670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013361	GTTATG	2	12	2057673	2057684	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013361	TTTCTG	2	12	2097275	2097286	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013361	CAAAAA	2	12	2117216	2117227	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_013361	TAAATA	2	12	2119016	2119027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013361	TTTTTC	2	12	2120736	2120747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013361	TGACAG	2	12	2145543	2145554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013361	AAAAAC	2	12	2154098	2154109	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013361	GATAAA	2	12	2157266	2157277	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013361	CTGTAA	2	12	2168130	2168141	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013361	CCGGAA	2	12	2200429	2200440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013361	TACCAT	2	12	2224399	2224410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013361	TGCTGG	2	12	2254659	2254670	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013361	ATACTT	2	12	2320911	2320922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013361	AAAATA	2	12	2334568	2334579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013361	TGTTTT	2	12	2335201	2335212	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013361	AAGACT	2	12	2335461	2335472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013361	GAACAG	2	12	2418881	2418892	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013361	TATTAC	2	12	2479608	2479619	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013361	TTTCTT	2	12	2499597	2499608	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013361	ATAACC	2	12	2503541	2503552	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013361	TTAAAT	2	12	2575570	2575581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013361	ACTGTC	2	12	2596563	2596574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013361	CATTAA	2	12	2608293	2608304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013361	TTTCAT	2	12	2610436	2610447	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013361	TTAATG	2	12	2655951	2655962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013361	AATTCA	2	12	2663076	2663087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013361	TCTTAT	2	12	2714225	2714236	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013361	ATGGTG	2	12	2742513	2742524	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013361	TTCGAA	2	12	2745544	2745555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013361	CCCGCC	2	12	2754648	2754659	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
112	NC_013361	ACAGAC	2	12	2785913	2785924	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013361	ATTTTT	2	12	2792688	2792699	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013361	CTGATA	2	12	2801777	2801788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013361	CGTCAC	2	12	2829325	2829336	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013361	TTTTGT	2	12	2876633	2876644	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013361	GTTTAG	2	12	2897020	2897031	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013361	TGGGAG	2	12	2898285	2898296	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013361	AGTGCC	2	12	2899358	2899369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013361	CTTCTG	2	12	2903077	2903088	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013361	TCCCCC	2	12	2906218	2906229	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
122	NC_013361	TGCCAG	2	12	2924365	2924376	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013361	GAAAAA	2	12	2950111	2950122	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013361	ATACCG	2	12	2950488	2950499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013361	CCTTAC	2	12	2956615	2956626	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013361	CCTTAC	2	12	2957223	2957234	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013361	GCACCT	2	12	2965727	2965738	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013361	GAAGAC	2	12	2966008	2966019	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013361	CCTGTT	2	12	2971009	2971020	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013361	ACGCAG	2	12	2989416	2989427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013361	TCTTCC	2	12	3019079	3019090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013361	TATGTG	2	12	3043774	3043785	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013361	TGACCG	2	12	3095038	3095049	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013361	AGAAAT	8	48	3123141	3123188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013361	CCACTA	2	12	3153947	3153958	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013361	TAAATG	2	12	3204656	3204667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013361	TGTCAC	2	12	3218290	3218301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013361	AGAAAA	2	12	3228570	3228581	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013361	AGATAC	2	12	3305922	3305933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_013361	TTATAT	2	12	3306474	3306485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013361	CCCGAT	2	12	3328637	3328648	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013361	GTTAAC	2	12	3334339	3334350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_013361	GTTAAC	2	12	3334403	3334414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_013361	CTGATG	2	12	3353164	3353175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_013361	GTTATG	2	12	3371005	3371016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013361	CAAGTG	2	12	3388118	3388129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_013361	TCCTTC	2	12	3488692	3488703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013361	TGGACA	2	12	3538478	3538489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_013361	CAGTTT	2	12	3553082	3553093	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_013361	ATTAAC	2	12	3666399	3666410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_013361	AGGGAG	2	12	3672565	3672576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013361	CGTTTC	2	12	3768140	3768151	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013361	ATCCAG	2	12	3769100	3769111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013361	GGTTTT	2	12	3801232	3801243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013361	ACAAGA	2	12	3805563	3805574	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_013361	AATTTT	2	12	3883613	3883624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013361	ATCGCG	2	12	3945546	3945557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013361	GTAAGG	2	12	3961235	3961246	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013361	GTAAGG	2	12	3961627	3961638	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013361	ACTGAG	2	12	3989706	3989717	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_013361	GCCGTT	2	12	4035144	4035155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_013361	TGCATC	2	12	4039549	4039560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_013361	TTTTCG	2	12	4046285	4046296	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_013361	ATTTAA	2	12	4059486	4059497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013361	TTATAT	2	12	4108539	4108550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013361	GAGCAG	2	12	4115439	4115450	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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168	NC_013361	CACCCC	2	12	4125034	4125045	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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170	NC_013361	CTTTTT	2	12	4137500	4137511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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174	NC_013361	GGCGCG	2	12	4152778	4152789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_013361	TCTCCC	2	12	4160942	4160953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_013361	GTAACC	2	12	4192832	4192843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_013361	TTTTAT	2	12	4205381	4205392	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013361	ATATAA	2	12	4216148	4216159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013361	AGCGTT	2	12	4350411	4350422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
182	NC_013361	AATTTA	2	12	4464477	4464488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_013361	AACATG	2	12	4574727	4574738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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232	NC_013361	GTGATT	2	12	5621902	5621913	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
233	NC_013361	AATGAT	2	12	5662212	5662223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
234	NC_013361	TTATCA	2	12	5662305	5662316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
235	NC_013361	AGTAAA	2	12	5686261	5686272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.