MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 17981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013361	TGTT	2	8	934583	934590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_013361	GATT	2	8	934602	934609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_013361	ATGG	2	8	935542	935549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_013361	GGT	2	6	935551	935556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_013361	GTG	2	6	935562	935567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013361	TGGC	2	8	935568	935575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_013361	GA	3	6	935612	935617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_013361	GACAT	2	10	935653	935662	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3009	NC_013361	TGAA	2	8	935721	935728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_013361	C	8	8	935753	935760	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3011	NC_013361	TAT	2	6	935811	935816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013361	AC	3	6	935827	935832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_013361	TGA	2	6	935905	935910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_013361	CTG	2	6	935940	935945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_013361	AAT	2	6	935947	935952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_013361	GAG	2	6	936008	936013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_013361	TTA	2	6	936021	936026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_013361	GA	3	6	936033	936038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_013361	CCT	2	6	936054	936059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_013361	TAT	2	6	936079	936084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013361	AGC	2	6	936150	936155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_013361	CCTGT	2	10	936166	936175	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3023	NC_013361	ATG	2	6	936210	936215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_013361	GTC	2	6	936267	936272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_013361	TCAG	2	8	936286	936293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_013361	GAT	2	6	936371	936376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_013361	GTT	2	6	936517	936522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_013361	ATA	2	6	936537	936542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_013361	A	6	6	936546	936551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_013361	ATA	2	6	936559	936564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_013361	ATT	2	6	936600	936605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_013361	ATA	3	9	936613	936621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_013361	TAT	2	6	936624	936629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013361	AACG	2	8	936710	936717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_013361	GTT	2	6	936745	936750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_013361	TCA	2	6	936777	936782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_013361	CTG	2	6	936784	936789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_013361	ACG	2	6	936800	936805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_013361	TAAT	2	8	936873	936880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_013361	TA	3	6	936885	936890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_013361	TAAC	2	8	936921	936928	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_013361	TGAC	2	8	936933	936940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_013361	GTT	2	6	936962	936967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_013361	GTA	2	6	937113	937118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_013361	TGA	3	9	937150	937158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_013361	TG	3	6	937190	937195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013361	AGCATG	2	12	937207	937218	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3048	NC_013361	CGG	2	6	937223	937228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_013361	ATC	2	6	937243	937248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_013361	ATA	2	6	937325	937330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013361	AC	3	6	937394	937399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_013361	A	6	6	937400	937405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_013361	TGTT	2	8	937447	937454	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_013361	ATG	2	6	940137	940142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_013361	ATT	2	6	940146	940151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_013361	GGA	2	6	940163	940168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_013361	CAGAC	2	10	940171	940180	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3058	NC_013361	TA	3	6	940821	940826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_013361	TGGT	2	8	940853	940860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_013361	ATA	2	6	940869	940874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013361	GA	3	6	940898	940903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_013361	AGT	2	6	940918	940923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_013361	ATT	2	6	940924	940929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_013361	TCG	2	6	941405	941410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_013361	TAA	2	6	941423	941428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013361	TTG	2	6	941439	941444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_013361	TTATA	2	10	942381	942390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013361	TAG	2	6	942426	942431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_013361	T	6	6	942440	942445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_013361	ATG	2	6	942489	942494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_013361	GTGGC	2	10	942497	942506	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3072	NC_013361	A	6	6	942547	942552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_013361	AAG	2	6	942560	942565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_013361	AGT	2	6	942618	942623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_013361	TGT	2	6	942644	942649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_013361	GTA	2	6	942655	942660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_013361	T	6	6	942673	942678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_013361	AT	3	6	942686	942691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_013361	T	6	6	942736	942741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_013361	GTT	2	6	942782	942787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_013361	AAC	2	6	944719	944724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_013361	A	6	6	944725	944730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_013361	GCGA	2	8	948376	948383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3085	NC_013361	AAT	2	6	948428	948433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_013361	A	7	7	948438	948444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_013361	GGC	2	6	948485	948490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_013361	GA	3	6	948571	948576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013361	T	6	6	948632	948637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_013361	TCA	2	6	948696	948701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3093	NC_013361	TGA	2	6	948833	948838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_013361	T	7	7	948843	948849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_013361	TTG	2	6	948862	948867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_013361	ACG	2	6	948880	948885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_013361	GCCC	2	8	948903	948910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3098	NC_013361	GAA	2	6	950963	950968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_013361	TGA	2	6	950972	950977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_013361	CGC	2	6	951075	951080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_013361	AAC	2	6	951091	951096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_013361	TCT	2	6	952147	952152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_013361	TGA	2	6	952185	952190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_013361	TA	3	6	952254	952259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_013361	CCA	2	6	952397	952402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3107	NC_013361	GAAG	2	8	952407	952414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013361	GA	3	6	953451	953456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_013361	T	6	6	955154	955159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_013361	TCA	2	6	955238	955243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_013361	T	8	8	956033	956040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_013361	AATATT	2	12	956165	956176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_013361	T	6	6	956175	956180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_013361	AGTA	2	8	960002	960009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_013361	TTC	2	6	960018	960023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_013361	GA	3	6	960026	960031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_013361	TGAT	2	8	966073	966080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_013361	AGT	2	6	966271	966276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_013361	TGA	2	6	967675	967680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_013361	CTGT	2	8	967783	967790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_013361	TATGT	2	10	968973	968982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_013361	TGT	2	6	968986	968991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_013361	TGC	2	6	968999	969004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_013361	TTTCTG	2	12	972308	972319	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3125	NC_013361	ACC	2	6	972337	972342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_013361	T	6	6	972877	972882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_013361	TTG	2	6	972911	972916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_013361	GCG	2	6	972930	972935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_013361	T	6	6	973016	973021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_013361	T	7	7	973077	973083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_013361	AACC	2	8	974087	974094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_013361	GCAG	2	8	974224	974231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_013361	ATA	2	6	974265	974270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_013361	GCG	2	6	974321	974326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3136	NC_013361	TCG	2	6	974654	974659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3270	NC_013361	TA	3	6	1031461	1031466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_013361	GA	3	6	1031485	1031490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3273	NC_013361	CGGG	2	8	1032729	1032736	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3402	NC_013361	A	6	6	1089090	1089095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3403	NC_013361	A	6	6	1089108	1089113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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