MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 17981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_013361	CTG	2	6	5574644	5574649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_013361	TTC	2	6	5574666	5574671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17503	NC_013361	CGGCC	2	10	5574739	5574748	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17504	NC_013361	CTGG	2	8	5574752	5574759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17505	NC_013361	TCCT	2	8	5574809	5574816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17506	NC_013361	ACA	2	6	5575163	5575168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17507	NC_013361	TTA	2	6	5575217	5575222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17508	NC_013361	CAGA	2	8	5575246	5575253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17509	NC_013361	TGA	2	6	5575262	5575267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_013361	CGG	2	6	5575326	5575331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17511	NC_013361	CAT	2	6	5575358	5575363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17512	NC_013361	CTG	2	6	5575479	5575484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17513	NC_013361	CA	3	6	5575547	5575552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17514	NC_013361	CCA	2	6	5575700	5575705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17515	NC_013361	TAA	2	6	5575868	5575873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17516	NC_013361	CGT	2	6	5575932	5575937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17517	NC_013361	ATC	2	6	5575984	5575989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17518	NC_013361	GCT	2	6	5575995	5576000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17519	NC_013361	A	7	7	5576002	5576008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17520	NC_013361	GTT	2	6	5576051	5576056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17521	NC_013361	GCTG	8	32	5576065	5576096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17522	NC_013361	ATC	2	6	5576127	5576132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17523	NC_013361	ACC	2	6	5576208	5576213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17524	NC_013361	GGT	2	6	5576223	5576228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_013361	CTG	2	6	5576229	5576234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17526	NC_013361	CAG	2	6	5576262	5576267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17527	NC_013361	AGA	2	6	5576282	5576287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_013361	CTG	2	6	5576315	5576320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17529	NC_013361	TGG	2	6	5576406	5576411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_013361	GTT	2	6	5576417	5576422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_013361	CTGG	2	8	5576426	5576433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17532	NC_013361	GCT	2	6	5576447	5576452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17533	NC_013361	GCCA	2	8	5576460	5576467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17534	NC_013361	A	6	6	5576481	5576486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17535	NC_013361	GAA	2	6	5576514	5576519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17536	NC_013361	GAAA	2	8	5576694	5576701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_013361	TGA	2	6	5576750	5576755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_013361	CGG	2	6	5576831	5576836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17539	NC_013361	CCT	2	6	5576908	5576913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17540	NC_013361	CAT	2	6	5576931	5576936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17541	NC_013361	CT	3	6	5576978	5576983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17542	NC_013361	GAAACA	2	12	5576991	5577002	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17543	NC_013361	ACA	2	6	5577031	5577036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17544	NC_013361	ATA	2	6	5577208	5577213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17545	NC_013361	CAGA	2	8	5577229	5577236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17546	NC_013361	AAT	2	6	5577339	5577344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_013361	TCG	2	6	5577467	5577472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17548	NC_013361	GGC	2	6	5577569	5577574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17549	NC_013361	TCT	2	6	5577607	5577612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17550	NC_013361	TGC	2	6	5577635	5577640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17551	NC_013361	GCT	2	6	5577651	5577656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17552	NC_013361	CAGG	2	8	5577660	5577667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17553	NC_013361	GTT	2	6	5577729	5577734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_013361	TGA	2	6	5577838	5577843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17555	NC_013361	TCA	2	6	5577937	5577942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17556	NC_013361	GGT	2	6	5577975	5577980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_013361	GGCG	2	8	5577995	5578002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17558	NC_013361	G	6	6	5578067	5578072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_013361	GAA	2	6	5578119	5578124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17560	NC_013361	CTG	2	6	5578185	5578190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17561	NC_013361	CGC	2	6	5578265	5578270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17562	NC_013361	ACA	2	6	5578277	5578282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17563	NC_013361	TGG	2	6	5578315	5578320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17564	NC_013361	ATC	2	6	5578326	5578331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17565	NC_013361	ATG	2	6	5578354	5578359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17566	NC_013361	GAA	2	6	5578392	5578397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17567	NC_013361	AG	3	6	5578485	5578490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17568	NC_013361	TTTA	2	8	5579010	5579017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17569	NC_013361	TCAT	2	8	5579271	5579278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17570	NC_013361	TCT	2	6	5579297	5579302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17571	NC_013361	TTA	2	6	5579325	5579330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17572	NC_013361	ACC	2	6	5579346	5579351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17573	NC_013361	ATTT	2	8	5580212	5580219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17574	NC_013361	GA	3	6	5580729	5580734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17575	NC_013361	TCT	2	6	5581254	5581259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17576	NC_013361	ACC	2	6	5582033	5582038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17577	NC_013361	CAC	2	6	5582070	5582075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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17580	NC_013361	TAC	2	6	5583485	5583490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17582	NC_013361	TAT	2	6	5583630	5583635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17583	NC_013361	T	7	7	5583735	5583741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17584	NC_013361	TACT	2	8	5584147	5584154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17585	NC_013361	AAT	2	6	5584191	5584196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17587	NC_013361	CG	3	6	5584264	5584269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17591	NC_013361	AT	3	6	5584407	5584412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17592	NC_013361	T	7	7	5584430	5584436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17593	NC_013361	TAT	2	6	5586195	5586200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_013361	GCC	2	6	5586238	5586243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17595	NC_013361	AAT	2	6	5586259	5586264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17596	NC_013361	TAT	2	6	5586273	5586278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17597	NC_013361	TGT	2	6	5588081	5588086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17598	NC_013361	T	7	7	5588093	5588099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17599	NC_013361	T	6	6	5588144	5588149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17600	NC_013361	ATT	2	6	5588183	5588188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17601	NC_013361	TAAA	2	8	5588189	5588196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17602	NC_013361	AG	3	6	5588198	5588203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17603	NC_013361	TCT	2	6	5588231	5588236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17606	NC_013361	AAG	3	9	5588533	5588541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17607	NC_013361	GTT	2	6	5588592	5588597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17608	NC_013361	ATTT	2	8	5588622	5588629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17609	NC_013361	GTG	2	6	5588672	5588677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17610	NC_013361	TCA	2	6	5588717	5588722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17611	NC_013361	TC	3	6	5588770	5588775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17612	NC_013361	TTG	2	6	5588785	5588790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_013361	GAT	2	6	5588807	5588812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17614	NC_013361	A	6	6	5588914	5588919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17615	NC_013361	CCAG	2	8	5588991	5588998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17616	NC_013361	AAT	2	6	5589000	5589005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17617	NC_013361	ATA	2	6	5589031	5589036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17618	NC_013361	CTA	2	6	5589038	5589043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17619	NC_013361	TAA	2	6	5589095	5589100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17620	NC_013361	T	6	6	5589148	5589153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17621	NC_013361	AT	3	6	5589189	5589194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17622	NC_013361	ATG	2	6	5589215	5589220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17623	NC_013361	TTA	3	9	5589225	5589233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17624	NC_013361	AT	3	6	5589254	5589259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17625	NC_013361	TTA	2	6	5589303	5589308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17626	NC_013361	AGA	2	6	5589343	5589348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.