MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 17981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_013361	CGC	2	6	5486179	5486184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17002	NC_013361	CAA	2	6	5486275	5486280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17003	NC_013361	A	7	7	5486851	5486857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_013361	CT	3	6	5486921	5486926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17005	NC_013361	A	6	6	5488316	5488321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_013361	TAAA	2	8	5488445	5488452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_013361	A	6	6	5488450	5488455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_013361	CGT	2	6	5488522	5488527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17009	NC_013361	GCA	2	6	5488560	5488565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17010	NC_013361	GTT	2	6	5491915	5491920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_013361	CGC	2	6	5491947	5491952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17012	NC_013361	T	6	6	5494181	5494186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17013	NC_013361	CGTTT	2	10	5494187	5494196	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17014	NC_013361	CGC	2	6	5494235	5494240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17015	NC_013361	GTA	2	6	5494260	5494265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_013361	ACA	2	6	5494285	5494290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_013361	TTGGG	2	10	5494293	5494302	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_013361	TA	4	8	5494318	5494325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_013361	T	7	7	5494352	5494358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_013361	T	6	6	5494419	5494424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_013361	CAA	2	6	5494448	5494453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17022	NC_013361	ACA	2	6	5494456	5494461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17023	NC_013361	GACA	2	8	5494466	5494473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17024	NC_013361	GAA	2	6	5496212	5496217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_013361	GATA	2	8	5496258	5496265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_013361	GAT	3	9	5496286	5496294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_013361	GA	3	6	5496344	5496349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_013361	GCC	2	6	5496361	5496366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17029	NC_013361	CCAGA	2	10	5496417	5496426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17030	NC_013361	ATC	2	6	5496431	5496436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_013361	GGCA	2	8	5496517	5496524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17032	NC_013361	CGG	2	6	5496576	5496581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17033	NC_013361	ATC	2	6	5496644	5496649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17034	NC_013361	GGT	2	6	5496667	5496672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17035	NC_013361	TGC	2	6	5496721	5496726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17036	NC_013361	TCA	2	6	5496750	5496755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17037	NC_013361	CAC	3	9	5496856	5496864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17038	NC_013361	GCT	2	6	5497008	5497013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17039	NC_013361	TCA	2	6	5497032	5497037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17040	NC_013361	GCC	2	6	5497087	5497092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17041	NC_013361	T	7	7	5497095	5497101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17042	NC_013361	ACCG	2	8	5497120	5497127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17043	NC_013361	AGA	3	9	5497134	5497142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_013361	CCG	2	6	5497265	5497270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17045	NC_013361	GCA	2	6	5497284	5497289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17046	NC_013361	GAA	2	6	5497294	5497299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17047	NC_013361	GA	3	6	5497314	5497319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_013361	T	7	7	5497357	5497363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_013361	CAC	2	6	5497441	5497446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17050	NC_013361	CGCC	2	8	5497518	5497525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17051	NC_013361	TCAA	2	8	5497533	5497540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17052	NC_013361	CGAT	2	8	5497542	5497549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17053	NC_013361	TCA	2	6	5497570	5497575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17054	NC_013361	TTGG	2	8	5497601	5497608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_013361	AT	3	6	5497616	5497621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_013361	TGT	2	6	5498645	5498650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_013361	GTT	2	6	5498661	5498666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_013361	ATT	2	6	5498669	5498674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_013361	CAG	2	6	5498739	5498744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17060	NC_013361	TAT	2	6	5498746	5498751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17061	NC_013361	ATT	2	6	5498773	5498778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_013361	TTA	2	6	5498788	5498793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17063	NC_013361	GCG	2	6	5498797	5498802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_013361	T	6	6	5498804	5498809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17065	NC_013361	TTA	2	6	5498945	5498950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17066	NC_013361	GTT	2	6	5501768	5501773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17067	NC_013361	GCG	2	6	5501784	5501789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17068	NC_013361	TCAA	2	8	5501815	5501822	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17069	NC_013361	T	6	6	5501860	5501865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_013361	T	7	7	5501921	5501927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_013361	AACC	2	8	5502931	5502938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17072	NC_013361	GCAG	2	8	5503068	5503075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17073	NC_013361	ATA	2	6	5503109	5503114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_013361	TCA	2	6	5503157	5503162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17075	NC_013361	TTA	2	6	5503599	5503604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17076	NC_013361	TTA	2	6	5503645	5503650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_013361	TCC	2	6	5505212	5505217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17078	NC_013361	GGA	2	6	5505346	5505351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_013361	AAT	2	6	5505370	5505375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17080	NC_013361	T	6	6	5505392	5505397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_013361	TTTCAC	2	12	5505401	5505412	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17082	NC_013361	AACG	2	8	5505467	5505474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17083	NC_013361	AGA	2	6	5505915	5505920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17087	NC_013361	CAA	2	6	5506785	5506790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17088	NC_013361	AAT	2	6	5507448	5507453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17091	NC_013361	T	6	6	5508043	5508048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_013361	T	7	7	5508053	5508059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_013361	TTA	2	6	5508090	5508095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17094	NC_013361	AT	3	6	5509624	5509629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_013361	AT	3	6	5509632	5509637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_013361	AT	3	6	5509640	5509645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_013361	AT	3	6	5509648	5509653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_013361	TAA	2	6	5509654	5509659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17099	NC_013361	TCC	2	6	5509681	5509686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17100	NC_013361	GAA	2	6	5509723	5509728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_013361	A	7	7	5509727	5509733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_013361	AAT	2	6	5509748	5509753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17103	NC_013361	CCT	2	6	5510819	5510824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17104	NC_013361	GAT	2	6	5510864	5510869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_013361	GTG	2	6	5510926	5510931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17106	NC_013361	TG	3	6	5510930	5510935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_013361	CA	3	6	5511416	5511421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17108	NC_013361	AATAAA	2	12	5511951	5511962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17109	NC_013361	CT	3	6	5511988	5511993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17110	NC_013361	CTGT	2	8	5512081	5512088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17111	NC_013361	T	6	6	5512111	5512116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_013361	TTA	2	6	5512143	5512148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17113	NC_013361	GTTT	2	8	5512174	5512181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17114	NC_013361	GA	3	6	5512196	5512201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17115	NC_013361	TG	3	6	5512214	5512219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17116	NC_013361	TGT	2	6	5512227	5512232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17117	NC_013361	TTGTTT	2	12	5512368	5512379	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17118	NC_013361	T	7	7	5512377	5512383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_013361	CAG	2	6	5512410	5512415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17120	NC_013361	GCA	2	6	5512475	5512480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17121	NC_013361	TGA	2	6	5512503	5512508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17122	NC_013361	AGT	2	6	5512652	5512657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17123	NC_013361	TTA	2	6	5512659	5512664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_013361	TA	3	6	5512725	5512730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17125	NC_013361	TTA	2	6	5512841	5512846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17126	NC_013361	TAT	2	6	5512870	5512875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17127	NC_013361	ATG	2	6	5512920	5512925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17128	NC_013361	TAT	2	6	5512988	5512993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17129	NC_013361	ATG	2	6	5513067	5513072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17130	NC_013361	TG	3	6	5513124	5513129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17131	NC_013361	CTG	2	6	5513174	5513179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17246	NC_013361	T	6	6	5539833	5539838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17247	NC_013361	CTTAC	2	10	5539845	5539854	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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17258	NC_013361	CAG	2	6	5540496	5540501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17260	NC_013361	GCC	2	6	5540648	5540653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17261	NC_013361	TCA	2	6	5540713	5540718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17262	NC_013361	TCTG	2	8	5540727	5540734	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17263	NC_013361	TAA	2	6	5540758	5540763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17264	NC_013361	TTG	2	6	5540811	5540816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17265	NC_013361	AGGA	2	8	5541164	5541171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17266	NC_013361	GTG	2	6	5541327	5541332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17269	NC_013361	AAG	2	6	5541881	5541886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17272	NC_013361	GTG	2	6	5542073	5542078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17273	NC_013361	GTT	2	6	5542128	5542133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17283	NC_013361	C	7	7	5543138	5543144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17284	NC_013361	ATTG	2	8	5543253	5543260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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17286	NC_013361	CCAGT	2	10	5543422	5543431	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17287	NC_013361	TTCA	2	8	5543432	5543439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17288	NC_013361	TGGTT	2	10	5543444	5543453	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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17292	NC_013361	TGT	2	6	5551118	5551123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17293	NC_013361	AGGT	2	8	5551140	5551147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17294	NC_013361	ATG	2	6	5551199	5551204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17295	NC_013361	TAT	2	6	5551213	5551218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17298	NC_013361	GTGAT	2	10	5551605	5551614	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17299	NC_013361	GCTG	2	8	5551671	5551678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17300	NC_013361	GGA	2	6	5551701	5551706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17301	NC_013361	TCT	2	6	5551756	5551761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17302	NC_013361	CTG	2	6	5551766	5551771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17309	NC_013361	A	7	7	5552179	5552185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17312	NC_013361	TAGC	2	8	5552530	5552537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17313	NC_013361	A	6	6	5552572	5552577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17319	NC_013361	TATTT	2	10	5552681	5552690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17323	NC_013361	TTG	2	6	5553110	5553115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17353	NC_013361	GGAT	2	8	5555850	5555857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17371	NC_013361	CGG	2	6	5556594	5556599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17372	NC_013361	GTC	2	6	5556716	5556721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17376	NC_013361	ATACA	2	10	5557684	5557693	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17377	NC_013361	GAATG	2	10	5557715	5557724	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17378	NC_013361	GTCA	2	8	5557737	5557744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17379	NC_013361	CCA	2	6	5557778	5557783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17380	NC_013361	GAC	2	6	5558713	5558718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17381	NC_013361	TCAGT	2	10	5558774	5558783	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17382	NC_013361	GTG	2	6	5558803	5558808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17383	NC_013361	TCA	2	6	5558821	5558826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17384	NC_013361	GTCT	2	8	5558846	5558853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17385	NC_013361	A	6	6	5559468	5559473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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