MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 17981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013361	T	7	7	1621002	1621008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_013361	A	6	6	1621041	1621046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_013361	GGC	2	6	1621419	1621424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_013361	GCC	2	6	1621430	1621435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_013361	ATCA	2	8	1621440	1621447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_013361	GAG	2	6	1624884	1624889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_013361	A	7	7	1624976	1624982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013361	AC	4	8	1624993	1625000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_013361	CGA	2	6	1625026	1625031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_013361	T	7	7	1626045	1626051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013361	AAAC	2	8	1626117	1626124	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_013361	ACA	2	6	1626129	1626134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_013361	A	7	7	1626139	1626145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013361	CA	3	6	1626378	1626383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_013361	CA	3	6	1626385	1626390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_013361	CA	3	6	1626392	1626397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_013361	T	6	6	1626416	1626421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_013361	A	7	7	1626428	1626434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_013361	T	6	6	1626602	1626607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_013361	G	6	6	1627894	1627899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_013361	T	6	6	1628689	1628694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_013361	G	6	6	1628770	1628775	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_013361	TGG	3	9	1628776	1628784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_013361	TGT	2	6	1628788	1628793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013361	ATCT	2	8	1628797	1628804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_013361	ATGA	2	8	1628807	1628814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_013361	GCAA	2	8	1628827	1628834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_013361	ATT	2	6	1629425	1629430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_013361	CTTT	2	8	1629493	1629500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_013361	T	7	7	1629498	1629504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013361	AGA	3	9	1629536	1629544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_013361	CGC	2	6	1629598	1629603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_013361	AGGA	2	8	1629625	1629632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_013361	CGA	2	6	1629635	1629640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_013361	AT	3	6	1630030	1630035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_013361	TAAT	2	8	1630062	1630069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_013361	CCA	2	6	1630273	1630278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_013361	A	8	8	1630300	1630307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_013361	GTT	2	6	1630423	1630428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_013361	GT	4	8	1630495	1630502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013361	TTAA	2	8	1630506	1630513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_013361	ATT	2	6	1632705	1632710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_013361	TAAA	2	8	1632752	1632759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013361	GGGGA	2	10	1632765	1632774	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013361	A	6	6	1632784	1632789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_013361	TAA	2	6	1632807	1632812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013361	ATA	2	6	1634896	1634901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_013361	TCAC	2	8	1636014	1636021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_013361	GGC	2	6	1636037	1636042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_013361	TAA	2	6	1637195	1637200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_013361	GTA	2	6	1637231	1637236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013361	A	6	6	1637264	1637269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013361	GTG	2	6	1637315	1637320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013361	GTT	2	6	1638653	1638658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013361	TTAT	2	8	1638659	1638666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013361	TAT	2	6	1638672	1638677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_013361	TA	3	6	1638699	1638704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_013361	A	6	6	1639120	1639125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_013361	ATTA	2	8	1639129	1639136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_013361	TA	3	6	1639148	1639153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013361	ATT	2	6	1639220	1639225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_013361	TA	3	6	1639347	1639352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013361	ATA	2	6	1639356	1639361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_013361	CATGA	2	10	1639373	1639382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5065	NC_013361	TA	3	6	1639406	1639411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_013361	GAT	2	6	1639453	1639458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_013361	GTT	2	6	1639513	1639518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_013361	AT	3	6	1639526	1639531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_013361	ATT	2	6	1639607	1639612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_013361	ATC	2	6	1639641	1639646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_013361	ATA	2	6	1640140	1640145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013361	TGT	2	6	1640303	1640308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5074	NC_013361	AAT	2	6	1641133	1641138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_013361	ATT	2	6	1641205	1641210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_013361	ACGTA	2	10	1641232	1641241	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_013361	GAT	2	6	1641253	1641258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013361	TCT	2	6	1642554	1642559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_013361	TCTT	2	8	1642564	1642571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_013361	A	6	6	1642607	1642612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013361	ATG	2	6	1642666	1642671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_013361	A	6	6	1642722	1642727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_013361	ATT	2	6	1643066	1643071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013361	TAAG	2	8	1643376	1643383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_013361	ATT	2	6	1643670	1643675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_013361	TCAT	2	8	1643697	1643704	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_013361	TGTC	2	8	1643713	1643720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_013361	TTA	2	6	1644105	1644110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_013361	AAT	2	6	1644210	1644215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_013361	CT	3	6	1644272	1644277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_013361	CT	3	6	1644284	1644289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_013361	GCGA	2	8	1644302	1644309	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5093	NC_013361	ATT	2	6	1645956	1645961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_013361	TAG	2	6	1646004	1646009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013361	ATT	2	6	1646306	1646311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_013361	AAT	2	6	1646366	1646371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_013361	TTAT	2	8	1646483	1646490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013361	TA	3	6	1646495	1646500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013361	T	6	6	1646524	1646529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_013361	TTTTGT	2	12	1646534	1646545	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_013361	TGTT	2	8	1646596	1646603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013361	AATG	2	8	1646609	1646616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_013361	AAC	2	6	1646861	1646866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_013361	CCG	2	6	1649279	1649284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5107	NC_013361	CGT	2	6	1649300	1649305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_013361	T	7	7	1650004	1650010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013361	TAAG	2	8	1650033	1650040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013361	CA	4	8	1650044	1650051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_013361	CGCT	2	8	1650091	1650098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_013361	ATT	2	6	1650099	1650104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_013361	TGA	2	6	1650131	1650136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_013361	T	6	6	1650148	1650153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_013361	AAT	2	6	1650165	1650170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013361	ATTG	2	8	1650190	1650197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_013361	AAG	2	6	1650213	1650218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013361	TGT	2	6	1650240	1650245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_013361	ATT	2	6	1650273	1650278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013361	AGA	2	6	1650298	1650303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013361	TCA	2	6	1650307	1650312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_013361	ATTTT	2	10	1650331	1650340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013361	TAT	2	6	1650379	1650384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013361	T	6	6	1650398	1650403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_013361	A	6	6	1650433	1650438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5127	NC_013361	TCA	2	6	1650469	1650474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_013361	A	7	7	1651007	1651013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_013361	CGG	2	6	1651026	1651031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_013361	AAT	2	6	1651059	1651064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_013361	GAG	2	6	1651196	1651201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_013361	CGC	2	6	1651218	1651223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_013361	ATC	2	6	1653135	1653140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_013361	GC	3	6	1653145	1653150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5136	NC_013361	GAT	2	6	1653151	1653156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_013361	A	6	6	1653269	1653274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_013361	TCAA	2	8	1653283	1653290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5139	NC_013361	CGT	2	6	1653299	1653304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_013361	TTC	2	6	1653313	1653318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_013361	T	6	6	1653401	1653406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_013361	CAC	2	6	1653407	1653412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5143	NC_013361	T	6	6	1653435	1653440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_013361	CAT	2	6	1653445	1653450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5145	NC_013361	AGA	2	6	1653512	1653517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_013361	TGA	2	6	1653578	1653583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_013361	AG	3	6	1654045	1654050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_013361	TATAA	2	10	1654539	1654548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_013361	CGG	2	6	1655044	1655049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_013361	GCC	2	6	1655775	1655780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5151	NC_013361	GCG	2	6	1655786	1655791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5152	NC_013361	TTA	2	6	1656414	1656419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5154	NC_013361	GA	3	6	1656494	1656499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_013361	AT	3	6	1657441	1657446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5156	NC_013361	TAA	2	6	1657479	1657484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_013361	CGGG	2	8	1657513	1657520	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5158	NC_013361	TTCTA	2	10	1657592	1657601	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5159	NC_013361	T	6	6	1657602	1657607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5160	NC_013361	CTG	2	6	1657630	1657635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5162	NC_013361	CTG	2	6	1657738	1657743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_013361	TA	3	6	1657761	1657766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_013361	ATT	2	6	1657789	1657794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_013361	A	6	6	1659496	1659501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_013361	ATTC	2	8	1660102	1660109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5167	NC_013361	CCA	2	6	1660116	1660121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5168	NC_013361	GCA	2	6	1660126	1660131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5169	NC_013361	GTT	2	6	1660197	1660202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5170	NC_013361	CTTAC	2	10	1661756	1661765	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5173	NC_013361	T	6	6	1661878	1661883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_013361	CTT	2	6	1661884	1661889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5175	NC_013361	ATG	2	6	1661923	1661928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5177	NC_013361	GTT	2	6	1662731	1662736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5178	NC_013361	TTG	2	6	1664283	1664288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5179	NC_013361	CT	3	6	1664295	1664300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5180	NC_013361	T	7	7	1664359	1664365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5181	NC_013361	TTA	2	6	1664378	1664383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5189	NC_013361	CATC	2	8	1667027	1667034	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5194	NC_013361	TTCAA	2	10	1667259	1667268	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5203	NC_013361	TGT	2	6	1671644	1671649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5204	NC_013361	AAC	3	9	1672143	1672151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5213	NC_013361	A	6	6	1674662	1674667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5217	NC_013361	AATG	2	8	1678009	1678016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5222	NC_013361	AAT	2	6	1683123	1683128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5230	NC_013361	GTT	2	6	1683449	1683454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5233	NC_013361	TGAAA	2	10	1683750	1683759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_013361	TA	4	8	1683781	1683788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_013361	ACA	2	6	1683828	1683833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5253	NC_013361	CT	3	6	1690754	1690759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5254	NC_013361	ATG	2	6	1690783	1690788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5256	NC_013361	CAT	2	6	1692095	1692100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_013361	T	7	7	1692105	1692111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_013361	T	6	6	1696141	1696146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_013361	T	6	6	1696184	1696189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_013361	A	6	6	1696206	1696211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_013361	GCC	2	6	1696398	1696403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5262	NC_013361	TTG	2	6	1696404	1696409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_013361	TGT	2	6	1696469	1696474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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