MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 297

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	CCA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013354	TTC	2	6	8317	8322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013354	AGG	2	6	13015	13020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013354	TAA	2	6	13879	13884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013354	GGC	2	6	14517	14522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013354	ATG	2	6	14612	14617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013354	ATG	2	6	14691	14696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013354	AGA	2	6	14958	14963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013354	GCT	2	6	14965	14970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013354	TGG	2	6	15026	15031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013354	TTG	2	6	15088	15093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013354	CAG	2	6	15094	15099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013354	GAT	2	6	15108	15113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013354	CTG	2	6	15212	15217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013354	TAT	2	6	16858	16863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013354	TCT	2	6	16961	16966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013354	ATT	2	6	16969	16974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013354	TAT	3	9	16988	16996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013354	ATT	2	6	17002	17007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013354	AAC	2	6	17060	17065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013354	AGC	2	6	17119	17124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013354	ACA	2	6	17170	17175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013354	TTA	2	6	17297	17302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013354	CGG	2	6	17351	17356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013354	AGG	2	6	17395	17400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013354	TCG	2	6	17411	17416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013354	AGA	2	6	17444	17449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013354	TGT	2	6	17501	17506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013354	GCG	2	6	17583	17588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013354	TCT	2	6	17682	17687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013354	TGT	2	6	17842	17847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013354	AAT	2	6	17879	17884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013354	TGT	2	6	17916	17921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013354	CGG	2	6	19895	19900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013354	AGG	2	6	21738	21743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013354	GTG	2	6	22920	22925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013354	CCA	2	6	22927	22932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013354	AGT	2	6	22937	22942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013354	TCC	2	6	23009	23014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013354	CAG	2	6	23025	23030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013354	TGC	2	6	23036	23041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013354	TGT	2	6	23104	23109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013354	ACA	2	6	23120	23125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013354	GCT	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013354	CTT	2	6	23152	23157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013354	ATA	2	6	24552	24557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013354	TCT	2	6	24581	24586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013354	TAT	2	6	24622	24627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013354	TCC	2	6	29061	29066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013354	CCT	2	6	29081	29086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013354	AAG	2	6	32687	32692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013354	AAC	2	6	32739	32744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013354	ATA	3	9	32752	32760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013354	GAT	2	6	32814	32819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013354	TTA	2	6	32873	32878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013354	CAG	2	6	34316	34321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013354	GGC	2	6	34369	34374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013354	CAA	2	6	34510	34515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013354	TGA	2	6	34533	34538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013354	ATG	2	6	34625	34630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013354	GGC	2	6	34634	34639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013354	GTG	2	6	34685	34690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013354	ACC	2	6	34823	34828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_013354	CTG	2	6	34922	34927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013354	CAG	2	6	34949	34954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013354	TGG	2	6	34965	34970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013354	ACA	2	6	35013	35018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013354	ATG	2	6	35022	35027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013354	GCG	2	6	35042	35047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013354	CAG	2	6	35069	35074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013354	GCT	2	6	35080	35085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013354	CAG	2	6	35117	35122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013354	AAC	2	6	35153	35158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013354	GGT	2	6	35206	35211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013354	GCC	2	6	35242	35247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013354	CTG	2	6	35386	35391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013354	ATT	2	6	35416	35421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013354	GAC	2	6	35493	35498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013354	TGG	2	6	35516	35521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013354	GAT	2	6	35532	35537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013354	GGA	2	6	35711	35716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013354	AAT	3	9	35790	35798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013354	ATT	2	6	35878	35883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013354	CAG	2	6	35889	35894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013354	TGG	2	6	35900	35905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013354	TGT	2	6	35923	35928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013354	ATC	2	6	35991	35996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013354	AGG	2	6	36025	36030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013354	CCA	2	6	36085	36090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013354	GGC	2	6	36215	36220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013354	CAA	2	6	36227	36232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013354	TGT	2	6	36295	36300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013354	GGT	2	6	36353	36358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013354	ATG	2	6	36426	36431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013354	GAT	2	6	36449	36454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013354	CAC	2	6	36617	36622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013354	GAT	2	6	36635	36640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013354	GCG	2	6	36756	36761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013354	CAG	3	9	36821	36829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013354	GGT	2	6	36897	36902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013354	ATG	2	6	36933	36938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013354	ATA	2	6	36982	36987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013354	AAG	2	6	37022	37027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013354	GGT	3	9	37122	37130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013354	TGA	2	6	37151	37156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013354	CAG	2	6	37172	37177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013354	AAT	2	6	37299	37304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013354	ACG	2	6	37371	37376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013354	TGA	2	6	37477	37482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013354	CGC	2	6	37489	37494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013354	ATT	2	6	37677	37682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013354	ATC	2	6	37687	37692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013354	ATT	2	6	37707	37712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013354	ATG	2	6	37744	37749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013354	ATA	2	6	37765	37770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013354	AGC	2	6	37809	37814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013354	GAA	2	6	37824	37829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013354	AAT	2	6	37893	37898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013354	GAA	2	6	37908	37913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013354	TGA	2	6	37960	37965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013354	AAT	2	6	37999	38004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013354	GAT	2	6	38017	38022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013354	CCT	2	6	39312	39317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013354	TTA	2	6	39476	39481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013354	TCA	2	6	39488	39493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013354	TAA	2	6	39495	39500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013354	ATC	2	6	39530	39535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013354	TGG	2	6	41029	41034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013354	GCT	2	6	41122	41127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013354	AGC	2	6	41165	41170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013354	CTT	2	6	41226	41231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013354	TGT	2	6	41232	41237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013354	ACA	2	6	41265	41270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013354	GGT	2	6	41290	41295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013354	CGT	2	6	41455	41460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013354	TGG	2	6	41493	41498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013354	GCC	2	6	41585	41590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013354	ATA	2	6	41631	41636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013354	GCG	2	6	41714	41719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013354	TGG	2	6	41760	41765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013354	CGG	2	6	41820	41825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013354	TGG	2	6	41832	41837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013354	TCG	2	6	42002	42007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013354	CTG	2	6	42074	42079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013354	CGT	2	6	42101	42106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_013354	ATT	2	6	51974	51979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013354	ATT	2	6	51998	52003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_013354	TGG	2	6	72605	72610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_013354	CAC	2	6	72627	72632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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297	NC_013354	TAT	2	6	75499	75504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.