MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 plasmid pO157

Total Repeats: 244

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013010	CTT	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013010	AAG	2	6	9368	9373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013010	AACA	2	8	11302	11309	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013010	GGA	2	6	11343	11348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013010	AGG	2	6	13051	13056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013010	TAA	2	6	13915	13920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013010	TGT	2	6	13945	13950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013010	A	6	6	13981	13986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013010	GTG	2	6	14471	14476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013010	ATG	2	6	14486	14491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013010	AAC	2	6	14548	14553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013010	GTAA	2	8	15769	15776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013010	AG	3	6	15830	15835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013010	A	6	6	15853	15858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013010	TAT	2	6	15882	15887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013010	TAA	2	6	16009	16014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013010	ATCA	2	8	16064	16071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013010	TATAA	2	10	16081	16090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013010	AT	3	6	16124	16129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013010	TAT	3	9	16127	16135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013010	TGT	2	6	16142	16147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013010	GA	3	6	16157	16162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013010	CTT	2	6	16195	16200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013010	TA	3	6	16229	16234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013010	TTAT	2	8	16261	16268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013010	AGG	2	6	19801	19806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013010	AGG	2	6	19820	19825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013010	TA	3	6	23405	23410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013010	AAT	2	6	23449	23454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013010	TA	3	6	24035	24040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013010	TAT	2	6	24067	24072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013010	G	6	6	24087	24092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013010	T	6	6	24116	24121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013010	CAAA	2	8	24390	24397	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013010	TA	3	6	25257	25262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013010	CAG	2	6	25272	25277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013010	ACATA	2	10	25283	25292	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013010	TA	3	6	25305	25310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013010	CACT	2	8	25455	25462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013010	ATA	2	6	25470	25475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013010	ACTT	2	8	26679	26686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013010	TCAT	2	8	26830	26837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013010	ATA	2	6	28775	28780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013010	GC	3	6	28793	28798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013010	AT	3	6	28818	28823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013010	AG	4	8	30425	30432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013010	GCTG	2	8	31585	31592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013010	ATT	2	6	31653	31658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013010	AGT	2	6	31690	31695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013010	ATG	2	6	31704	31709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013010	AAC	2	6	31814	31819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013010	ATG	2	6	31837	31842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013010	AGT	2	6	31865	31870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013010	CGC	2	6	31874	31879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_013010	TA	3	6	31937	31942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013010	AC	3	6	31951	31956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013010	A	6	6	31965	31970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013010	ATT	2	6	32014	32019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013010	T	7	7	32018	32024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013010	TCT	2	6	32037	32042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013010	T	6	6	32042	32047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013010	AGA	2	6	32111	32116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013010	T	6	6	32122	32127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013010	T	6	6	32155	32160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013010	A	6	6	32178	32183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013010	CA	3	6	33499	33504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013010	GGT	2	6	34306	34311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013010	TCA	2	6	34499	34504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013010	TGA	2	6	34506	34511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013010	TTA	2	6	34529	34534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013010	GT	3	6	34554	34559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013010	TCT	2	6	34594	34599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013010	TTC	2	6	34633	34638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013010	TCGC	2	8	34656	34663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013010	GCG	2	6	34683	34688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013010	ATA	2	6	34699	34704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013010	CTT	2	6	34724	34729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013010	AAC	2	6	34760	34765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013010	T	6	6	34773	34778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013010	TGT	2	6	34795	34800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013010	TAA	2	6	34825	34830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013010	A	7	7	34829	34835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013010	TC	3	6	37086	37091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013010	TCG	2	6	37114	37119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013010	TCG	2	6	37157	37162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013010	ATT	2	6	37168	37173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013010	GTC	2	6	37353	37358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013010	CTG	2	6	37401	37406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013010	TGC	2	6	37412	37417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013010	GT	3	6	37519	37524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013010	CCT	2	6	37537	37542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013010	TCG	2	6	37557	37562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013010	TCC	3	9	37564	37572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013010	GAG	2	6	37660	37665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013010	CGC	2	6	40345	40350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013010	GCGG	2	8	40353	40360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013010	ACGG	2	8	42007	42014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013010	GGC	2	6	42015	42020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013010	GCC	2	6	42024	42029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013010	ACTG	2	8	43209	43216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013010	T	6	6	43244	43249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013010	A	6	6	43264	43269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013010	GT	3	6	43292	43297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013010	ATTT	2	8	43441	43448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013010	GCC	2	6	43895	43900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013010	GGC	2	6	43909	43914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013010	C	6	6	45307	45312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_013010	GGA	2	6	45926	45931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013010	CG	3	6	45964	45969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013010	GCG	2	6	46610	46615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013010	GAT	2	6	46706	46711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013010	GACT	2	8	47201	47208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013010	GA	3	6	47244	47249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013010	ATT	2	6	47526	47531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013010	CCGCC	2	10	49525	49534	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
116	NC_013010	GCA	2	6	49547	49552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013010	ATG	2	6	50812	50817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013010	GGT	2	6	50855	50860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013010	TG	3	6	50873	50878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013010	ACA	2	6	50941	50946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013010	GAA	2	6	50981	50986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013010	GGCG	2	8	51159	51166	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013010	GCT	2	6	51227	51232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013010	AT	3	6	51318	51323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013010	GAG	2	6	53309	53314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013010	GAG	2	6	53396	53401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013010	AGA	2	6	53830	53835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013010	A	7	7	53898	53904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013010	TAAG	2	8	54165	54172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013010	AAGGT	2	10	54177	54186	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013010	AAT	2	6	54221	54226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013010	C	6	6	54244	54249	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_013010	AT	3	6	54285	54290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013010	TGG	2	6	54319	54324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013010	ACA	2	6	54342	54347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013010	CTTATC	2	12	54804	54815	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013010	TGT	2	6	54870	54875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013010	TAA	2	6	55360	55365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013010	CAC	2	6	55491	55496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_013010	TA	3	6	55511	55516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013010	ACA	2	6	55517	55522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013010	ATT	2	6	55556	55561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013010	CAG	2	6	65147	65152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013010	CAG	2	6	65967	65972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013010	TTA	2	6	68132	68137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013010	ACA	2	6	68142	68147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013010	CCTC	2	8	69693	69700	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_013010	AG	4	8	69701	69708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013010	ATT	2	6	69773	69778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013010	ATA	2	6	69786	69791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013010	A	6	6	70034	70039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013010	AAT	2	6	70074	70079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013010	T	7	7	70093	70099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013010	T	6	6	70147	70152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013010	TTA	2	6	70205	70210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013010	TCAT	2	8	70754	70761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_013010	TAAT	2	8	71003	71010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013010	A	6	6	71552	71557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013010	GTA	2	6	71560	71565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013010	GAG	2	6	71597	71602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013010	AGA	2	6	71889	71894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013010	TGGC	2	8	71930	71937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_013010	CAA	2	6	72066	72071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_013010	CCT	2	6	73029	73034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_013010	AAT	2	6	73038	73043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013010	CCG	2	6	73079	73084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_013010	A	6	6	73091	73096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013010	CAC	2	6	73101	73106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_013010	TCA	2	6	73122	73127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_013010	C	6	6	73150	73155	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
171	NC_013010	GCC	2	6	73262	73267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_013010	ACT	2	6	73320	73325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_013010	CATT	2	8	73332	73339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_013010	A	8	8	73341	73348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013010	CCTGT	2	10	73362	73371	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_013010	GACA	2	8	73373	73380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_013010	CAT	3	9	73580	73588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_013010	TCT	2	6	73598	73603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_013010	G	10	10	73756	73765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013010	ATCA	2	8	73779	73786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_013010	CGG	2	6	73808	73813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_013010	ATT	2	6	73870	73875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013010	CAA	2	6	73963	73968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_013010	TG	4	8	74497	74504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013010	ATT	2	6	74545	74550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_013010	CCG	2	6	74874	74879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_013010	TGC	2	6	75649	75654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_013010	TGA	2	6	78715	78720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013010	CCTC	2	8	78730	78737	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
193	NC_013010	AACA	2	8	80249	80256	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
194	NC_013010	GAT	2	6	80284	80289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_013010	TGCC	2	8	84311	84318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
197	NC_013010	GA	3	6	84333	84338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
198	NC_013010	T	6	6	84405	84410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_013010	TCA	2	6	84574	84579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.