MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli B str. REL606 chromosome

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012967	GAAAAT	2	12	10611	10622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012967	ACGCGT	2	12	78384	78395	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012967	AAGGGA	2	12	87135	87146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012967	TCTCCC	2	12	167395	167406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012967	TCACCC	2	12	167446	167457	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012967	GTAGTG	2	12	203222	203233	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012967	GCAGGG	2	12	242662	242673	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012967	TCCGCC	2	12	254020	254031	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012967	TGCGCC	2	12	254485	254496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012967	TGGAGA	2	12	254900	254911	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012967	TAAGGG	2	12	281894	281905	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012967	TGTGGA	2	12	283041	283052	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012967	TTTTCT	2	12	292756	292767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012967	CTATTT	2	12	293792	293803	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012967	TAAATT	2	12	316691	316702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012967	TTTATT	2	12	316800	316811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012967	AACAAT	2	12	374913	374924	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012967	TATTGA	2	12	378536	378547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012967	GTTGCC	2	12	399608	399619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012967	TTTTCA	2	12	444545	444556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012967	CAGGCG	2	12	463388	463399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012967	TTATAT	2	12	540575	540586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012967	GATTTT	2	12	544170	544181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012967	CGACAT	2	12	546559	546570	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012967	GAAACC	2	12	546920	546931	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012967	CAGCAA	2	12	567387	567398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012967	ACCGTC	2	12	567762	567773	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012967	TGCAAA	2	12	595361	595372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012967	ATCATT	2	12	659127	659138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012967	ATTTTT	2	12	690367	690378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012967	TTTTCT	2	12	775579	775590	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012967	AATATT	2	12	813384	813395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012967	CAGAAA	2	12	825615	825626	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012967	AGATAA	2	12	865550	865561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012967	CAGAAG	2	12	889001	889012	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012967	TAACCG	2	12	939591	939602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012967	AAATAA	2	12	971705	971716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012967	CTGGAA	2	12	981268	981279	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012967	AAAGAT	2	12	1004235	1004246	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012967	TGTCCA	2	12	1024867	1024878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012967	TAAGGA	2	12	1047135	1047146	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012967	ATAATG	2	12	1048549	1048560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012967	TGTTAA	2	12	1090367	1090378	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012967	CAAAAA	2	12	1135792	1135803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012967	AGCTGA	2	12	1193328	1193339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012967	TTTTGT	2	12	1219667	1219678	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012967	AGCGAT	2	12	1220068	1220079	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012967	CACAGG	2	12	1222019	1222030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012967	ACGCTT	2	12	1240276	1240287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012967	ACTCGA	2	12	1240296	1240307	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012967	CAGGCT	2	12	1240428	1240439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012967	CTTATT	2	12	1292219	1292230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012967	CAAAAG	2	12	1298114	1298125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012967	CGGGGG	2	12	1306333	1306344	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012967	CTGATC	2	12	1308592	1308603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012967	CTATAA	2	12	1355634	1355645	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012967	ATTTAA	2	12	1415674	1415685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012967	AAAAAC	2	12	1529699	1529710	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012967	ACCGTT	2	12	1544576	1544587	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012967	TGGTTA	2	12	1553406	1553417	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012967	CAAAAA	2	12	1596891	1596902	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012967	TAAATA	2	12	1598691	1598702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012967	TGACAG	2	12	1609228	1609239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012967	AAGGAA	2	12	1612455	1612466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012967	AAAAAC	2	12	1619513	1619524	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012967	AGTGCG	2	12	1619541	1619552	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012967	CTGTAA	2	12	1629090	1629101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012967	ATACTT	2	12	1718401	1718412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012967	AAAATA	2	12	1732057	1732068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012967	TGTTTT	2	12	1732690	1732701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012967	AAGACT	2	12	1732950	1732961	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012967	GAACAG	2	12	1780728	1780739	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012967	TATTAC	2	12	1849140	1849151	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012967	TTTCTT	2	12	1868504	1868515	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012967	ATAACC	2	12	1872448	1872459	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012967	ACTGTC	2	12	1916103	1916114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012967	TTAATG	2	12	1957512	1957523	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012967	AATTCA	2	12	1964637	1964648	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012967	ATTTTT	2	12	1995973	1995984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012967	CTGATA	2	12	2005063	2005074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012967	TCCCCC	2	12	2085780	2085791	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
82	NC_012967	TTATAT	2	12	2105130	2105141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012967	CGGAAC	2	12	2129934	2129945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012967	CACCAA	2	12	2142057	2142068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012967	TCTTCC	2	12	2215025	2215036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012967	CCACTA	2	12	2296334	2296345	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012967	TTACCC	2	12	2331115	2331126	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012967	TAAATG	2	12	2350492	2350503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012967	TGTCAC	2	12	2364127	2364138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012967	AGAAAA	2	12	2374407	2374418	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012967	TAAAAA	2	12	2407240	2407251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012967	GTTGAC	2	12	2408366	2408377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012967	CTGATG	2	12	2429229	2429240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012967	GTTATG	2	12	2447070	2447081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012967	CAAGTG	2	12	2460033	2460044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012967	TGCTGG	2	12	2524922	2524933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012967	GGGGCT	2	12	2525360	2525371	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012967	TCCTTC	2	12	2560107	2560118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012967	CCCGCC	2	12	2584970	2584981	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
100	NC_012967	TGGACA	2	12	2610257	2610268	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012967	AAGAGA	2	12	2617884	2617895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012967	CAGTTT	2	12	2625637	2625648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012967	ATCTTA	2	12	2751702	2751713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012967	TGGCTT	2	12	2792913	2792924	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012967	AGCCAC	2	12	2792991	2793002	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012967	GGTTTT	2	12	2806957	2806968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012967	ACAAGA	2	12	2811288	2811299	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012967	CTTTTA	2	12	2816917	2816928	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_012967	ACTTCA	2	12	2822091	2822102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012967	TTTGTT	2	12	2841914	2841925	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012967	ATCGCG	2	12	2926907	2926918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012967	GTAAGG	2	12	2942600	2942611	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012967	ACTGAG	2	12	2967589	2967600	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012967	GCACAG	2	12	2998836	2998847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012967	ACGCAG	2	12	3048344	3048355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012967	TTTTCG	2	12	3054990	3055001	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012967	CACCCC	2	12	3136056	3136067	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
118	NC_012967	AGTTGT	2	12	3143846	3143857	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012967	CTTTTT	2	12	3148523	3148534	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012967	AATGAT	2	12	3149358	3149369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012967	TAACAA	2	12	3186336	3186347	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_012967	GTAACC	2	12	3199096	3199107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012967	AGACAA	2	12	3200716	3200727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012967	TGCATT	2	12	3209862	3209873	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012967	TTTTAT	2	12	3211758	3211769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012967	ATATAA	2	12	3222526	3222537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012967	AATTTA	2	12	3475009	3475020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012967	AGATGC	2	12	3584029	3584040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_012967	ATACCG	2	12	3593259	3593270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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131	NC_012967	TTTGCC	2	12	3636522	3636533	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.