MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli B str. REL606 chromosome

Total Repeats: 511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012967	CGCGC	2	10	10773	10782	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_012967	TCTTT	2	10	11866	11875	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012967	TTAAT	2	10	24434	24443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012967	GATGC	2	10	29786	29795	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012967	ATTTA	2	10	33302	33311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012967	GATGC	2	10	38802	38811	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012967	GATGC	2	10	38892	38901	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012967	CCATG	2	10	42181	42190	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_012967	TTCAG	2	10	42363	42372	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012967	TAGTG	2	10	78418	78427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012967	ATTTT	2	10	80134	80143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012967	GGCAT	2	10	144799	144808	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012967	GTAAG	2	10	145563	145572	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012967	TCCTC	2	10	147283	147292	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_012967	ACCGC	2	10	152481	152490	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_012967	GCGGT	2	10	152500	152509	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012967	AAATT	2	10	159907	159916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012967	TTATC	2	10	170260	170269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012967	TACGT	2	10	185259	185268	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012967	TGGCC	2	10	186984	186993	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012967	AAATA	2	10	195590	195599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012967	GTCTG	2	10	195675	195684	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012967	CGGTT	2	10	226363	226372	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012967	CCTTT	2	10	252168	252177	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012967	AGGGC	2	10	253694	253703	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012967	AGGGA	2	10	254257	254266	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012967	CGATG	2	10	255072	255081	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012967	TGTTA	2	10	282968	282977	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012967	TTGAT	2	10	283857	283866	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012967	CAAAA	2	10	292780	292789	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012967	ATTAG	2	10	292813	292822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012967	TTCCC	2	10	297283	297292	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_012967	TTGCG	2	10	338973	338982	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012967	CTTCT	2	10	367002	367011	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_012967	AGTTC	2	10	399622	399631	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012967	GTTTC	2	10	400549	400558	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012967	CTTTT	2	10	404025	404034	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012967	GGAGT	2	10	406722	406731	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012967	TAGTG	2	10	415115	415124	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012967	GTTTT	2	10	425566	425575	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012967	GAAGA	2	10	433496	433505	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012967	TCAGG	2	10	440919	440928	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012967	TGAGT	2	10	447268	447277	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012967	CAGGT	2	10	448555	448564	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012967	TCAGG	2	10	476962	476971	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012967	ATTTT	2	10	495369	495378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012967	AAGCG	2	10	515332	515341	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012967	GTTTC	2	10	529925	529934	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012967	TGAGT	2	10	540147	540156	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012967	TTGGG	2	10	542671	542680	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012967	AAATA	2	10	542746	542755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012967	GACCA	2	10	547781	547790	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_012967	TTTAA	2	10	548524	548533	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012967	TTTTA	2	10	558738	558747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012967	CACGC	2	10	566896	566905	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_012967	ACGCG	2	10	567122	567131	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_012967	CGGCG	2	10	567791	567800	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_012967	CCGTA	2	10	573517	573526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_012967	AGAGG	2	10	589360	589369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012967	GTCAG	2	10	592080	592089	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012967	GCAGT	2	10	595306	595315	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012967	GTTAA	2	10	612484	612493	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012967	CGGTG	2	10	612982	612991	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012967	AAACG	2	10	625483	625492	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012967	TGCTA	2	10	639099	639108	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012967	ATTTG	2	10	640535	640544	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012967	TCAAT	2	10	642840	642849	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012967	CGTAA	2	10	645237	645246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012967	GCATA	2	10	657432	657441	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012967	AGCAA	2	10	657539	657548	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012967	ATATT	2	10	659161	659170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012967	ACCAT	2	10	666452	666461	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012967	CAGGG	2	10	684889	684898	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012967	ATAAA	2	10	690117	690126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012967	TCGCG	2	10	690304	690313	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_012967	GGCCG	2	10	698865	698874	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_012967	AATGT	2	10	716085	716094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012967	TTAAT	2	10	717066	717075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012967	TAGTG	2	10	717467	717476	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012967	AGCGC	2	10	739301	739310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_012967	ATACA	2	10	746824	746833	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012967	TATAA	2	10	751736	751745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012967	GTCGT	2	10	761307	761316	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012967	GATGC	2	10	786437	786446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012967	AAAAT	2	10	787940	787949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012967	TCCAT	2	10	789393	789402	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_012967	AAAAC	2	10	789439	789448	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012967	TGTTA	2	10	796339	796348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012967	ACATA	2	10	828952	828961	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_012967	GATGC	2	10	834218	834227	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012967	CAAAA	2	10	840961	840970	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_012967	TATAT	2	10	845694	845703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012967	TGATG	2	10	851703	851712	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012967	ATTTT	2	10	865570	865579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012967	CAGGG	2	10	870619	870628	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012967	GTTGG	2	10	880590	880599	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012967	AGTAA	2	10	906635	906644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012967	TCGCT	2	10	942610	942619	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_012967	TCGCT	2	10	942788	942797	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_012967	GCAAC	2	10	974722	974731	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_012967	TTCAC	2	10	988692	988701	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_012967	AGCGA	2	10	1022988	1022997	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012967	TAGGG	2	10	1023024	1023033	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012967	ATGAC	2	10	1024728	1024737	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012967	TATTT	2	10	1024791	1024800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012967	TTTTC	2	10	1032766	1032775	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012967	TTATT	2	10	1033576	1033585	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012967	TTCTT	2	10	1035509	1035518	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012967	GTACA	2	10	1038045	1038054	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012967	TTATG	2	10	1038202	1038211	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012967	CTTAT	2	10	1048705	1048714	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012967	GCATC	2	10	1057656	1057665	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_012967	TAAAA	2	10	1067550	1067559	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012967	TCGCT	2	10	1111792	1111801	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_012967	TCGCT	2	10	1111973	1111982	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_012967	GATCG	2	10	1123841	1123850	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012967	GTCAT	2	10	1135259	1135268	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012967	TGCAG	2	10	1143962	1143971	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012967	GTCGC	2	10	1159024	1159033	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_012967	GATGC	2	10	1180360	1180369	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012967	GGGGA	2	10	1205898	1205907	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012967	CATGA	2	10	1212506	1212515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012967	AGTCG	2	10	1220184	1220193	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_012967	ATTTT	2	10	1223464	1223473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012967	CTGGT	2	10	1223668	1223677	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012967	TTTTG	2	10	1224270	1224279	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012967	TATAA	2	10	1227671	1227680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012967	ACACC	2	10	1230279	1230288	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_012967	TTCTA	2	10	1230714	1230723	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012967	CTTAC	2	10	1234878	1234887	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_012967	TTCAA	2	10	1240380	1240389	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012967	GAAAA	2	10	1251082	1251091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012967	TGAAA	2	10	1256781	1256790	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012967	CTTCA	2	10	1269633	1269642	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_012967	CTTCA	2	10	1270168	1270177	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_012967	CTTCA	2	10	1270703	1270712	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_012967	TATCT	2	10	1270854	1270863	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012967	TTATC	2	10	1278022	1278031	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012967	TATGT	2	10	1279834	1279843	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012967	TCGCT	2	10	1287181	1287190	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_012967	TCGAA	2	10	1287238	1287247	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_012967	ACCGT	2	10	1288452	1288461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_012967	CAAAT	2	10	1297144	1297153	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_012967	ATTGA	2	10	1298378	1298387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012967	CGTTG	2	10	1313641	1313650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_012967	GCCAG	2	10	1325076	1325085	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_012967	GAAAC	2	10	1333723	1333732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_012967	GGCGC	2	10	1356121	1356130	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_012967	CGATC	2	10	1406546	1406555	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_012967	ATTTT	2	10	1428750	1428759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012967	CATTG	2	10	1428769	1428778	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_012967	ACGTA	2	10	1460140	1460149	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_012967	AAACG	2	10	1493238	1493247	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_012967	TGGTT	2	10	1665592	1665601	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_012967	GACCA	2	10	4338813	4338822	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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475	NC_012967	GCAAA	2	10	4402628	4402637	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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478	NC_012967	GGAAC	2	10	4431790	4431799	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
479	NC_012967	GTAAA	2	10	4443055	4443064	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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