MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium eligens ATCC 27750 plasmid unnamed

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012780	TTTA	2	8	3426	3433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012780	TTTA	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012780	GGCA	2	8	3728	3735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012780	TAAA	2	8	3741	3748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012780	CGAT	2	8	6249	6256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012780	TTTC	2	8	6356	6363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012780	ATCC	2	8	7048	7055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012780	CATT	2	8	7112	7119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012780	CAAT	2	8	7173	7180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012780	ATTT	2	8	7243	7250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012780	AATT	2	8	7758	7765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012780	AGCA	2	8	11182	11189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012780	TATG	2	8	11206	11213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012780	AATC	2	8	11700	11707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012780	AATC	2	8	19221	19228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012780	AAAT	2	8	19231	19238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012780	ATCT	2	8	20538	20545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012780	TCAA	2	8	21758	21765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012780	AAAT	2	8	21877	21884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012780	TCAA	2	8	21887	21894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012780	CTAG	2	8	24767	24774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012780	AAAT	2	8	25193	25200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012780	TAAA	2	8	27003	27010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012780	CATT	2	8	27592	27599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012780	CATT	2	8	27693	27700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012780	ATTT	2	8	30084	30091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012780	CTGT	2	8	33026	33033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012780	ACTG	2	8	33173	33180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012780	GAAT	2	8	33470	33477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012780	ACTA	2	8	33950	33957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012780	TTAA	2	8	33995	34002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012780	ATGA	2	8	38820	38827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012780	TCAA	2	8	53461	53468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012780	TTGA	2	8	58565	58572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012780	CCAG	2	8	63860	63867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012780	TATT	2	8	65587	65594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012780	ATTT	2	8	74164	74171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012780	TTTA	2	8	74375	74382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012780	AGAT	2	8	76902	76909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012780	AAAC	2	8	77173	77180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012780	GGTG	2	8	77384	77391	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012780	ACCG	2	8	77402	77409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012780	CTGT	2	8	78104	78111	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012780	ATTT	2	8	81699	81706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012780	TAAT	2	8	82988	82995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012780	CCTT	2	8	86491	86498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012780	TTCC	2	8	88296	88303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012780	AGCC	2	8	88951	88958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012780	ATTC	2	8	88959	88966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012780	CTCC	2	8	93452	93459	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_012780	ACGA	2	8	93587	93594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012780	AATG	2	8	93601	93608	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012780	ATTT	2	8	93633	93640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012780	CAGG	2	8	94313	94320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012780	GAAA	2	8	108542	108549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012780	TTTC	2	8	115169	115176	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012780	TTTA	2	8	115747	115754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012780	CCTG	2	8	116556	116563	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_012780	TATT	2	8	120726	120733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012780	CTTC	2	8	120936	120943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012780	ATAC	2	8	121183	121190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012780	TAGT	2	8	123048	123055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012780	GTTT	2	8	127426	127433	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012780	TACA	2	8	127720	127727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012780	TTTC	2	8	129973	129980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_012780	TATT	2	8	136134	136141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012780	ACTC	2	8	146754	146761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012780	CAAA	2	8	160039	160046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012780	CTTC	2	8	164168	164175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012780	ATTT	2	8	168962	168969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012780	ACGG	2	8	179570	179577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012780	TTCA	2	8	181736	181743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_012780	ATTT	2	8	181767	181774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012780	TAAT	2	8	189918	189925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012780	AATT	2	8	192917	192924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012780	CAGT	2	8	193000	193007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_012780	TAAT	2	8	193203	193210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012780	AATA	2	8	195013	195020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012780	AATA	2	8	195074	195081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012780	TATT	2	8	196300	196307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012780	AATA	2	8	200298	200305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012780	AATA	2	8	203389	203396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012780	AATA	2	8	203590	203597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012780	ACCT	2	8	204253	204260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012780	TTAA	2	8	208116	208123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012780	CCTT	2	8	208954	208961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012780	AATC	2	8	214910	214917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012780	TAAA	2	8	220652	220659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012780	CCTT	2	8	221422	221429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012780	CTTT	2	8	227964	227971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012780	AAAT	2	8	232903	232910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012780	CCTT	2	8	235417	235424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012780	CTTT	2	8	237185	237192	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012780	CTTT	2	8	238771	238778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012780	TCAC	2	8	239978	239985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012780	CATA	2	8	249552	249559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012780	AAAT	2	8	249650	249657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012780	AATA	2	8	251790	251797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012780	ATTT	2	8	251886	251893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012780	TACA	2	8	252970	252977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012780	AATC	2	8	253117	253124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012780	TAAT	2	8	253134	253141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012780	TGCC	2	8	253926	253933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012780	TATT	2	8	257321	257328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012780	ACTG	2	8	258283	258290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012780	TTAT	2	8	272248	272255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012780	GTCC	2	8	272383	272390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012780	ATTG	2	8	272636	272643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012780	TGGG	2	8	276481	276488	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012780	TGGG	2	8	278441	278448	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012780	CGTC	2	8	278642	278649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012780	AATT	2	8	279408	279415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012780	CCTG	2	8	284205	284212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012780	ATTC	2	8	285793	285800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012780	TCAA	2	8	285853	285860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012780	TTTG	2	8	290084	290091	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012780	TATT	2	8	290234	290241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012780	AAAT	2	8	294921	294928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012780	TTTG	2	8	296697	296704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012780	ATTT	2	8	309168	309175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012780	TTAA	2	8	319834	319841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012780	TAAA	2	8	319890	319897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012780	CTAT	2	8	326055	326062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012780	AAAT	2	8	326303	326310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012780	TAAT	2	8	326323	326330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012780	TTAA	2	8	327693	327700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012780	TTCA	2	8	331527	331534	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012780	AATT	2	8	332779	332786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012780	GCGG	2	8	332848	332855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012780	ATTA	2	8	340426	340433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012780	CATA	2	8	340609	340616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012780	ATTC	2	8	342212	342219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012780	ATAA	2	8	344260	344267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012780	ACAA	2	8	345104	345111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012780	CTTT	2	8	345133	345140	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_012780	AAAT	2	8	348334	348341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012780	ATTA	2	8	353186	353193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012780	ATTC	2	8	354362	354369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012780	CAAT	2	8	354371	354378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_012780	ATAA	2	8	354380	354387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012780	TTTA	2	8	373243	373250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012780	ATTT	2	8	378094	378101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012780	ATTG	2	8	384110	384117	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012780	TTCT	2	8	385372	385379	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012780	ACTT	2	8	404052	404059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012780	TTCG	2	8	404136	404143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012780	ATTA	2	8	406917	406924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012780	ATAA	2	8	406928	406935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012780	GGCT	2	8	415664	415671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012780	GGCA	2	8	415965	415972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012780	CAGC	2	8	416324	416331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012780	TGTA	2	8	421248	421255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012780	TTAT	2	8	427046	427053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012780	CAAT	2	8	428665	428672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_012780	ACAG	2	8	429333	429340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_012780	GATT	2	8	432154	432161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012780	AATT	2	8	437037	437044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012780	TTAT	2	8	438957	438964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012780	TTAA	2	8	439286	439293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012780	ATCA	2	8	442395	442402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_012780	TTGT	2	8	456222	456229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012780	TTCT	2	8	457421	457428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_012780	TAAA	2	8	459084	459091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012780	TTAT	2	8	459339	459346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012780	CTTT	2	8	459904	459911	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_012780	AAAT	2	8	460128	460135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012780	TAAA	2	8	474623	474630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012780	TACA	2	8	475449	475456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_012780	CATT	2	8	479331	479338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_012780	ATCA	2	8	480327	480334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_012780	ATAC	2	8	488934	488941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_012780	AGAT	2	8	509032	509039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012780	CATG	2	8	509108	509115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_012780	AATT	2	8	546741	546748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012780	ATTA	2	8	546773	546780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012780	AATT	2	8	550147	550154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012780	TCCC	2	8	558576	558583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
178	NC_012780	ATTT	2	8	561467	561474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_012780	ATTA	2	8	561487	561494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012780	TCAG	2	8	565137	565144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
181	NC_012780	GTTA	2	8	574748	574755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012780	ATAA	2	8	576463	576470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012780	AATA	2	8	579840	579847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012780	TCAA	2	8	580664	580671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_012780	AAAT	2	8	580855	580862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012780	TTTC	2	8	580903	580910	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_012780	GAAA	2	8	580933	580940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012780	AATT	2	8	587327	587334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_012780	TCAT	2	8	587408	587415	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
190	NC_012780	ATTC	2	8	587426	587433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
191	NC_012780	TTAA	2	8	593290	593297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_012780	TCCC	2	8	595025	595032	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
193	NC_012780	CAAT	2	8	604197	604204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
194	NC_012780	ATTT	2	8	612216	612223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_012780	TCTA	2	8	612224	612231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
196	NC_012780	TATC	2	8	612288	612295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
197	NC_012780	ATTT	2	8	617233	617240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_012780	GTTT	2	8	619251	619258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
199	NC_012780	AAAT	2	8	622873	622880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.