MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Exiguobacterium sp. AT1b chromosome

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012673	CCATTT	2	12	118015	118026	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012673	TTCTAT	2	12	141089	141100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012673	GTTTAC	2	12	246677	246688	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012673	TTCTTA	2	12	254423	254434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012673	TTTTCA	2	12	329463	329474	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012673	GTTAAC	2	12	334846	334857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012673	GAAATG	2	12	363718	363729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012673	GAAAAA	2	12	489687	489698	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012673	AAAACG	2	12	489705	489716	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012673	TGCTTT	2	12	504295	504306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012673	TTTAAC	2	12	560869	560880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012673	ACAAAA	2	12	617013	617024	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012673	AAATTG	2	12	667814	667825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012673	TGTATA	2	12	678944	678955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012673	TAATCG	2	12	696790	696801	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012673	AGCAAA	2	12	708730	708741	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012673	TTTTTG	2	12	793223	793234	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012673	AAGCAA	2	12	802764	802775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012673	GCGTTT	2	12	803126	803137	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012673	TATACA	2	12	864533	864544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012673	AATAAA	2	12	869101	869112	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012673	TGAAAA	2	12	889073	889084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012673	CCGTTC	2	12	900550	900561	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012673	TTCGTT	2	12	903396	903407	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012673	GAATTC	2	12	924803	924814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012673	ATTGAA	2	12	983210	983221	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012673	CCTTAT	2	12	1062490	1062501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012673	AATTTC	2	12	1079391	1079402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012673	ATCTCC	2	12	1110092	1110103	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012673	CTTTTT	2	12	1147394	1147405	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012673	AGCCGC	2	12	1190725	1190736	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012673	CTATTT	2	12	1197595	1197606	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012673	ATTTTT	2	12	1231222	1231233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012673	GATTTT	2	12	1379796	1379807	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012673	ATGAAT	2	12	1430995	1431006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012673	TTTTCA	2	12	1511756	1511767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012673	GGTAAA	2	12	1515349	1515360	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012673	ATACAC	2	12	1700539	1700550	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012673	AGAATG	2	12	1700927	1700938	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012673	ATTATC	2	12	1729556	1729567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012673	CGTCAA	2	12	1766555	1766566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012673	ATAGAG	2	12	1767786	1767797	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012673	ATTATG	2	12	1780384	1780395	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012673	TGGAGG	2	12	1840643	1840654	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012673	ATCATT	2	12	1848370	1848381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012673	ATCGAT	2	12	1919615	1919626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012673	TTCGTT	2	12	1933521	1933532	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012673	AAAGGG	2	12	1960328	1960339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012673	TAAAAA	2	12	1986311	1986322	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012673	TCTTTC	2	12	2047407	2047418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012673	AAATTT	2	12	2056751	2056762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012673	AATGAT	2	12	2059610	2059621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012673	AGATAT	2	12	2097370	2097381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012673	AGATAA	2	12	2133506	2133517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012673	GGGAAA	2	12	2149682	2149693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012673	GGAGTA	2	12	2261451	2261462	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012673	CTTATA	2	12	2261751	2261762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012673	TCTTTT	2	12	2355332	2355343	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012673	GGGGTA	2	12	2425616	2425627	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012673	CACATT	2	12	2443008	2443019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012673	GCGGCC	2	12	2462292	2462303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012673	AATCGA	2	12	2472271	2472282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012673	TTCGCG	2	12	2495127	2495138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012673	GGAGGG	2	12	2495419	2495430	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012673	GAATAC	2	12	2502765	2502776	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012673	ATTTAA	2	12	2569511	2569522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012673	TCTATC	2	12	2570345	2570356	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012673	CATTTC	2	12	2574802	2574813	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012673	TTTTTG	2	12	2607027	2607038	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012673	TAAAAA	2	12	2715160	2715171	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.