MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli IAI39 chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011750	GAAAAT	2	12	10498	10509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011750	AAGGGA	2	12	94555	94566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011750	ATTGTT	2	12	157762	157773	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011750	GTAGTG	2	12	210633	210644	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011750	CGCCTG	2	12	235425	235436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011750	CGGCTT	2	12	244192	244203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011750	CTTTGA	2	12	244390	244401	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011750	TGAAAA	2	12	255579	255590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011750	TAAAAA	2	12	332276	332287	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011750	CGATTT	2	12	389904	389915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011750	ACCTCA	2	12	405668	405679	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011750	CAGACA	2	12	405861	405872	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011750	GAAATA	2	12	416341	416352	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011750	AAGAAA	2	12	417378	417389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011750	TTCACC	2	12	423262	423273	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011750	TGTCAG	2	12	424458	424469	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011750	CACCAA	2	12	425678	425689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011750	TAAGCG	2	12	459035	459046	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011750	TCAGGT	2	12	492182	492193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011750	TAAAAT	2	12	535574	535585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011750	ATTTAT	2	12	536114	536125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011750	AATATG	2	12	562757	562768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011750	ACCGTC	2	12	572223	572234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011750	TGCAAA	2	12	592425	592436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011750	CAAATT	2	12	665336	665347	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011750	ATTTTT	2	12	677420	677431	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011750	AATCAG	2	12	741743	741754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011750	TTTTCT	2	12	773798	773809	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011750	TTGTGT	2	12	784770	784781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011750	CAGAAA	2	12	817867	817878	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011750	AGGGGG	2	12	1002062	1002073	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011750	ACAAAA	2	12	1032038	1032049	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011750	GTTTTC	2	12	1092804	1092815	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011750	TCAGGT	2	12	1097127	1097138	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011750	TGTCTG	2	12	1130005	1130016	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011750	ATAAGA	2	12	1206417	1206428	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011750	TGAATT	2	12	1220224	1220235	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011750	CAACTG	2	12	1228662	1228673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011750	GACAGT	2	12	1266209	1266220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011750	AAAGAA	2	12	1313802	1313813	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011750	GTAATA	2	12	1332036	1332047	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011750	CTTTTT	2	12	1442630	1442641	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011750	AGTCTT	2	12	1451551	1451562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011750	AAAACA	2	12	1451811	1451822	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011750	TTATTT	2	12	1452443	1452454	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011750	TAAGTA	2	12	1466102	1466113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011750	CAGGCT	2	12	1589055	1589066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011750	CTTATT	2	12	1642615	1642626	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011750	CAAAAG	2	12	1649948	1649959	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011750	CTGATC	2	12	1660426	1660437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011750	AAAGTT	2	12	1664675	1664686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011750	CTATAA	2	12	1718994	1719005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011750	AAAAAC	2	12	1832903	1832914	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011750	CCAGCG	2	12	1841785	1841796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011750	ACCGTT	2	12	1847778	1847789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011750	TGGTTA	2	12	1856610	1856621	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011750	TGCCTG	2	12	1870710	1870721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011750	GATATA	2	12	1870804	1870815	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011750	TCTGGC	2	12	1870894	1870905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011750	CAAAAA	2	12	1926484	1926495	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011750	TTAAAT	2	12	1928283	1928294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011750	AAGCGT	2	12	1960666	1960677	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011750	ACAAAA	2	12	1983194	1983205	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011750	TCATTT	2	12	1994453	1994464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011750	GCATGC	2	12	2005858	2005869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011750	CTTTAT	2	12	2063196	2063207	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011750	TTTTTG	2	12	2146238	2146249	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011750	AAATAA	2	12	2148327	2148338	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011750	CATTAT	2	12	2223038	2223049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011750	ATCTTT	2	12	2267219	2267230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011750	CGGTTA	2	12	2334523	2334534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011750	CCAGCG	2	12	2359245	2359256	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011750	GCTGAT	2	12	2359531	2359542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011750	CGCGAT	2	12	2360438	2360449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011750	GCGCCA	2	12	2371520	2371531	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011750	TCTTCC	2	12	2377992	2378003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011750	CGCAGG	2	12	2442513	2442524	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011750	TTTAGT	2	12	2442870	2442881	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011750	CCATGC	2	12	2443083	2443094	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011750	CAGCGT	2	12	2443575	2443586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011750	GCAGTT	2	12	2445080	2445091	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_011750	TAAATG	2	12	2524186	2524197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011750	TGTCAC	2	12	2537820	2537831	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011750	AGCGGA	2	12	2543941	2543952	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011750	AGAAAA	2	12	2551084	2551095	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011750	TACTCA	2	12	2624304	2624315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011750	TCACGC	2	12	2625689	2625700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011750	ACGCCG	2	12	2625827	2625838	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011750	CGCTGT	2	12	2625933	2625944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011750	GGTGCC	2	12	2626039	2626050	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011750	TTCTGC	2	12	2641569	2641580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011750	CAAGTG	2	12	2656262	2656273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011750	GTCAGC	2	12	2681226	2681237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011750	AACCGG	2	12	2729799	2729810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011750	AATGAT	2	12	2745387	2745398	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011750	CTGGCG	2	12	2747407	2747418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011750	ATAACC	2	12	2751306	2751317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011750	GGTGGC	2	12	2758974	2758985	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011750	AAAAAC	2	12	2793083	2793094	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011750	TCCTTC	2	12	2813135	2813146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011750	TGAGCG	2	12	2854049	2854060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011750	TGGACA	2	12	2864057	2864068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011750	CAGTTT	2	12	2878665	2878676	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011750	ATTTTT	2	12	2949772	2949783	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011750	TTTTAT	2	12	3212793	3212804	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011750	ACTCCC	2	12	3231135	3231146	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011750	CTTACG	2	12	3258562	3258573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011750	TATTTA	2	12	3276187	3276198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011750	AGTCAT	2	12	3311694	3311705	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011750	GTCAGG	2	12	3332237	3332248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011750	GCTGGA	2	12	3342695	3342706	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011750	GGGCTG	2	12	3345095	3345106	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011750	ACAAGA	2	12	3350950	3350961	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011750	TTTGTT	2	12	3375935	3375946	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011750	ATCGCG	2	12	3468258	3468269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011750	GTAAGG	2	12	3482932	3482943	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011750	ACTGAG	2	12	3511862	3511873	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_011750	TTTTGT	2	12	3549910	3549921	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011750	TTAACA	2	12	3551893	3551904	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011750	ACTGTC	2	12	3552094	3552105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011750	ATAAAA	2	12	3552981	3552992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011750	TATTGT	2	12	3564181	3564192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011750	ATCTTG	2	12	3578276	3578287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011750	TTTTCG	2	12	3625708	3625719	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.