MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli IAI39 chromosome

Total Repeats: 581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011750	GAATT	2	10	15812	15821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011750	AATGT	2	10	18341	18350	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011750	TTCTT	2	10	18402	18411	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011750	CTCAT	2	10	19810	19819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011750	TTAAT	2	10	28572	28581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011750	GATGC	2	10	42904	42913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011750	GTTCA	2	10	68401	68410	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011750	TAGTG	2	10	86051	86060	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011750	ATTTT	2	10	88776	88785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011750	GGGAG	2	10	88940	88949	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011750	CGCCA	2	10	89004	89013	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_011750	GGCAT	2	10	151827	151836	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011750	GTAAG	2	10	152591	152600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011750	TCCTC	2	10	154311	154320	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_011750	TGTGG	2	10	161945	161954	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011750	AAATT	2	10	168540	168549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011750	TTATC	2	10	178801	178810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011750	TACGT	2	10	193683	193692	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011750	TGGCC	2	10	195373	195382	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011750	TGAAC	2	10	223908	223917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011750	GAAAA	2	10	229681	229690	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011750	AAAGA	2	10	244154	244163	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011750	TGCGG	2	10	246564	246573	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011750	GACCT	2	10	251570	251579	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011750	ACTCA	2	10	252858	252867	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011750	ACAAA	2	10	273208	273217	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011750	CACTA	2	10	283649	283658	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011750	ACTCC	2	10	292042	292051	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_011750	GAAAC	2	10	299837	299846	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011750	TTTTA	2	10	348868	348877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011750	TTGTT	2	10	363489	363498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011750	GTTCA	2	10	375744	375753	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011750	CAGTT	2	10	383236	383245	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011750	AAGCG	2	10	387753	387762	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011750	CCCGG	2	10	389483	389492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_011750	ATTTT	2	10	412278	412287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011750	GGGAA	2	10	412852	412861	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011750	TTTTG	2	10	417357	417366	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011750	TGATC	2	10	424766	424775	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011750	CACGC	2	10	426208	426217	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_011750	ATCAA	2	10	433261	433270	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011750	GTTAT	2	10	434142	434151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011750	CTGAG	2	10	453555	453564	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011750	AAAGG	2	10	459595	459604	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011750	TTAAT	2	10	477551	477560	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011750	TCGGT	2	10	479779	479788	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011750	TAAGG	2	10	480949	480958	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011750	AACCG	2	10	482734	482743	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_011750	CAACA	2	10	485303	485312	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011750	AGAGT	2	10	489780	489789	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011750	GTTCA	2	10	497397	497406	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011750	GATGC	2	10	517790	517799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011750	GATGC	2	10	517890	517899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011750	GTTTC	2	10	525590	525599	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011750	TGCAT	2	10	535420	535429	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011750	AATAA	2	10	535686	535695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011750	GAATG	2	10	537736	537745	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011750	CTTCA	2	10	542767	542776	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011750	TTGAT	2	10	562636	562645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011750	CACGC	2	10	571357	571366	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_011750	ACGCG	2	10	571583	571592	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011750	CGGCG	2	10	572252	572261	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011750	GTCAG	2	10	587710	587719	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011750	GTTCA	3	15	589959	589973	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011750	GCAGT	2	10	592370	592379	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011750	ATTTA	2	10	597866	597875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011750	GTTAA	2	10	609361	609370	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011750	ATAGC	2	10	617245	617254	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011750	TGCTA	2	10	634573	634582	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011750	ATTTG	2	10	636014	636023	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011750	TCAAT	2	10	638319	638328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011750	GGAAC	2	10	639508	639517	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011750	CGTAA	2	10	640716	640725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011750	GCATA	2	10	652911	652920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011750	AGCAA	2	10	653018	653027	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011750	GTGTT	2	10	657966	657975	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011750	ACAGG	2	10	666389	666398	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011750	CAGGG	2	10	672079	672088	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011750	TCGCG	2	10	677357	677366	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011750	AATTA	2	10	728814	728823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011750	ATAAC	2	10	750285	750294	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011750	CTAAT	2	10	750375	750384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011750	GTCGT	2	10	759842	759851	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011750	AAAAT	2	10	783872	783881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011750	GTAAC	2	10	784726	784735	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011750	GAGTA	2	10	785324	785333	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011750	ACATA	2	10	821204	821213	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011750	CAAAA	2	10	832980	832989	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011750	TATAT	2	10	837714	837723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011750	CAGGG	2	10	863771	863780	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011750	AGTAA	2	10	875631	875640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011750	GCATT	2	10	904506	904515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011750	GAGTA	2	10	919951	919960	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011750	ATTTT	2	10	936543	936552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011750	GCGTT	2	10	952576	952585	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011750	CCAAC	2	10	953330	953339	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_011750	GCCAG	2	10	953364	953373	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011750	CGCAG	2	10	954714	954723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_011750	GTGCA	2	10	955378	955387	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011750	TTTAA	2	10	964687	964696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011750	TCATT	2	10	978951	978960	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011750	AGAAA	2	10	986271	986280	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011750	AAAGC	2	10	1007069	1007078	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011750	CGTTG	2	10	1057610	1057619	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011750	AGTTA	2	10	1057686	1057695	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011750	TCCAT	2	10	1080419	1080428	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011750	ACCTG	2	10	1084173	1084182	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011750	CGAAT	2	10	1093146	1093155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011750	GCGTT	2	10	1093771	1093780	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011750	AGAGT	2	10	1094725	1094734	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011750	ATGAG	2	10	1097979	1097988	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011750	ATGTC	2	10	1110839	1110848	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011750	AATAC	2	10	1114815	1114824	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011750	CCTGA	2	10	1130091	1130100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_011750	TGACC	2	10	1130520	1130529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011750	CTGTT	2	10	1164806	1164815	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_011750	AAATA	2	10	1165616	1165625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011750	TTACA	2	10	1170160	1170169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011750	ATTTT	2	10	1172780	1172789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011750	TAAAG	2	10	1182927	1182936	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011750	TTCTG	2	10	1210786	1210795	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011750	CGCTA	2	10	1217356	1217365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011750	TTATT	2	10	1218213	1218222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011750	CAAAA	2	10	1227578	1227587	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011750	ACAAA	2	10	1253051	1253060	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011750	CTCTT	2	10	1294823	1294832	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011750	AATCG	2	10	1301759	1301768	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011750	GTATG	2	10	1312428	1312437	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011750	AAAAC	2	10	1326371	1326380	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011750	GTCAC	2	10	1327080	1327089	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011750	GGGGA	2	10	1332017	1332026	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011750	GTTCA	2	10	1361489	1361498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011750	CGAAT	2	10	1400509	1400518	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011750	AAATT	2	10	1402949	1402958	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011750	GAGAA	2	10	1404099	1404108	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011750	ATTTT	2	10	1415814	1415823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011750	CATTT	2	10	1415836	1415845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011750	TGCCA	2	10	1429138	1429147	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011750	TTCAC	2	10	1449570	1449579	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011750	GATTT	2	10	1450043	1450052	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011750	AAGAA	2	10	1456325	1456334	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011750	AAGCG	2	10	1471232	1471241	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011750	AAACA	2	10	1487504	1487513	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011750	AACCA	2	10	1520098	1520107	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_011750	TTAAT	2	10	1530289	1530298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011750	ACTTT	2	10	1534941	1534950	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_011750	AGCAT	2	10	1550972	1550981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_011750	TTATC	2	10	1628894	1628903	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_011750	TACTC	2	10	1779578	1779587	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
173	NC_011750	GTTTT	2	10	1791017	1791026	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_011750	TATCA	2	10	2714511	2714520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
285	NC_011750	ATCGC	2	10	2729585	2729594	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
286	NC_011750	ATTTT	2	10	2737894	2737903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011750	TACTC	2	10	2750489	2750498	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
288	NC_011750	CATAT	2	10	2753291	2753300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_011750	GTTCA	2	10	2757335	2757344	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_011750	CGCGG	2	10	2758935	2758944	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
291	NC_011750	TTATT	2	10	2759454	2759463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_011750	CTTCC	2	10	2759839	2759848	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
294	NC_011750	ACCAG	2	10	2759894	2759903	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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299	NC_011750	GTTAA	2	10	2816762	2816771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011750	CTGGT	2	10	2827229	2827238	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
301	NC_011750	AGCAA	2	10	2827294	2827303	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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303	NC_011750	GCATC	2	10	2835759	2835768	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_011750	GCTTG	2	10	3552286	3552295	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
403	NC_011750	TAAAC	2	10	3552543	3552552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
404	NC_011750	ACATT	2	10	3552933	3552942	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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406	NC_011750	TGAAT	2	10	3556212	3556221	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
407	NC_011750	GAGTA	2	10	3557282	3557291	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
408	NC_011750	AAGGT	2	10	3560622	3560631	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_011750	GTTGT	2	10	3699472	3699481	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
421	NC_011750	GTTCA	2	10	3723829	3723838	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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423	NC_011750	TCTTT	2	10	3742826	3742835	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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