MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli UMN026 plasmid p1ESCUM

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011749	CAGG	2	8	44	51	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011749	AGTG	2	8	1140	1147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011749	CTGT	2	8	1186	1193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011749	TTTG	2	8	2163	2170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011749	CATG	2	8	2465	2472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011749	AAAT	2	8	2570	2577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011749	TTAC	2	8	2590	2597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011749	ATTT	2	8	4235	4242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011749	CATC	2	8	4407	4414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011749	ATGA	2	8	4479	4486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011749	AATG	2	8	4566	4573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011749	AGTA	2	8	5088	5095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011749	AAAT	2	8	5344	5351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011749	ATAC	2	8	13630	13637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011749	GCCA	2	8	15537	15544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011749	CCTG	2	8	15600	15607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011749	CTTG	2	8	15650	15657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011749	CAGA	2	8	16030	16037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011749	GCCC	2	8	16062	16069	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_011749	GTAA	2	8	16087	16094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011749	CCAC	2	8	16101	16108	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_011749	TTCC	2	8	16266	16273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011749	TCTT	2	8	16343	16350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011749	GGAT	2	8	16964	16971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011749	ACAA	2	8	17434	17441	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011749	ATTA	2	8	21235	21242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011749	ATTA	2	8	23059	23066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011749	GAAT	2	8	23082	23089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011749	GCTT	2	8	23222	23229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011749	CGGC	2	8	23308	23315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011749	CCAG	2	8	23976	23983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011749	GTTT	2	8	24033	24040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011749	GTAC	2	8	24121	24128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011749	ATTT	2	8	24462	24469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011749	ATCT	2	8	24747	24754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011749	AGAA	2	8	25106	25113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011749	GGAA	2	8	27716	27723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011749	TTAC	2	8	27895	27902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011749	GGGC	2	8	27920	27927	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011749	GTCT	2	8	27951	27958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011749	GCAA	2	8	28331	28338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011749	CAGG	2	8	28382	28389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011749	GCTG	2	8	28443	28450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011749	AGGC	2	8	38241	38248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011749	GGCA	2	8	38300	38307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011749	TTCA	2	8	39161	39168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011749	TCTG	2	8	40079	40086	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011749	ATAG	2	8	43439	43446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011749	TGAT	2	8	50262	50269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011749	TCTG	2	8	50662	50669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011749	AATG	2	8	50705	50712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011749	GAGC	2	8	51909	51916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011749	AGAA	2	8	51919	51926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011749	GCCA	2	8	52108	52115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011749	TAAT	2	8	53288	53295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011749	ATGA	2	8	53539	53546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011749	TTCC	2	8	54483	54490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011749	ATTT	2	8	65399	65406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011749	ATTT	2	8	65430	65437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011749	CTCC	2	8	72630	72637	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_011749	ATTT	2	8	72656	72663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011749	TTAT	2	8	72676	72683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011749	ACAA	2	8	72902	72909	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011749	ACTG	2	8	72953	72960	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011749	TACA	2	8	73033	73040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011749	TAAT	2	8	90563	90570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011749	ATTT	2	8	91070	91077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011749	AAAT	2	8	91287	91294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011749	CAGT	2	8	93734	93741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011749	GCCC	2	8	94024	94031	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_011749	CAGT	2	8	98344	98351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011749	CAGT	2	8	99124	99131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011749	GCCC	2	8	99414	99421	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_011749	ACAG	2	8	99467	99474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011749	TGAC	2	8	102126	102133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011749	AAAT	2	8	102165	102172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011749	CAGT	2	8	102397	102404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011749	GGCA	2	8	102466	102473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011749	GCCC	2	8	102685	102692	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_011749	CCGT	2	8	103572	103579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011749	CCCG	2	8	104238	104245	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_011749	GCCC	2	8	106954	106961	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_011749	ATAC	2	8	110156	110163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011749	GCTG	2	8	114045	114052	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011749	TTAT	2	8	118372	118379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011749	AAAC	2	8	118428	118435	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011749	AATC	2	8	119249	119256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011749	ACCT	2	8	119388	119395	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011749	CATC	2	8	119699	119706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011749	GACA	2	8	119909	119916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011749	ATCA	2	8	120009	120016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011749	TATT	2	8	120017	120024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011749	AATT	2	8	120127	120134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011749	CGAC	2	8	121435	121442	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011749	AGAC	2	8	121872	121879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011749	ATGA	2	8	122066	122073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011749	AAGT	2	8	122217	122224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011749	TCAG	2	8	122289	122296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.