MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli S88 plasmid pECOS88

Total Repeats: 363

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011747	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011747	CAG	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011747	AAC	2	6	2271	2276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011747	TGC	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011747	TAC	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011747	TGA	3	9	3273	3281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011747	TGT	2	6	3420	3425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011747	GAC	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011747	TCT	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011747	AGG	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011747	CAT	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011747	GCA	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011747	GGT	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011747	TCC	2	6	5185	5190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011747	TAT	2	6	5212	5217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011747	TGT	2	6	5266	5271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011747	AGC	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011747	ATG	2	6	14590	14595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011747	GCA	2	6	14685	14690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011747	CCA	2	6	14693	14698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011747	TCT	2	6	14712	14717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011747	CAA	2	6	14750	14755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011747	GTC	2	6	14866	14871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011747	AGG	2	6	16179	16184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011747	GAG	2	6	16220	16225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011747	GCT	2	6	16246	16251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011747	ACT	2	6	16420	16425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011747	GCA	2	6	16487	16492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011747	CAA	2	6	16502	16507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011747	ATT	2	6	16534	16539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011747	ACT	2	6	20080	20085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011747	AAT	2	6	20115	20120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011747	ATG	2	6	20368	20373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011747	GTT	2	6	20794	20799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011747	CTG	2	6	20851	20856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011747	GTG	2	6	20869	20874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011747	GCA	2	6	20985	20990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011747	TAA	2	6	21785	21790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011747	TTC	2	6	21826	21831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011747	CTG	2	6	21868	21873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011747	GGT	2	6	21922	21927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011747	TTC	2	6	22693	22698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011747	TGA	2	6	22702	22707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011747	TGG	2	6	23349	23354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011747	GAT	2	6	23482	23487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011747	AAT	2	6	23734	23739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011747	TAG	2	6	23750	23755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011747	TAT	2	6	23801	23806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011747	ACT	2	6	23817	23822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011747	CGC	2	6	25545	25550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011747	ATC	2	6	25586	25591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011747	TGG	2	6	25805	25810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011747	GGA	2	6	25819	25824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011747	CAC	2	6	25894	25899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_011747	CTT	2	6	25962	25967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011747	GGT	2	6	26027	26032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011747	AGG	2	6	26053	26058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011747	TCC	2	6	26129	26134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011747	GAT	2	6	26153	26158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011747	ATC	2	6	26169	26174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011747	TGA	2	6	26247	26252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011747	ATC	2	6	26380	26385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011747	ACA	2	6	26513	26518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011747	TGT	2	6	26689	26694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011747	CTT	2	6	26706	26711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011747	CAA	2	6	26827	26832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011747	AAC	2	6	27005	27010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011747	ATC	2	6	27087	27092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011747	TGA	2	6	27165	27170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011747	GTT	2	6	27243	27248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011747	TAA	2	6	27256	27261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011747	TCC	2	6	27294	27299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_011747	TGC	2	6	27343	27348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011747	ATG	2	6	27368	27373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011747	CCT	2	6	27418	27423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011747	ACG	2	6	28200	28205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011747	ATT	2	6	28225	28230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011747	AAC	2	6	28285	28290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011747	ACT	2	6	28305	28310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011747	TGT	2	6	28320	28325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011747	TTG	2	6	30900	30905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011747	TTG	2	6	30986	30991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011747	ATA	2	6	31598	31603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011747	TTA	2	6	31619	31624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011747	AGT	2	6	32251	32256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011747	GAA	2	6	32290	32295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011747	CAG	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011747	AGC	2	6	32614	32619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011747	GTT	2	6	32685	32690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011747	TGA	2	6	33744	33749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011747	TGC	2	6	33809	33814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011747	GGC	2	6	34531	34536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011747	GCC	2	6	34540	34545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011747	GCC	2	6	35191	35196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011747	TTC	3	9	35348	35356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011747	CGC	2	6	35520	35525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011747	CGT	2	6	35614	35619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011747	GCG	2	6	35621	35626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011747	GCG	2	6	35822	35827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011747	CAG	3	9	35867	35875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011747	AGG	2	6	36022	36027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011747	CGC	2	6	36102	36107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011747	CCG	2	6	36200	36205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011747	GTG	2	6	36304	36309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011747	TGA	2	6	36384	36389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011747	GCC	2	6	36395	36400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011747	GGC	2	6	36409	36414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011747	TCC	2	6	37806	37811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011747	GGA	2	6	38427	38432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011747	CGC	2	6	38501	38506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011747	CTG	2	6	38528	38533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011747	TGA	2	6	38573	38578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011747	CTG	2	6	38611	38616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011747	TTC	3	9	38638	38646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011747	GCC	2	6	38826	38831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011747	CGT	2	6	38872	38877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011747	GCG	2	6	38879	38884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011747	GTT	2	6	38896	38901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011747	GCG	2	6	39081	39086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011747	GAT	2	6	39177	39182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011747	TAA	2	6	40238	40243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011747	CTG	2	6	42778	42783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011747	CGG	2	6	42791	42796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011747	GCA	3	9	44684	44692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011747	AAT	2	6	45864	45869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011747	ATT	2	6	45905	45910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011747	ATG	2	6	45953	45958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011747	GCT	2	6	46372	46377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011747	AAC	2	6	46424	46429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011747	GCG	2	6	46482	46487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011747	GCG	2	6	46856	46861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011747	GTT	2	6	46873	46878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011747	GCG	2	6	47058	47063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011747	GAT	2	6	47154	47159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011747	TGA	2	6	47488	47493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011747	TTG	2	6	47507	47512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011747	GTC	2	6	48488	48493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011747	TCA	2	6	48509	48514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011747	AGG	2	6	48566	48571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011747	AAT	2	6	49254	49259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.